ESTABILIDAD DE PROTEINAS: PRINCIPIOS BASICOS DE LOS ESTADOS (PARCIALMENTE) DESPL...
ESTABILIDAD DE PROTEINAS: PRINCIPIOS BASICOS DE LOS ESTADOS (PARCIALMENTE) DESPLEGADOS Y ESTUDIOS MOLECULARES EN ENFERMEDADES CONFORMACIONALES
ES PRECISO COMPRENDER EN PROFUNDIDAD LOS PRINCIPIOS QUE GOBIERNAN LA ESTABILIDAD DE LAS PROTEINAS PARA PODER APLICAR METODOS CUANTITATIVOS A LA DESCRIPCION Y CONTROL DE LOS FENOMENOS BIOLOGICOS Y TECNOLOGICOS EN LOS QUE DICHA ESTA...
ES PRECISO COMPRENDER EN PROFUNDIDAD LOS PRINCIPIOS QUE GOBIERNAN LA ESTABILIDAD DE LAS PROTEINAS PARA PODER APLICAR METODOS CUANTITATIVOS A LA DESCRIPCION Y CONTROL DE LOS FENOMENOS BIOLOGICOS Y TECNOLOGICOS EN LOS QUE DICHA ESTABILIDAD DESEMPEÑA UN PAPEL CLAVE,UN PROBLEMA ACUCIANTE ES EL POBRE CONOCIMIENTO DE LAS CONFORMACIONES NO NATIVAS, COMO LOS INTERMEDIARIOS PARCIALMENTE DESPLEGADOS, LOS DOMINIOS INTRINSECAMENTE DESPLEGADOS Y EL CONJUNTO DE CONFORMACIONES QUE DENOMINAMOS "ESTADO DESPLEGADO", SU ESTUDIO EXIGE DESARROLLAR Y COMBINAR NUEVAS METODOLOGIAS COMPUTACIONALES Y EXPERIMENTALES, SON OBJETIVOS DEL PROYECTO:1-DESARROLLAR UN MODELO ESTRUCTURAL Y ENERGETICO REALISTA DEL "ESTADO DESPLEGADO" DE LAS PROTEINAS QUE PERMITA CALCULAR LA PROPIEDAD TERMODINAMICA, DH DE PLEGAMIENTO, COMO PRIMER PASO HACIA EL CALCULO DE LA ESTABILIDAD (DG),2-DETERMINAR SI LAS REGIONES LOCALMENTE INESTABLES DE LAS PROTEINAS, RELACIONADAS CON FUNCION Y CON APARICION DE INTERMEDIARIOS CINETICOS Y DE EQUILIBRIO, ESTAN CODIFICADAS DE FORMA SINERGICA POR UBICACION DE CARACTERISTICAS FISICOQUIMICAS DESESTABILIZANTES (LIPS) EN LUGARES FACILMENTE DEFORMABLES POR RAZONES TOPOLOGICAS,3-ESTABLECER EL PAPEL DE LAS REGIONES DESESTRUCTURADAS DE UNA PROTEINA MODULAR: LA DIANA TERAPEUTICA MECP2, EN SU ESTABILIDAD E INTERACCIONES CON DNA, Y SU RESPUESTA A CAMBIOS EN LA CONCENTRACION DE LIGANDOS ESPECIFICOS Y NO ESPECIFICOS,POR OTRA PARTE, LA ESTABILIDAD DE MUCHAS PROTEINAS SE PUEDE VER INFLUIDA DRASTICAMENTE POR CAMBIOS EN LAS CONCENTRACIONES CELULARES O EXTRACELULARES DE DETERMINADOS IONES, LA CELULA PODRIA UTILIZAR ESTOS CAMBIOS PARA REGULAR REVERSIBLEMENTE LA FUNCION DE ALGUNAS PROTEINAS INDUCIENDO SU PLEGAMIENTO O DESPLEGAMIENTO, SON OBJETIVOS DEL PROYECTO:4-COMPRENDER LA SECUENCIA DE EVENTOS QUE CONDUCEN A LIBERAR LAS LIPOPROTEINAS DE BAJA DENSIDAD (LDL) EN EL ENDOSOMA Y SU RELACION CON LOS CAMBIOS EN LAS CONCENTRACIONES DE CA++ E H+ QUE GOBIERNAN LA ESTABILIDAD DEL RECEPTOR DE LDL Y DE SU COMPLEJO CON LAS MISMAS,5-IDENTIFICAR NUEVOS INHIBIDORES ALOSTERICOS DE LA PROTEASA NS3 DEL VIRUS DE LA HEPATITIS C QUE BLOQUEEN SU FUNCION AL ESTABILIZAR LA CONFORMACION INACTIVA PARCIALMENTE DESPLEGADA, MAYORITARIA A BAJA CONCENTRACION DE ZN++,FINALMENTE, LAS MUTACIONES QUE DESESTABILIZAN LAS PROTEINAS HUMANAS PUEDEN CAUSAR ENFERMEDADES CONFORMACIONALES TALES COMO LA FENILCETONURIA O EL SINDROME DE RETT, SU COMBATE EXIGE CONOCER LAS CONSECUENCIAS DEL DEFECTO MOLECULAR Y DESARROLLAR CHAPERONAS FARMACOLOGICAS QUE RESTAUREN LA ACTIVIDAD PERDIDA, SON OBJETIVOS DEL PROYECTO:6-ANALIZAR LA COMPLEJA RUTA DE PLEGAMIENTO DE LA ENZIMA FENILALANINA HIDROXILASA Y DETERMINAR SI LAS CHAPERONAS QUE ESTABILIZAN SU ESTRUCTURA ACELERAN EL PLEGAMIENTO, DISMINUYENDO LA AGREGACION DE INTERMEDIARIOS TRANSITORIOS,7-DETERMINAR SI DIVERSAS MUTACIONES DESESTABILIZANTES CAUSANTES DE UN MISMO FENOTIPO (FENILCETONURIA MODERADA) RESPONDEN DE FORMA DIFERENTE A DISTINTAS CHAPERONAS, PARA EXPLORAR LA POSIBILIDAD DE TERAPIAS INDIVIDUALIZADAS,8-IDENTIFICAR CHAPERONAS FARMACOLOGICAS QUE CONTRARRESTEN EL EFECTO DELETEREO DE MUTACIONES DE LA PROTEINA MECP2 ASOCIADAS AL SINDROME DE RETT,LOS RESULTADOS ESPERADOS SON MODELOS DE LOS ESTADOS TOTAL O PARCIALMENTE DESPLEGADOS DE LAS PROTEINAS, CONOCIMIENTO MECANISTICO CUANTITATIVO DE PROCESOS CELULARES REGULADOS POR DESPLEGAMIENTO REVERSIBLE DE PROTEINAS Y DESARROLLO Y MEJORA DE CHAPERONAS FARMACOLOGICAS PARA DOS ENFERMEDADES CONFORMACIONALES RARAS, ESTABILIDAD Y PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS\ INTERACCIÓN PROTEÍNA/LIGANDO\ ENFERMEDADES CONFORMACIONALES\ SIMULACIONES DE DINÁMICA MOLECULAR\RECEPTOR DE LDL\ PROTEASA NS3\ MECP2\ FAHver más
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