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BFU2010-16297

Financiado
ESTABILIDAD CONFORMACIONAL DE PROTEINAS: PRINCIPIOS GENERALES, ANALISIS ESTABILI...
ESTABILIDAD CONFORMACIONAL DE PROTEINAS: PRINCIPIOS GENERALES, ANALISIS ESTABILIDAD FUNCION DEL R-LDL Y BUSQUEDA DE NUEVAS CHAPERONAS FARMACOLOGICAS. LA FUNCION BIOLOGICA DE LAS PROTEINAS SE EJERCE A TRAVES DE LAS INTERACCIONES QUE ESTABLECEN CON OTRAS MOLECULAS, EN ESAS INTERACCIONES, ADEMAS DEL ESTADO NATIVO, PUEDEN PARTICIPAR CONFORMACIONES PARCIALMENTE DESPLEGADAS O INCLUSO... LA FUNCION BIOLOGICA DE LAS PROTEINAS SE EJERCE A TRAVES DE LAS INTERACCIONES QUE ESTABLECEN CON OTRAS MOLECULAS, EN ESAS INTERACCIONES, ADEMAS DEL ESTADO NATIVO, PUEDEN PARTICIPAR CONFORMACIONES PARCIALMENTE DESPLEGADAS O INCLUSO EL PROPIO ESTADO DESPLEGADO, LAS DISTINTAS CONFORMACIONES ACCESIBLES A UNA PROTEINA CONFORMAN SU PAISAJE DE ENERGIA, QUE ES NECESARIO CONOCER TANTO POR SU POTENCIAL IMPORTANCIA FUNCIONAL COMO POR APORTAR INFORMACION VALIOSA PARA COMPRENDER EL PLEGAMIENTO DE LAS PROTEINAS, EN LOS PAISAJES DE ENERGIA TAMBIEN PUEDEN APARECER CONFORMACIONES INACTIVAS RELACIONADAS CON PATOLOGIAS, EN ALGUNOS CASOS SON CONFORMACIONES, EN PRINCIPIO MENOS ESTABLES QUE EL ESTADO NATIVO, QUE RESULTAN ESTABILIZADAS A CAUSA DE UNA MUTACION Y ORIGINA LA PERDIDA DE LA FUNCION, EN OTROS CASOS SON CONFORMACIONES MAS ESTABLES, AGREGADOS POCO ACCESIBLES DESDE EL PUNTO DE VISTA CINETICO QUE, AL POBLARSE, PUEDEN ORIGINAR GANANCIA DE FUNCIONES TOXICAS,EN ESTE PROYECTO CONCLUIREMOS LA DESCRIPCION CLASICA DEL PAISAJE DE ENERGIA DE FLAVODOXINAS MEDIANTE EL ESTUDIO DE DOS CONFORMACIONES PARCIALMENTE DESPLEGADAS DE LA APOFLAVODOXINA DE HELICOBACTER PYLORI, CERRANDO ASI NUESTRO CICLO DE ESTUDIOS DE ESTRUCTURA/ESTABILIDAD Y PLEGAMIENTO DE FLAVODOXINAS, Y COMENZAREMOS ESTUDIOS CON TECNICAS DE MOLECULA UNICA, EL ENFASIS DE NUESTROS ESTUDIOS SE DESPLAZA EN ESTE PROYECTO A UNA PROTEINA DE MAYOR COMPLEJIDAD, EL RECEPTOR DE LIPOPROTEINAS DE BAJA DENSIDAD (R-LDL), EN CUYO MECANISMO DE LIBERACION DE LDLS EN EL ENDOSOMA HEMOS PROPUESTO QUE PARTICIPAN CONFORMACIONES QUE SE DESPLIEGAN REVERSIBLEMENTE, ANALIZAREMOS, EN ESPECIAL, LA RELEVANCIA FISIOLOGICA DEL AUTOCOMPLEJO FORMADO ENTRE EL DOMINIO -PROPELLER Y EL TANDEM DE MODULOS LR 4 Y 5 DEL DOMINIO DE UNION A LDL, A LA LUZ DE LOS CAMBIOS DE ESTABILIDAD Y AFINIDAD POR IONES QUE EXPERIMENTAN EN EL TRANSITO DE CONDICIONES EXTRACELULARES A ENDOSOMALES, UTILIZANDO NUESTRA EXPERIENCIA EN CRIBADO DE QUIMIOTECAS, IDENTIFICAREMOS CHAPERONAS MOLECULARES PARA RESCATAR LA FUNCION DE MUTANTES DEFECTUOSOS DE DOS PROTEINAS IMPLICADAS EN PATOLOGIAS POR PERDIDA DE FUNCION (EL PROPIO R-LDL Y PTEN) Y COMPUESTOS INHIBIDORES DE LA AGREGACION DE AMILINA, ASI MISMO PROFUNDIZAREMOS EN EL ESTUDIO DE PROCESOS DE RECONOCIMIENTO MOLECULAR PROTEINA/LIGANDO UTILIZANDO HERRAMIENTAS DE SIMULACION COMPUTACIONAL Y DESARROLLAREMOS DOS SERVIDORES DE INTERNET PARA PROPORCIONAR A LA COMUNIDAD ESTRUCTURAL NUEVAS HERRAMIENTAS DE ANALISIS BIOMOLECULAR BASADAS EN NUESTRAS INVESTIGACIONES BASICAS, LOS PRINCIPALES OBJETIVOS DEL PROYECTO SON:A)-COMPLETAR EL ANALISIS ESTRUCTURAL Y ENERGETICO DEL PAISAJE DE ENERGIA DE LAS FLAVODOXINA Y EVALUAR SU GENERALIDAD POR COMPARACION DEL PAISAJE DE DOS FLAVODOXINAS DISTINTAS,B)-ESCLARECER EL MECANISMO DE LIBERACION DE LDL EN EL ENDOSOMA DETERMINANDO LA IMPORTANCIA DE LOS CAMBIOS DE ESTABILIDAD Y AFINIDAD SUFRIDOS POR DISTINTOS DOMINIOS DEL R-LDL AL SER TRANSFERIDO DEL ESPACIO EXTRACELULAR AL ENDOSOMA,C)-IDENTIFICAR Y DESARROLLAR NUEVOS COMPUESTOS BIOACTIVOS RELACIONADOS CON TRES PATOLOGIAS HUMANAS UTILIZANDO PROCEDIMIENTOS DE CRIBADO MASIVO RELACIONADOS CON ESTABILIDAD CONFORMACIONAL, D)-ANALIZAR MECANISMOS DE RECONOCIENDO PROTEINA/LIGANDO MEDIANTE SIMULACIONES COMPUTACIONALES E IMPLEMENTAR SERVIDORES DE INTERNET DE INTERES EN BIOLOGIA ESTRUCTURAL, ver más
01/01/2010
UNIZAR
315K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2010-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 315K€
Líder del proyecto
UNIVERSIDAD DE ZARAGOZA. OFICINA DE TRANSFERE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Sin perfil tecnológico