DINAMICA DE CLUSTERES DE PROTEINAS Y FLUJO DE REDES
ES UNA CUESTION DE DEBATE SI LAS REACCIONES METABOLICAS SECUENCIALES Y OTROS PROCESOS INTRACELULARES COMPLEJOS EN SERIE SE EJECUTAN EFICIENTEMENTE POR PROTEINAS DISPERSAS EN UN AMBIENTE SATURADO, SI BIEN ALGUNOS INVESTIGADORES NO...
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Descripción del proyecto
ES UNA CUESTION DE DEBATE SI LAS REACCIONES METABOLICAS SECUENCIALES Y OTROS PROCESOS INTRACELULARES COMPLEJOS EN SERIE SE EJECUTAN EFICIENTEMENTE POR PROTEINAS DISPERSAS EN UN AMBIENTE SATURADO, SI BIEN ALGUNOS INVESTIGADORES NO CONSIDERAN NECESARIO QUE LAS ENZIMAS NECESITEN ESTAR CERCA PARA CANALIZAR EFICIENTEMENTE EL PRODUCTO DE REACCION DE UNA ENZIMA COMO SUSTRATO A LA SIGUIENTE, EVIDENCIAS RECIENTES APUNTAN A LA NOCION DE QUE, EN MUCHAS VIAS METABOLICAS, LAS ENZIMAS SECUENCIALES SE ORGANIZARIAN EN ENSAMBLAJES DE PROTEINAS, SIN EMBARGO, LA EXISTENCIA DE INTERACCIONES ESTABLES CERROJO-LLAVE QUE MANTIENEN UN GRAN NUMERO DE PROTEINAS JUNTAS PARA REALIZAR UN CONJUNTO DE PROCESOS O REACCIONES SECUENCIALES COMPLEJAS ES BASTANTE EXCEPCIONAL, BASADO EN NUESTRO TRABAJO PREVIO SOBRE LA DINAMICA A NIVEL DE MOLECULA UNICA DE DOS CHAPERONAS DE LEVADURA MUY IMPORTANTES, AQUI PLANTEAMOS LA HIPOTESIS DE QUE LA CANALIZACION FUNCIONAL EN LAS REDES DE PROTEINAS PODRIA SER IMPULSADA POR INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA MUY TRANSITORIAS Y CIERTAMENTE PROMISCUAS, NUESTROS DATOS PRELIMINARES SUGIEREN QUE DICHOS CLUSTERES DE PROTEINAS SE FORMARIAN Y DISOCIARIAN A VELOCIDADES MUY ELEVADAS, MUCHO MAYORES QUE LAS DE LOS ORGANULOS CARENTES DE MEMBRANA, UTILIZAREMOS ANALISIS DE FLUCTUACION DE MOLECULA UNICA PARA ESTUDIAR LA COINCIDENCIA ESPACIO-TEMPORAL DE 10000 PARES DE PROTEINAS INVOLUCRADAS EN RUTAS METABOLICAS Y DE SEÑALIZACION ESPECIFICAS, CON EL OBJETIVO DE VISUALIZAR POR PRIMERA VEZ LOS CLUSTERES MOLECULARES QUE SE SUPONE CONDUCEN LA CANALIZACION MOLECULAR, PARA CONFIRMAR LA EXISTENCIA DE ESTOS ENSAMBLAJES DINAMICOS DE PROTEINAS, APLICAREMOS UN ENFOQUE ORTOGONAL QUE HEMOS EMPEZADO A DESARROLLAR PARA CUANTIFICAR LAS FLUCTUACIONES LOCALES DE LOS CLUSTERES IN VIVO Y EN EXTRACTOS LIBRES DE CELULAS, LOS METODOS DE ETIQUETADO POR PROXIMIDAD DE ALTO RENDIMIENTO NOS PERMITIRAN ANALIZAR MAS A FONDO LA ESPECIFICIDAD Y LA COMPOSICION DE LOS CLUSTERES IDENTIFICADOS, FINALMENTE, USAREMOS EL ARSENAL DE HERRAMIENTAS DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR QUE OFRECE LA LEVADURA DE GEMACION PARA ESTUDIAR LA RELEVANCIA DE LA IDENTIDAD DE LOS CLUSTERES PROTEICOS EN LA EFICIENCIA FUNCIONAL DE LAS RUTAS Y REDES MAS PARADIGMATICAS, RED MOLECULAR\CLUSTER DE PROTEINAS\FLUJO FUNCIONAL\INTERACCION DINAMICA
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