ENTENDIENDO LAS BASES DE LOS ENCUENTROS INESPERADOS: PRIMERAS INTERACCIONES DE F...
ENTENDIENDO LAS BASES DE LOS ENCUENTROS INESPERADOS: PRIMERAS INTERACCIONES DE FACTORES DE TRANSCRIPCION EN CONTEXTOS GENOMICOS ECTOPICOS
LA APARICION DE NUEVAS ENTIDADES MOLECULARES EN LOS ORGANISMOS VIVOS, COMO EL ORIGEN DE NUEVOS GENES, NUEVAS PROTEINAS Y NUEVAS ARQUITECTURAS PROTEINICAS, SUCEDE FRECUENTEMENTE DE MANERA REPENTINA. DE ESTE MODO, SE GENERAN NUEVAS...
LA APARICION DE NUEVAS ENTIDADES MOLECULARES EN LOS ORGANISMOS VIVOS, COMO EL ORIGEN DE NUEVOS GENES, NUEVAS PROTEINAS Y NUEVAS ARQUITECTURAS PROTEINICAS, SUCEDE FRECUENTEMENTE DE MANERA REPENTINA. DE ESTE MODO, SE GENERAN NUEVAS INTERACCIONES ENTRE ESTAS ENTIDADES MOLECULARES RECIEN ORIGINADAS Y EL ENTORNO CELULAR DEL ORGANISMO EN EL QUE APARECEN. ESTO ES LO QUE DENOMINAMOS "ENCUENTROS MOLECULARES INESPERADOS" E "INTERACCIONES MOLECULARES INICIALES". ESTAS INTERACCIONES INESPERADAS SON UN ASPECTO ESENCIAL DE LA EVOLUCION BIOLOGICA, EL PUNTO DE PARTIDA COMUN PARA EL CAMBIO EVOLUTIVO. SIN EMBARGO, ESTOS EVENTOS INICIALES DE LA EVOLUCION HAN RECIBIDO POCA ATENCION, EN PARTE PORQUE NO PUEDEN SER ESTUDIADAS A POSTERIORI: SOLO PODEMOS INVESTIGAR AQUELLOS ENCUENTROS MOLECULARES QUE TUVIERON EXITO Y SOBREVIVIERON, MIENTRAS QUE TODOS LOS ENCUENTROS INESPERADOS QUE FUERON ELIMINADOS AL POCO TIEMPO DE SURGIR, QUE CON TODA PROBABILIDAD SERIAN LA GRAN MAYORIA DE LOS CASOS, PERMANECEN INEXPLORADOS. PARA SOLUCIONAR ESTO, EN LUGAR DE ESTUDIAR EVENTOS OCURRIDOS DE MANERA NATURAL, EN EL LABORATORIO GENERAMOS ENCUENTROS INESPERADOS DE MANERA ARTIFICIAL, PONIENDO EN CONTACTO ESTRUCTURAS MOLECULARES QUE NUNCA ANTES HABIAN INTERACTUADO. EN PARTICULAR, EXPRESAMOS FACTORES DE TRANSCRIPCION (TFS) ESPECIFICOS DE CIERTOS LINAJES EN ENTORNOS DE CROMATINA AJENOS A ELLOS, EN ESPECIES HETEROLOGAS. DE ESTE MODO PODEMOS OBSERVAR LOS MOMENTOS INICIALES EN LOS QUE SE PRODUCE EL ENCUENTRO, ANTES DE QUE ESTAS INTERACCIONES PRIMIGENIAS DESAPAREZCAN O SEAN MODIFICADAS DURANTE LA EVOLUCION. USANDO ESTE ENFOQUE, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES IDENTIFICAR LOS FACTORES Y PROPIEDADES MOLECULARES MAS IMPORTANTES QUE GOBIERNAN LAS INTERACCIONES INESPERADAS. PRIMERO, EN EL OBJETIVO 1 IDENTIFICAREMOS QUE PROPIEDADES MOLECULARES DE LOS TFS SON MAS IMPORTANTES PARA SUS INTERACCIONES INICIALES: ESTUDIAREMOS UN AMPLIO CONJUNTO DE 30 TFS DE PLANTAS, CON DISTINTAS CARACTERISTICAS MOLECULARES, DURANTE SU ENCUENTRO INESPERADO CON CELULAS DE MAMIFEROS. LUEGO, EN EL OBJETIVO 2 ABORDAREMOS LAS INTERACCIONES INESPERADAS DESDE LA PERSPECTIVA DEL ENTORNO DE LA CROMATINA: INVESTIGAREMOS EL IMPACTO DE MODIFICAR LA ACCESIBILIDAD DE LA CROMATINA TRATANDO EMBRIONES DE PEZ CEBRA QUE EXPRESAN TFS DE MAMIFEROS Y PLANTAS CON INHIBIDORES DE HISTONA DEACETILASAS. FINALMENTE, EN EL OBJETIVO 3 INVESTIGAREMOS COMO EN UNA PROTEINA DE UNION AL ADN, LA EVOLUCION DE UNION A SECUENCIAS ESPECIFICAS PODRIA DEPENDER DE SU ENTORNO GENOMICO: ESTUDIAREMOS LA INTERACCION ENTRE LA PROTEINA CTCF DE HUMANOS Y EL GENOMA DE LEVADURAS. DE MANERA GENERAL, NUESTROS RESULTADOS MOSTRARAN COMO ESTRUCTURAS BIOLOGICAS QUE NO HAN CO-EVOLUCIONADO JUNTAS, PUEDEN MOSTRAR A PESAR DE ELLO UNA CAPACIDAD INHERENTE PARA INTERACTUAR E INTERPRETARSE MUTUAMENTE. DE ESTA MANERA, DURANTE LA EVOLUCION, ESTOS PATRONES DE INTERACCIONES INICIALES CONSTITUIRIAN LA SEMILLA O PUNTO DE PARTIDA PARA EL RESTO DE SU PROCESO CO-EVOLUTIVO. ASI, NUESTRO PROYECTO, ABRIRA NUEVAS VIAS POR LAS QUE AL APLICAR ESTAS IDEAS E HIPOTESIS PIONERAS SE AYUDARA A CONCEBIR FUTURAS LINEAS DE INVESTIGACION. NFORMACION BIOLOGICA\INTERPRETACION\FACTOR DE TRANSCRIPCION\CROMATINA\REGULACION GENICA\EVOLUCIONver más
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