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BFU2017-89488-P

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ESCANEO MASIVO DE MUTACIONES EN LAS INTERFACES DE INTERACCION ENTRE PROTEINAS EN...

ESCANEO MASIVO DE MUTACIONES EN LAS INTERFACES DE INTERACCION ENTRE PROTEINAS EN GENETICA HUMANA ASI COMO EN BIOLOGIA SINTETICA, ESTRUCTURAL Y EVOLUTIVA. UNA MUTACION PUEDE SER LA CAUSA DE UNA ENFERMEDAD EN UN INDIVIDUO PERO NO EN OTRO, UNA RAZON PARA ESTO ES LA EPISTASIS - LA DEPENDENCIA DEL RESULTADO DE UNA MUTACION CON UNA VARIACION ADICIONAL DE UN GENOMA, ENTENDER LA EPISTASIS... ver más

01/01/2017

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454K€

Presupuesto del proyecto: 454K€

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TRL 4-5 | 50K€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

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TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 454K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto UNA MUTACION PUEDE SER LA CAUSA DE UNA ENFERMEDAD EN UN INDIVIDUO PERO NO EN OTRO, UNA RAZON PARA ESTO ES LA EPISTASIS - LA DEPENDENCIA DEL RESULTADO DE UNA MUTACION CON UNA VARIACION ADICIONAL DE UN GENOMA, ENTENDER LA EPISTASIS ES MUY IMPORTANTE EN MUCHOS CAMPOS DE LA BIOLOGIA AUNQUE HASTA EL MOMENTO SOLO SE HAN DESARROLLADO HERRAMIENTAS EXPERIMENTALES Y ANALITICAS A NIVEL DE UN SIMPLE NUCLEOTIDO, PARA CARACTERIZAR SISTEMATICAMENTE INTERACCIONES DENTRO DE LA MISMA MOLECULA, SIN EMBARGO, SI UNA MUTACION EN UN DETERMINADO GEN ES LA CAUSA DE UNA ENFERMEDAD, ESTE EFECTO PODRIA SER COMPENSADO POR OTRA MUTACION EN UNO DE SUS INTERACTORES, LA EPISTASIS ENTRE MOLECULAS PUEDE SER ENTONCES LA CLAVE PARA ENTENDER COMO LA SUSCEPTIBILIDAD A CONTRAER UNA ENFERMEDAD VARIA ENTRE INDIVIDUOS ASI COMO LA CO-EVOLUCION DE GENES DENTRO DE UN GENOMA, EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES DESARROLLAR UN NUEVO METODO BASADO EN LA SECUENCIACION PROFUNDA, LLAMADO DEEPPCA PARA CUANTIFICAR EXHAUSTIVAMENTE COMO LA INTERACCION ENTRE PROTEINAS QUE INTERACTUAN FISICAMENTE VIENE AFECTADA SEGUN VARIEN SUS AMINOACIDOS, EL SEGUNDO OBJETIVO ES USAR ESTE METODO PARA CONSTRUIR EL PRIMER MAPA CASI COMPLETO DE INTERACCIONES ENTRE MUTACIONES DENTRO DE LA MISMA PROTEINA (CIS) O ENTRE DOS PROTEINAS (TRANS) QUE INDIQUE COMO UNA FUNCION MOLECULAR VIENE AFECTADA, EL TERCER OBJETIVO ES COMPARAR COMO LA FUERZA Y LA ESPECIFICIDAD DE UNION ENTRE MULTIPLES PROTEINAS RELACIONADAS ENTRE SI SON AFECTADAS POR MUTACIONES, ASI COMO EMPLEAR EL METODO PARA DESARROLLAR MODULOS ORTOGONALES DE INTERACCION ENTRE PROTEINAS QUE PUEDAN SER USADOS EN BIOLOGIA SINTETICA, EL CUARTO OBJETIVO ES USAR ESTE METODO PARA EXPLORAR LA IMPORTANCIA DE EPISTASIS DE MAS ALTO NIVEL, POR EJEMPLO, PARA CUANTIFICAR SI INTERACCIONES ENTRE MAS DE DOS MUTACIONES SE TIENEN QUE TENER EN CUENTA A LA HORA DE PREDECIR CON EXACTITUD VARIACIONES EN FENOTIPOS PARTIENDO DE UN GENOTIPO, ADEMAS DE PROPORCIONAR UNA VISION DE LA RELACION ENTRE LA ESTRUCTURA DE PROTEINAS Y LA EVOLUCION, ESTE PROYECTO PROPORCIONARA DATOS Y METODOS COMPUTACIONALES QUE MEJORARAN NUESTRA HABILIDAD PARA PREDECIR LAS CONSECUENCIAS DE UNA MUTACION DE LA QUE HASTA AHORA NO SE CONOCIA EL SIGNIFICADO, LO QUE ES UN RETO FUNDAMENTAL DE LA GENETICA DE ENFERMEDADES HUMANAS ASI COMO DE LA MEDICINA PERSONALIZADA, PERSONALISED MEDICINE\GENOMICS\PROTEIN INTERACTIONS\SYSTEMS BIOLOGY\NEXT GENERATION SEQUENCING

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