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PGC2018-099392-A-I00

Financiado

EVOLUCION DE LA REGULACION GENICA EN LA ZONA CERO: DESVELANDO PRINCIPIOS GENERAL...

EVOLUCION DE LA REGULACION GENICA EN LA ZONA CERO: DESVELANDO PRINCIPIOS GENERALES DE LOS MOMENTOS INICIALES DE LAS INTERACCIONES REGULADORES EN CIS LAS ENTIDADES BIOLOGICAS, YA SEAN PROTEINAS, BALLENAS, ORGANOS SENSORIALES O ELEMENTOS CIS-REGULADORES INTERACCIONAN CONTINUAMENTE CON OTRAS ESTRUCTURAS, FORMANDO REDES COMPLEJAS EN LAS QUE FLUYE LA INFORMACION, ESTAS REDES SON EN... ver más

01/01/2018

CSIC

127K€

Presupuesto del proyecto: 127K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 127K€

Descripción del proyecto LAS ENTIDADES BIOLOGICAS, YA SEAN PROTEINAS, BALLENAS, ORGANOS SENSORIALES O ELEMENTOS CIS-REGULADORES INTERACCIONAN CONTINUAMENTE CON OTRAS ESTRUCTURAS, FORMANDO REDES COMPLEJAS EN LAS QUE FLUYE LA INFORMACION, ESTAS REDES SON ENSAMBLADAS DURANTE EL CURSO DE LA EVOLUCION, PERO, ¿QUE OCURRE CUANDO NUEVOS ELEMENTOS SE INCORPORAN POR PRIMERA VEZ A UN SISTEMA BIOLOGICO YA EXISTENTE? ¿COMO SE INTEGRAN ESTOS NUEVOS ELEMENTOS Y ESTABLECEN INICIALMENTE INTERACCIONES CON SUS NUEVOS 'COLABORADORES'?HASTA AHORA, LAS NOVEDADES EVOLUTIVAS SE HAN ESTUDIADO INVESTIGANDO EVENTOS EVOLUTIVOS EXITOSOS QUE HAN SIDO SELECCIONADOS Y CONSOLIDADOS, POR EL CONTRARIO, LA FASE PREVIA DE "TIEMPO CERO", ANTES DE QUE LAS NOVEDADES SEAN FINALMENTE ESTABLECIDAS, ESTA SIN EXPLORAR, Y AUN ASI, LAS NOVEDADES MOLECULARES, COMO LA APARICION DE NUEVOS FACTORES DE TRASCRIPCION DEBIDO A SHUFFLING EXONICO DE DOMINIOS PROTEICOS O POR RECLUTAMIENTO DE EXONES CODIFICANTES DE ELEMENTOS MOVILES, PUEDE A VECES OCURRIR RAPIDAMENTE, DANDO LUGAR A PRIMEROS ENCUENTROS EN LOS CUALES UNA ENTIDAD MOLECULAR DADA TIENE QUE ENFRENTARSE A UN AMBIENTE MOLECULAR HASTA ENTONCES 'DESCONOCIDO', PERO, EN ESTOS PRIMEROS ENCUENTROS DE LAS INNOVACIONES DE REGULACION GENICA, ¿SON LAS INTERACCIONES INICIALES SIMPLEMENTE AZAROSAS? ¿PUEDE EL RESULTADO DE UNA RECIEN ESTABLECIDA INTERACCION MOLECULAR SER DESCRITO SIMPLEMENTE COMO RUIDO?LOS SISTEMAS BIOLOGICOS, COMO POR EJEMPLO UN AMBIENTE NUCLEAR DE CROMATINA, ESTAN LEJOS DEL AZAR: SE ENCUENTRAN FUERTEMENTE ORGANIZADOS CON GRADOS MUY DIFERENTES DE ACCESIBILIDAD, CAPACIDADES DE INTERACCION, ESTABILIDAD, ETC, POR TANTO, LA PRINCIPAL HIPOTESIS DE FIREIN ES QUE, EN LA EVOLUCION, LOS PRIMEROS ENCUENTROS MUESTRAN PATRONES DE INTERACCIONES COHERENTES E IDENTIFICABLES, NUESTRO OBJETIVO ES ESTUDIAR LAS CAPACIDADES INHERENTES DE LAS ESTRUCTURAS MOLECULARES PARA INTERPRETAR Y LEER LA INFORMACION CONTENIDA EN OTROS SISTEMAS BIOLOGICOS, INCLUSO CUANDO ESOS SISTEMAS NO HAN CO-EVOLUCIONADO JUNTOS Y SON EXTRAÑOS A DICHAS ESTRUCTURAS, ASI, PONDREMOS ARTIFICIALMENTE EN CONTACTO ESTRUCTURAS MOLECULARES DIFERENTES QUE NUNCA HAN SOLAPADO ANTERIORMENTE GENERANDO POR PRIMERA VEZ ENCUENTROS DE REGULACION GENICA QUE CARACTERIZAREMOS UTILIZANDO DISTINTOS METODOS GENOMICOS (ATAC-SEQ, CHIP-SEQ, 4C-SEQ Y RNA-SEQ) Y TRES MODELOS DISTINTOS (PEZ ZEBRA, EMBRIONES DE DROSOPHILA Y LINEAS CELULARES), COMBINAREMOS FACTORES DE TRANSCRIPCION MUY DIVERGENTES ESPECIFICOS DE MAMIFEROS CON AMBIENTES DE CROMATINA DE PEZ ZEBRA Y DROSOPHILA (OBJETIVO 1), DOMINIOS DE UNION A DNA ESPECIFICOS DE PLANTAS CON CONTEXTOS GENOMICOS DE ANIMALES (OBJETIVO 2) Y PAISAJES REGULADORES DE GENES DEL DESARROLLO CON VECINDADES GENOMICAS ECTOPICAS (OBJETIVO 3), ESTOS OBJETIVOS LLENARAN UN IMPORTANTE HUECO EN EL CONOCIMIENTO, DANDO UNA NUEVA VISION DE LOS ESTADIOS INICIALES DE LAS NOVEDADES REGULADORAS Y EL MODO EN EL QUE SE ENSAMBLAN E INCORPORAN EN REDES COHERENTES, ADEMAS, FIREIN CONTRIBUIRA AL ESTUDIO DE LA INFORMACION EN LOS SISTEMAS BIOLOGICOS GENERANDO UN NUEVO MARCO TEORICO ESPECIFICO PARA LA BIOLOGIA: UNA VISION COMPLETAMENTE NUEVA PARA PREGUNTAS HASTA AHORA EXCLUSIVAMENTE CONCEBIDAS DESDE LA CIBERNETICA Y LA TEORIA DE LA INFORMACION, ASI, FIREIN RESPONDERA CUESTIONES FUNDAMENTALES, NO SOLO PARA LA REGULACION GENICA Y LAS NOVEDADES EVOLUTIVAS MOLECULARES, SINO PARA LA BIOLOGIA EN SU CONJUNTO, INCLUYENDO TAMBIEN ENCUENTROS MOLECULARES COMO LOS OCASIONADOS POR MUTACIONES CAUSANTES DE ENFERMEDADES GENETICAS, INFORMACIÓN BIOLÓGICA\EVOLUCIÓN\REGULACIÓN GÉNICA\CROMATINA\FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN\PAISAJE REGULADOR\INTERPRETACIÓN

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