Descripción del proyecto
EL ASMA ES UNA ENFERMEDAD INFLAMATORIA CRONICA DE LAS VIAS RESPIRATORIAS CARACTERIZADA POR LA OBSTRUCCION REVERSIBLE DEL FLUJO AEREO Y UNA RESPUESTA BRONQUIAL EXAGERADA FRENTE A DIVERSOS ESTIMULOS, SI BIEN LA APARICION DE LOS SINTOMAS ASMATICOS PUEDE ESTAR CONTROLADA, MUCHOS PACIENTES PUEDEN PRESENTAR ATAQUES O CRISIS ASMATICAS DENOMINADAS EXACERBACIONES, QUE PUEDEN LLEGAR A PONER EN PELIGRO SU VIDA, LAS EXACERBACIONES ASMATICAS SON LA PRINCIPAL CAUSA DEL COSTE ECONOMICO DEL ASMA Y DE LA REDUCCION DE LA CALIDAD DE VIDA DE LOS PACIENTES, SE HA DESCRITO QUE LAS EXACERBACIONES ASMATICAS ESTAN CAUSADAS POR UNA COMBINACION DE COMPONENTES AMBIENTALES Y GENETICOS, PERO AUN SE HA IDENTIFICADO NINGUN FACTOR QUE PERMITA LOGRAR UNA BUENA PREDICCION DE LAS MISMAS, LA EPIGENETICA SUPONE UN PUNTO DE CONEXION ENTRE AMBOS COMPONENTES, ENGLOBANDO TODOS AQUELLOS PROCESOS QUE MODIFICAN LA EXPRESION GENICA SIN ALTERAR LA SECUENCIA DEL ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (ADN), SIENDO LA METILACION DEL ADN LA MODIFICACION EPIGENETICA MAS ESTUDIADA, PESE A QUE SE HA DEMOSTRADO LA IMPLICACION DE LA METILACION DEL ADN EN LA SUSCEPTIBILIDAD AL ASMA, NINGUN ESTUDIO PREVIO HA ANALIZADO SU CONTRIBUCION EN LAS EXACERBACIONES ASMATICAS, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES EXAMINAR SI EXISTEN CAMBIOS EN LA METILACION DEL ADN EN LA SANGRE Y/O EN EL EPITELIO NASAL ASOCIADOS CON LAS EXACERBACIONES DEL ASMA EN DISTINTAS POBLACIONES, ANALIZAR SUS CONSECUENCIAS FUNCIONALES Y EVALUAR SI SON DEBIDOS A LA VARIACION GENETICA DE LOS INDIVIDUOS,SE REALIZARA UN ESTUDIO DE ASOCIACION DE LA METILACION DEL GENOMA COMPLETO (EWAS, DEL INGLES EPIGENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY) ANALIZANDO APROXIMADAMENTE 850,000 SITIOS CPG EN MUESTRAS SANGUINEAS DE 423 INDIVIDUOS ASMATICOS EUROPEOS, 226 LATINOAMERICANOS Y 228 AFROAMERICANOS Y EN 328 MUESTRAS NASALES DE INDIVIDUOS EUROPEOS, SE ANALIZARA SI LAS CPGS INDIVIDUALES, REGIONES CON METILACION DIFERENCIAL (DMRS) O CLUSTERES DE REGIONES CON METILACION DIFERENCIAL SE ASOCIAN CON LA PRESENCIA/AUSENCIA DE EXACERBACIONES EN EL ULTIMO AÑO (DEFINIDAS COMO VISITAS A URGENCIAS, HOSPITALIZACIONES Y USO DE CORTICOIDES SISTEMICOS), AJUSTANDO POR VARIABLES CONFUSORAS, ASIMISMO, LOS CAMBIOS IDENTIFICADOS SE INTEGRARAN CON EL CONOCIMIENTO DE INTERACCIONES EN PROCESOS BIOLOGICOS Y CON MODIFICACIONES EN LAS DIANAS TERAPEUTICAS DE FARMACOS, ESTOS RESULTADOS SE VALIDARAN MEDIANTE ENSAYOS DE SECUENCIACION MASIVA DIRIGIDOS EN MUESTRAS INDEPENDIENTES DE INDIVIDUOS EUROPEOS (528 MUESTRAS SANGUINEAS Y 240 NASALES) Y EXTRAYENDO INFORMACION DE METILACION A NIVEL GENOMICO EN UN CONJUNTO INDEPENDIENTE DE INDIVIDUOS LATINOAMERICANOS (N=231), CON LOS RESULTADOS VALIDADOS, SE CREARA UN MODELO DE PREDICCION DE LAS EXACERBACIONES DEL ASMA, POSTERIORMENTE, SE ANALIZARA SI LOS CAMBIOS DE METILACION DETECTADOS SE CORRELACIONAN CON MODIFICACIONES DE LOS NIVELES DE EXPRESION GENICA, ANALIZANDO DATOS DE EXPRESION GENICA A NIVEL GENOMICO (RNASEQ) DE 336 INDIVIDUOS Y CON DATOS PUBLICOS DE 3,075 INDIVIDUOS, FINALMENTE, SE INTEGRARAN DATOS GENOMICOS Y DE METILACION PARA DETERMINAR SI LAS MODIFICACIONES EPIGENETICAS DETECTADAS ESTAN SON DEBIDAS A LA COMPOSICION GENETICA DE CADA INDIVIDUO,LOS RESULTADOS DEL ESTUDIO DMAE TENDRAN UN GRAN IMPACTO CIENTIFICO, CONTRIBUYENDO A LA AMPLIACION DEL CONOCIMIENTO DE LOS MECANISMOS MOLECULARES SUBYACENTES A LA APARICION DE EXACERBACIONES DEL ASMA, A LA MEJORA DE LA CAPACIDAD DE PREDECIRLAS Y A LA IDENTIFICACION DE NUEVAS DIANAS FARMACOLOGICAS PARA SU TRATAMIENTO, EXACERBACIONES ASMATICAS\METILACION DEL ADN\EPIGENOMICA\TRANSCRIPTOMICA\GENOMICA\EPIDEMIOLOGIA GENETICA\MULTIOMICA\MEDICINA DE SISTEMAS