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DRIVERMAP: ESTIMANDO LA RELEVANCIA DE LAS MUTACIONES ONCOGENICAS EN FUNCION DE S...

DRIVERMAP: ESTIMANDO LA RELEVANCIA DE LAS MUTACIONES ONCOGENICAS EN FUNCION DE SU CONTEXTO UN MEJOR CONOCIMIENTO DE LOS MECANISMOS RESPONSABLES DEL INICIO Y PROGRESION DEL CANCER Y UN REPERTORIO CADA VEZ MAYOR DE INHIBIDORES MOLECULARES HA IMPULSADO EL USO DE TRATAMIENTOS DIRIGIDOS EN PACIENTES EN LOS QUE LA TERAPIA CON... ver más

01/01/2015

UPF

205K€

Presupuesto del proyecto: 205K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 321

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 321

Presupuesto del proyecto 205K€

Descripción del proyecto UN MEJOR CONOCIMIENTO DE LOS MECANISMOS RESPONSABLES DEL INICIO Y PROGRESION DEL CANCER Y UN REPERTORIO CADA VEZ MAYOR DE INHIBIDORES MOLECULARES HA IMPULSADO EL USO DE TRATAMIENTOS DIRIGIDOS EN PACIENTES EN LOS QUE LA TERAPIA CONVENCIONAL OFRECE POCO BENEFICIO, EN LA ACTUALIDAD, LA ESTRATEGIA SE BASA EN IDENTIFICAR LOS TUMORES CON ALTERACIONES EN GENES QUE DISPONGAN DE UNA DROGA DIRIGIDA, EN CONCRETO, EN AQUELLOS CON UNA MAYOR EVIDENCIA DE SUSTENTAR LOS PROCESOS BASICOS DE LA ENFERMEDAD (GENES DRIVER) Y QUE POR LO TANTO SON MAS PROBABLES DE CAUSAR EL COLAPSO SELECTIVO DE LA CELULA MALIGNA, SIN EMBARGO, LOS RESULTADOS OBTENIDOS CON ESTA ESTRATEGIA SON MUY HETEROGENEOS Y NO BIEN ENTENDIDOS, LO QUE EN ULTIMO TERMINO LIMITA UN USO MAS EXTENDIDO DE LA MEDICINA INDIVIDUALIZADA DEL CANCER, LA EFICACIA DE UN DETERMINADO TRATAMIENTO RESIDE EN GRAN PARTE EN ESTIMAR CORRECTAMENTE EL GRADO DE ADICCION DEL TUMOR AL MECANISMO OBJETIVO DE ESA TERAPIA, EN ESTE PROYECTO SE PROPONE QUE LA PREDICCION DE LA RESPUESTA DEL TUMOR AL FARMACO(S) DIRIGIDO DEBE EVALUAR NO SOLO LA PRESENCIA DE ALTERACIONES EN LOS GENES DRIVER SI NO QUE TAMBIEN NECESITA CARACTERIZAR LA RELEVANCIA ONCOGENICA QUE ESTAS TIENEN EN FUNCION DEL CONTEXTO DETERMINADO EN EL QUE OCURREN, EL TERMINO 'CONTEXTO DEL TUMOR' ENGLOBA DIFERENTES CONSIDERACIONES BIOLOGICAS QUE PUEDEN CLASIFICARSE EN: (I) DIFERENCIAS EN LOS EFECTOS DE CADA MUTACION EN UN GEN DRIVER; (II) LA CO-OCURRENCIA (Y CO-EXCLUSIVIDAD) DE LAS ALTERACIONES EN EL TIEMPO Y EN EL ESPACIO; (III) LA INTERACCION DE LAS ALTERACIONES CON EL AMBIENTE DEL TUMOR INCLUYENDO EL SISTEMA INMUNE-; Y (IV) EL ESTADIO DEL CANCER Y LAS CARACTERISTICAS DEL TEJIDO Y SUS CELULAS DE ORIGEN, LA HIPOTESIS PRINCIPAL DE ESTE TRABAJO ES QUE CIERTOS ASPECTOS CLAVES DE CADA UNA DE ESTAS CUATRO CATEGORIAS PUEDEN EVALUARSE DE MANERA EXHAUSTIVA Y SISTEMATICA UTILIZANDO LOS MILES DE GENOMAS/TRANSCRIPTOMAS OBTENIDOS EN LOS DIFERENTES PROYECTOS DE SECUENCIACION DE PACIENTES DE CANCER, PACIENTES DE OTRAS PATOLOGIAS Y EN POBLACION SANA, EL PRESENTE TRABAJO SE DIVIDE EN TRES GRANDES BLOQUES: EL PRIMERO, DESARROLLA LOS METODOS COMPUTACIONALES PARA EVALUAR CADA UNO DE ESTOS ASPECTOS MEDIANTE UNA APROXIMACION DE MINERIA BIG DATA SOBRE LOS DATOS OMICOS YA DISPONIBLES, SEGUNDO, REALIZAR LOS EXPERIMENTOS MAS ADECUADOS PARA VALIDAR LOS RESULTADOS GENERADOS IN SILICO CON UN MAYOR POTENCIAL PARA PODER INFLUIR EN DECISIONES DE TRATAMIENTO Y PARA ESTIMAR EL VALOR ANALITICO DE LA PLATAFORMA DESARROLLADA, FINALMENTE, CREAR EL PORTAL BIOINFORMATICO PARA EL SOPORTE EN LA SELECCION DE LA TERAPIA(S) DIRIGIDA MAS RELEVANTE PARA EL TUMOR DE CADA PACIENTE EN FUNCION DE SU CONFIGURACION GENOMICA Y UTILIZANDO EL CONOCIMIENTO GENERADO EN LOS DOS BLOQUES ANTERIORES (DRIVERMAP), EN CONCLUSION, ANALIZAR LAS ALTERACIONES GENOMICAS DEL TUMOR DEL PACIENTE EN FUNCION DE LAS CARACTERISTICAS ESPECIFICAS DEL CONTEXTO EN EL QUE ESTAS OCURREN MEJORARA LA ESTIMACION DE LOS EFECTOS CAUSADOS POR LAS DROGAS DIRIGIDAS Y POR LO TANTO MEJORARA: (I) LA INTERPRETACION DE LOS RESULTADOS QUE SE HAN OBTENIDO CON EL USO DE TERAPIAS DIRIGIDAS, INCLUYENDO LAS RESPUESTAS PRIMARIAS Y LA APARICION DE RESISTENCIAS SECUNDARIAS; (II) EL DISEÑO DE NUEVOS ENSAYOS CLINICOS BASADOS EN LA IDENTIFICACION DE ALTERACIONES CUALIFICANTES; (III) LA EVALUACION DE LOS MECANISMOS ANTI-CANCERIGENOS EJERCIDOS POR LAS DROGAS EXISTENTES; Y (IV) EL DESARROLLO MAS RACIONAL DE NUEVOS AGENTES TERAPEUTICOS, MEDICINA INDIVIDUALIZADA DEL CÁNCER\TERAPIAS DIRIGIDAS\TECNOLOGIA ÓMICA\BIG DATA

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