Descripción del proyecto
EN EL GENOMA DE LOS MAMIFEROS LOS ELEMENTOS REGULADORES POTENCIADORES O ENHANCERS CONTROLAN QUE GENES SE EXPRESAN EN LOS DISTINTOS TIPOS CELULARES Y SU REGULACION TRANSCRIPCIONAL DEPENDIENTE DE VIAS DE TRANSDUCCION DE SEÑALES, COMO CONSECUENCIA, DE ESTE IMPORTANTE PAPEL, MILES DE VARIANTES GENETICAS QUE INFLUYEN EN EL RIESGO DE ENFERMEDADES COMUNES MAPEAN EN ENHANCERS, ADEMAS, ALTERACIONES EPIGENETICAS DE LOS ENHANCERS TAMBIEN SE HAN ASOCIADAS A ENFERMEDADES COMO EL CANCER, A PESAR DEL GRAN INTERES EN ESTOS ELEMENTOS, TODAVIA NO CONOCEMOS LA DINAMICA DE LA CROMATINA DE LOS MISMOS Y COMO LOS ENHANCERS REGULAN GENES ESPECIFICOS, POR LO TANTO, COMPRENDER COMO FUNCIONAN LOS POTENCIADORES, QUE PROTEINAS SE UNEN A ELLOS Y CUALES SON LOS CAMBIOS DE LA CROMATINA EN ESTOS ELEMENTOS ES UN DESAFIO CIENTIFICO DE SUMA IMPORTANCIA, RECIENTEMENTE HEMOS MAPEADO Y CATALOGADO TODOS LOS ENHANCER EN CELULAS DEL EPITELIO MAMARIO DE RATON Y HEMOS CARACTERIZADO SU REGULACION POR TGFBETA, UN FACTOR DE CRECIMIENTO CON AMPLIAS IMPLICACIONES EN LA SALUD Y LA ENFERMEDAD, DESCUBRIMOS QUE TGFBETA DESENCADENA UN AUMENTO RAPIDO Y GENERALIZADO EN LA ACCESIBILIDAD DE LA CROMATINA EN APROXIMADAMENTE EL 80% DE LOS ENHANCERS, INDEPENDIENTEMENTE DE SI ESTOS ENHANCERS SON ACTIVADOS, REPRIMIDOS O NO REGULADOS POR TGFBETA, DISOCIANDO LOS CONCEPTOS DE ACCESIBILIDAD Y ACTIVIDAD DE LOS ENHANCERS, TAMBIEN DESCRIBIMOS QUE LOS GENES REGULADOS POR TGFBETA A MENUDO SE AGRUPAN EN DOMINIOS REGULATORIOS DE TGFBETA (TRD), DONDE UN ENHANCER REGULA VARIOS GENES LO QUE TIENE COMO CONSECUENCIA LA CO-REGULACION DE GENES CONTIGUOS, ESTE ESTUDIO HA ABIERTO UNA GRAN CANTIDAD DE PREGUNTAS SOBRE LA BIOLOGIA DE LOS ENHANCERS Y LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL DEPENDIENTE DE TGFBETA QUE INVESTIGAREMOS EN ESTE NUEVO PROYECTO, LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS SON: OBJETIVO 1, MECANISMO MOLECULAR DE LA APERTURA GENERALIZADA DE LA CROMATINA EN ENHANCERS PROVOCADA POR TGFBETA, CINETICA DEL PROCESO, PAPEL DE LA VIA ERK, PAPEL DE FACTORES DE TRANSCRIPCION AP1 Y PROTEINAS DE LA CROMATINA RESPONSABLES DE LA APERTURA, OBJETIVO 2, ¿SE REQUIERE UNA APERTURA DE LOS ENHANCERS GENERAL PARA LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL MEDIADA POR OTRAS RUTAS DE TRANSDUCCION DE SEÑALES? OBJETIVO 3, MECANISMO MOLECULAR DE LA REPRESION DE ENHANCERS POR TGFBETA, ¿COMO MANTENERSE REPRIMIDO ESTANDO ACCESIBLE? OBJETIVO 4, MECANISMO DE CORREGULACION DENTRO DE LOS DOMINIOS REGULATORIOS DE TGFBETA (TDR), MAPEO DE CONTACTOS ENHANCER-PROMOTOR, ENHANCER-ENHANCER Y PROMOTOR-PROMOTOR, ¿FUNCIONAN LOS PROMOTORES COMO ENHANCER EN ALGUNOS TRD? OBJETIVO 5, NUEVOS FACTORES DE CROMATINA IMPLICADOS EN LA REGULACION DE ENHANCER: LA INTERACCION HMG20A-PHF14 E IMPLICACIONES EN EL CANCER DE COLON, CROMATINA\ENHANCER\REGULACION TRANSCRIPCIONAL\EPIGENOMICA\TGFBETA\EMT\WNT\CANCER DE COLON