Descripción del proyecto
DURANTE LA ULTIMA DECADA, Y ESPECIALMENTE DESDE QUE SE HA GENERALIZADO EL USO DE MICROSCOPIA DE LUZ FLORECENTE POR HIBRIDACION Y LA TECNICA CHROMOSOME CONFORMATION CAPTURE, SE HA INCREMENTADO EXPONENCIALMENTE LA CANTIDAD DE DATOS SOBRE LA ORGANIZACION TRI-DIMENSIONAL (3D) DEL GENOMA, ES AHORA POR PRIMERA VEZ QUE TENEMOS ACCESO A DETALLES DE COMO EL GENOMA SE ORGANIZA DENTRO DEL NUCLEO DURANTE LA INTERFASE CELULAR, NUEVOS METODOS COMPUTACIONALES QUE SE BENEFICIAN DE ESTOS DATOS YA ESTAN SIENDO USADOS PARA DETERMINAR LAS PRIMERAS ESTRUCTURAS 3D DE GENOMAS O DE DOMINIOS GENOMICOS, ESTOS METODOS NOS PERMITEN EXTENDER NUESTROS CONOCIMIENTOS DE QUE PRINCIPIOS GOBIERNAN EL PLEGAMIENTO DE CROMATINA QUE, HASTA AHORA, SE HABIA ESTUDIADO PRINCIPALMENTE DESDE UN PUNTO DE VISTA TEORICO Y POR SIMULACIONES MOLECULARES, ESTE PROYECTO PROPONE EL DESARROLLO CONTINUADO DE METODOS COMPUTACIONALES QUE INTEGREN DATOS EXPERIMENTALES PARA LA DETERMINACION DE LA ESTRUCTURA DE GENOMAS Y DOMINIOS GENOMICOS, ESTOS METODOS LOS USAREMOS PARA ESTUDIAR CUESTIONES AUN POR RESOLVER SOBRE EL GENOMA QUE NOS PROVEERAN DE NUEVOS CONOCIMIENTOS PARA ELUCIDAR LA RELACION ENTRE SECUENCIA, ESTRUCTURA Y FUNCION DEL GENOMA,EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES EL DESARROLLO, APLICACION Y DISTRIBUCION DE UN NUEVO METODO COMPUTACIONAL PARA LA DETERMINACION DE GENOMAS Y DOMINIOS GENOMICOS, ESTO SE LOGRARA A PARTIR DE:OBJETIVO ESPECIFICO 1, EL DESARROLLO CONTINUADO DEL METODO TADBIT,OBJETIVO ESPECIFICO 2, DETERMINACION DE LA ESTRUCTURA 3D DEL GENOMA DE MOSCA PARA ESTUDIAR LA RELACION ENTRE ESTRUCTURA Y EPIGENETICAOBJETIVO ESPECIFICO 3, DETERMINACION DE LA ESTRUCTURA 3D DE EU- Y HETERO-CROMATINA,OBJETIVO ESPECIFICO 4, CARACTERIZACION DEL PAPEL DE ELEMENTOS REPETITIVOS DEL GENOMA, LNRNA Y LA ESTRUCTURA DEL MISMO,DE ESTE PROYECTO PODEMOS ESPERAR:- UN METODO SIMPLE DE USAR PARA LA DETERMINACION ESTRUCTURAL DE GENOMAS,- UN ANALISIS DE LA RELACION ENTRE EL ESTADO DE LA CROMATINA (LA EXISTENCIA DE MARCADORES DE CROMATINA) Y SU ESTRUCTURA EN EL GENOMA DE MOSCA,- LA PRIMERA ESTRUCTURA DE RESOLUCION ALTA DE UNA PARTE DEL GENOMA HUMANO QUE ALBERGA AMBOS EU- Y HETERO-CROMATINA,- UN POSIBLE NUEVO PAPEL DE LNCRNA EN LA ESTRUCTURA DEL GENOMA DE RATON, GENÓMICA ESTRUCTURAL\ BIOLOGÍA GENÓMICA\ GENÓMICA 3D\ GENÓMICA TRI-DIMENSIONAL\ REGULACIÓN GÉNICA\ CROMATINA\ MODELADO COMPUTACIONAL\ SHRNA\ HI-C\ CHROMOSOME CONFORMATION CAPTURE