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BFU2017-85926-P

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ANALISIS ESTRUCTURAL DE GENOMAS Y DOMINIOS GENOMICOS

QUE, LA FORMA EN QUE EL ADN ESTA ORGANIZADO EN TRES DIMENSIONES (3D) DENTRO DEL NUCLEO CELULAR Y COMO AFECTA LA MANERA EN QUE LAS CELULAS ACCEDEN, LEEN E INTERPRETAN LA INFORMACION GENETICA SE ENCUENTRAN ENTRE LAS PREGUNTAS MAS IN... ver más

01/01/2017

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175K€

Presupuesto del proyecto: 175K€

Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Presupuesto del proyecto 175K€

Descripción del proyecto QUE, LA FORMA EN QUE EL ADN ESTA ORGANIZADO EN TRES DIMENSIONES (3D) DENTRO DEL NUCLEO CELULAR Y COMO AFECTA LA MANERA EN QUE LAS CELULAS ACCEDEN, LEEN E INTERPRETAN LA INFORMACION GENETICA SE ENCUENTRAN ENTRE LAS PREGUNTAS MAS INTERESANTES EN BIOLOGIA CELULAR, CARACTERIZAR COMO EL GENOMA SE PLIEGA EN EL NUCLEO ES ESENCIAL PARA DETERMINAR COMO PUEDE RESTRINGIR O REGULAR EL PROCESAMIENTO NUCLEAR DEL ADN, INCLUYENDO LA TRANSCRIPCION, LA REPLICACION Y LA REPARACION, SIN EMBARGO, LOS METODOS ACTUALES (TANTO COMPUTACIONALES COMO EXPERIMENTALES) TIENEN QUE SUPERAR LAS LIMITACIONES EXISTENTES PARA ABORDAR LAS NECESIDADES DE LA COMPRENSION DE COMO EL GENOMA SE PLIEGA, ESTE PROYECTO DE INVESTIGACION PRETENDE DAR VALOR AL TRABAJO EN 3D GENOMICS, PROPORCIONANDO NUEVAS TECNOLOGIAS QUE ABORDAN ALGUNAS DE ESTAS LIMITACIONES,COMO, NUESTRO ENFOQUE SE BASA EN LA HIPOTESIS DE QUE LA CONFORMACION 3D DEL GENOMA ACTUA COMO UNA MEMORIA EPIGENETICA Y TIENE UN EFECTO SOBRE LA EXPRESION DE GENES TANTO CODIFICANTES COMO NO CODIFICANTES, NUESTROS TRABAJOS ANTERIORES Y DE MUCHOS OTROS GRUPOS, HAN DEMOSTRADO QUE TAL HIPOTESIS ES CIERTA, LO QUE HACE MAS IMPRESCINDIBLE EL DESARROLLO DE NUEVOS METODOS EXPERIMENTALES Y COMPUTACIONALES PARA ESTUDIAR LA ESTRUCTURA DEL GENOMA EN 3D, NUESTRO PROYECTO TIENE COMO OBJECTIVOS: (OBJETIVO 1) DESARROLLAR UN MODULO DE TADBIT PARA NORMALIZAR DATOS HI-C CON ESTADISTICA BAYESIANA; (OBJETIVO 2) DESARROLLAR UN MODULO DE TADBIT PARA RECONSTRUIR LOS GENOMAS 3D A PARTIR DE DATOS DE GENOME ARCHITECTURE MAPPER; Y (OBJETIVO 3) DESARROLLAR E IMPLEMENTAR UN NUEVO PROTOCOLO LLAMADO MCC PARA CAPTURAR MULTIPLES CONTACTOS EN EL GENOMA,QUIEN, EL OBJETIVO GENERAL DE NUESTRO GRUPO ES DESARROLLAR, APLICAR Y PROPORCIONAR METODOS COMPUTACIONALES Y EXPERIMENTALES PARA LA DETERMINACION ESTRUCTURAL DE GENOMAS Y DOMINIOS GENOMICOS, A PESAR DE QUE NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION ES MAS CONOCIDO POR SUS DESARROLLOS COMPUTACIONALES, DESDE 2014 SOMOS MIEMBROS DE LA UNIDAD 4DGENOME EN CRG Y HEMOS ADQUIRIDO EXPERIENCIA EN EL LABORATORIO ESPECIALMENTE ALREDEDOR DE EXPERIMENTOS BASADOS EN CHROMOSOME CONFORMATION CAPTURE,POR QUE, CREEMOS QUE ESTE ES EL MOMENTO ADECUADO PARA ESTE PROYECTO, EL CAMPO DE LA GENOMICA EN 3D ESTA EN RAPIDA EXPANSION IMPULSADO POR LAS TECNOLOGIAS EMERGENTES A LA VANGUARDIA DE LA INVESTIGACION EN LAS CIENCIAS DE LA VIDA, LA INVESTIGACION PROPUESTA AQUI, SI TIENE EXITO, AGREGARA METODOS COMPUTACIONALES Y EXPERIMENTALES A LAS HERRAMIENTAS QUE LOS INVESTIGADORES DE TODO EL MUNDO ESTAN UTILIZANDO PARA DESCIFRAR EL PLEGAMIENTO DEL GENOMA, ADEMAS, LA PROPUESTA DE LA NUEVA TECNOLOGIA MCC PODRIA AYUDAR A LLEVAR LA GENOMICA 3D A APLICACIONES MEDICAS SUPERANDO LOS ACTUALES REQUERIMIENTOS DE NUMERO DE CELULAS QUE EXCLUYEN, POR EJEMPLO, TEJIDOS PRIMARIOS O CELULAS TUMORALES DE PACIENTES, GENÓMICA ESTRUCTURAL\GENÓMICA 3D\REGULACIÓN GÉNICA\CROMATINA\MODELADO COMPUTACIONAL

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