Descripción del proyecto
LA DETERMINACION DE LA FUNCION EN EL AREA POSGENOMICA ES DE SUMA IMPORTANCIA, Y MAS AUN PARA LOS ORGANISMOS NO MODELO, LOS PLANCTOMICETOS SON BACTERIAS DE ORGANISMOS NO MODELO QUE MUESTRAN UNA NUEVA BIOLOGIA DIVERGENTE, ESTAN RELACIONADOS CON LA BIODIVERSIDAD, LA BIORREMEDIACION, LOS CICLOS GEOQUIMICOS, LAS APLICACIONES INDUSTRIALES, LA SALUD HUMANA Y LA EVOLUCION, EN ESTA PROPUESTA, COMENZAREMOS A EXPLORAR, CARACTERIZAR Y DESCIFRAR LA BIOLOGIA CELULAR DIVERGENTE DE ESOS ORGANISMOS NO MODELO Y LO HAREMOS UTILIZANDO LA COMBINACION COMPLEMENTARIA DE ANALISIS EXPERIMENTALES Y COMPUTACIONALES,AHORA ES EL MOMENTO DE INICIAR UN AMBICIOSO PROGRAMA PARA DESCIFRAR LA EXCITANTE BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR DIVERGENTE DE LOS PLANCTOMICETOS Y BACTERIAS RELACIONADAS, APROVECHAREMOS NUESTRA PROPIA EXPERIENCIA CON ESPECIES EN CULTIVO EN EL LABORATORIO, CON LA EXPLORACION RECIENTE DE LA BIODIVERSIDAD DE PLANCTOMICETOS, SE COMBINARAN ENSAYOS COMPUTACIONALES Y EXPERIMENTALES PARA APROVECHAR SU SINERGIA, ESTA PROPUESTA SE CENTRA EN LOS GRUPOS ORTOLOGOS DE PLANCTOMYCETES, O PLOGS, SU ANOTACION POR METODOS COMPUTACIONALES PERO TAMBIEN POR LA DETERMINACION DE LA ESENCIALIDAD DE LOS GENES EN EL GENOMA DE PLANCTOMYCETES LIMNOPHILUS, CONECTAREMOS LOS PLOG MEDIANTE LA INTERACCION DE PROTEINAS Y LA COTRANSCRIPCION PARA REVELAR LA INTERCONEXION DE LOS JUGADORES MOLECULARES DE PLANCTOMYCETES, EXPERIMENTALMENTE, UTILIZAREMOS LA INTEGRACION DE TRANSPOSONES SATURANTE PARA REVELAR GENES ESENCIALES Y CARACTERIZARLOS, COMPUTACIONALMENTE, UTILIZAREMOS VARIOS ENFOQUES PARA PREDECIR LA FUNCION, INCLUIDA LA CONSTRUCCION DE GRUPOS ORTOLOGOS, PREDECIR LA INTERACCION DE PROTEINAS Y LAS UNIDADES TRANSCRIPCIONALES, COMBINAREMOS LA ESENCIALIDAD GENETICA CON GRUPOS ORTOLOGOS, ANOTANDO ESOS GRUPOS ORTOLOGOS DE PLANCTOMYCETES POR ESENCIALIDAD, A CONTINUACION, ESOS GRUPOS ORTOLOGOS ANOTADOS EN ESENCIALIDAD SE VINCULARAN MEDIANTE COTRANSCRIPCION E INTERACCION PROTEINA-PROTEINA PARA REVELAR LOS MECANISMOS CELULARES Y MOLECULARES PROFUNDOS DE LAS CELULAS DE PLANCTOMYCETES, EN CONJUNTO, PROPONEMOS UNA EXPLORACION AMBICIOSA DE LA BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR DE LOS PLANCTOMYCETES, MICROBIOLOGIA\EVOLUTION\BIOINFORMATICA\PREDICTION DE FUNCTION\ESENCIALIDAD\TRANSPOSON\GRUPOS ORTHOLOGOS