Descripción del proyecto
LAS COMUNIDADES BIOLOGICAS SON SISTEMAS (ECO-SISTEMAS) COMPUESTOS POR MUCHAS PARTES QUE INTERACTUAN (ESPECIES), LA MACRO ECOLOGIA HA AVANZADO SUSTANCIALMENTE NUESTRA COMPRENSION DE LOS ECOSISTEMAS QUE INVOLUCRAN PRINCIPALMENTE A LOS ANIMALES Y PLANTAS, GENERANDO MODELOS EN LOS QUE LAS ESPECIES Y SUS INTERACCIONES ECOLOGICAS SE ENTIENDEN COMO REDES, LAS CUALES TIENEN CARACTERISTICAS Y ARQUITECTURAS ESPECIFICAS QUE PUEDEN INFLUIR EN EL FUNCIONAMIENTO DEL ECOSISTEMA, EN COMPARACION, NUESTRO CONOCIMIENTO DE LAS REDES DE INTERACCION MICROBIANAS ES RUDIMENTARIO, Y EN LA MAYORIA DE LOS ESTUDIOS DE COMUNIDADES, LOS MICROBIOS SE AGRUPAN SEGUN SU FUNCION (POR EJEMPLO, PREDADORES), PERDIENDOSE ASI LAS INTERACCIONES ESPECIFICAS ENTRE LAS ESPECIES, ESTO REPRESENTA UNA IMPORTANTE BRECHA DE CONOCIMIENTO EN LA ECOLOGIA MICROBIANA, YA QUE LOS MICROBIOS SON ACTORES CLAVE EN CASI TODOS LOS ECOSISTEMAS, PARTICULARMENTE EN LOS OCEANOS, Y SIN COMPRENDER SUS INTERACCIONES A NIVEL DE ESPECIES, NO PODEMOS INCREMENTAR NUESTRA COMPRENSION DEL FUNCIONAMIENTO DE LA BIOSFERA, LO CUAL ES ESPECIALMENTE NECESARIO EN UN CONTEXTO DE CAMBIO GLOBAL, LA RAZON DE ESTO ULTIMO ES QUE LAS INTERACCIONES MICROBIANAS HAN DEMOSTRADO SER DE MUY DIFICIL ESTUDIO, SIN EMBARGO, EL RECIENTE AVANCE TECNOLOGICO EN GENOMICA DE CELULAS INDIVIDUALES, SECUENCIACION DE ADN Y COMPUTACION DE ALTO RENDIMIENTO, HACE QUE AHORA SEA POSIBLE CAPTURAR A LOS MICROBIOS MAS IMPORTANTES DE UNA COMUNIDAD Y DETERMINAR SUS INTERACCIONES ECOLOGICAS, POR LO TANTO, EN ESTE PROYECTO, PROPONEMOS FOCALIZARNOS EN UN MODELO DE COMUNIDAD MICROBIANA MARINA CON EL OBJETIVO DE A) PREDECIR INTERACCIONES ECOLOGICAS ESENCIALES A PARTIR DEL ANALISIS DE REDES DE ASOCIACION, B) COMPROBAR SI EXISTEN LAS INTERACCIONES PREVISTAS Y DETERMINAR EL TIPO DE INTERACCION (POR EJEMPLO, SIMBIOSIS, PREDACION, PARASITISMO) UTILIZANDO LA GENOMICA DE UNA SOLA CELULA , C) PROBAR SI OTRAS INTERACCIONES PREDICHAS PUEDEN SER CONSIDERADAS COMO COOPERACION METABOLICA MEDIANTE METAGENOMICA Y METATRANSCRIPTOMICA Y D), DETERMINAR LA UBICUIDAD, EN EL OCEANO GLOBAL, DE INTERACCIONES SELECCIONADAS UTILIZANDO DATOS MOLECULARES EXISTENTES PROVENIENTES DE GRANDES EXPEDICIONES MARITIMAS (MALASPINA Y TARA OCEANS), LOS PRINCIPALES RESULTADOS DE ESTE PROYECTO SERAN LOS SIGUIENTES: A) LA IDENTIFICACION DE LAS INTERACCIONES ECOLOGICAS MAS IMPORTANTES DENTRO DE LA COMUNIDAD MICROBIANA ESTUDIADA EN UN CONTEXTO TEMPORAL, B) LA DETERMINACION DE LAS INTERACCIONES METABOLICAS ESENCIALES, C) EL MONTAJE DE UNA RED INTEGRAL DE INTERACCIONES PARA ESTA COMUNIDAD MARINA MODELO, ANALIZANDO SUS PRINCIPALES CARACTERISTICAS Y D) UNA ESTIMACION DE LA UBICUIDAD DE LAS INTERACCIONES DETECTADAS EN EL OCEANO GLOBAL, EN RESUMEN, ESTE PROYECTO EXPANDIRA LA FRONTERA DE LA INVESTIGACION EN ECOLOGIA MICROBIANA MEDIANTE LA DETERMINACION DE INTERACCIONES ECOLOGICAS ENTRE ESPECIES DE UNA COMUNIDAD MODELO, INTERACCIONES\MICROBIOS\PROTISTAS\FUNCIONAMIENTO DEL ECOSISTEMA\REDES\ÓMICOS\GENÓMICA DE CÉLULAS INDIVIDUALES