Descripción del proyecto
MUTAGENESIS LETAL ES UNA ESTRATEGIA ANTIVIRAL CONSISTENTE EN LLEVAR POBLACIONES DE VIRUS RNA HACIA LA EXTINCION DEBIDO A UN EXCESO DE MUTACIONES INCORPORADAS AL GENOMA VIRICO DURANTE SU REPLICACION, LA EXTINCION SE CONSIGUE ADMINISTRANDO ANALOGOS DE BASE Y DE NUCLEOSIDO, APROBADOS PARA USO EN HUMANOS, LOS ANALOGOS SE CONVIERTEN INTRACELULARMENTE EN SUS CORRESPONDIENTES NUCLEOSIDO-TRIFOSFATOS QUE SON INCORPORADOS POR LA POLIMERASA VIRICA HASTA ALCANZAR TASAS DE ERROR INCOMPATIBLES CON LA PRODUCCION DE PROGENIE INFECCIOSA,RESULTADOS RECIENTES SUGIEREN QUE LA MUTAGENESIS LETAL PUEDE RESULTAR EFECTIVA PARA CONTROLAR INFECCIONES POR SARS-COV-2, EN ESTE PROYECTO INVESTIGAREMOS MUTAGENESIS LETAL DE SARS-COV-2 EN CULTIVOS CELULARES CON DOS OBJETIVOS RELACIONADOS: (I) ESTUDIAR EL EFECTO DE MUTAGENESIS INCREMENTADA SOBRE ELEMENTOS ESTRUCTURADOS DEL GENOMA DE SARS-COV-2 EN SU TRANSICION HACIA PERDIDA DE INFECTIVIDAD, Y (II) BUSCAR POSIBLES EFECTOS SINERGICOS ENTRE FAVIPIRAVIR (FPV) Y RIBAVIRINA (RIB), PARA LOGRAR MAXIMA EFICACIA PARA EXTINGUIR UN AISLADO SARS-COV-2 VIRULENTO, RESPECTO A (I), NUESTRO OBJETIVO PRINCIPAL ES CUANTIFICAR ALTERACIONES DE ELEMENTOS ESTRUCTURADOS EN EL RNA GENOMICO DEL CORONAVIRUS, COMO MARCADORAS DE LA TRANSICION HACIA LA EXTINCION, USAREMOS DOS ABORDAJES COMPLEMENTARIOS: PREDICCION DE ESTRUCTURAS SECUNDARIAS Y BUSQUEDA DE POSIBLES SITIOS SENSIBLES A RNASA P, RNASA III Y LUZ UV-C (QUE ESTAN PRESENTES Y JUGAR PAPELES FUNCIONALES Y REGULADORES IMPORTANTES EN OTROS VIRUS RNA) EN EL GENOMA DE SARS-COV-2, ASI COMO SU MODIFICACION O PERDIDA DEBIDO A MUTAGENESIS, EXAMINAREMOS ELEMENTOS ESTRUCTURALES QUE HAN SIDO IDENTIFICADOS EN LA ZONA 5TERMINAL Y EN LA REGION QUE CODIFICA LA POLIMERASA (NSP12), PRIMERO CON UNA CEPA SARS-COV-2 DE REFERENCIA Y A CONTINUACION CON UN AISLADO VIRULENTO SOMETIDO A CINCO PASES EN CULTIVOS CELULARES EN AUSENCIA O PRESENCIA DE ANALOGOS MUTAGENICOS, SE COMPARARAN LAS ESTRUCTURAS PREDICHAS Y LOS SITIOS DE RUPTURA DETERMINADOS EXPERIMENTALMENTE PARA EL RNA DE LA POBLACION INICIAL Y DE LAS POBLACIONES PROPAGADAS, A FIN DE CUANTIFICAR LAS MODIFICACIONES ATRIBUIBLES A LA PROXIMIDAD DEL VIRUS A LA EXTINCION,EL PROYECTO DEBERIA INTRODUCIR MARCADORES DE MUTAGENESIS LETAL A NIVEL DE RNA, AUMENTAR NUESTRO CONOCIMIENTO DE LOS ACONTECIMIENTOS MOLECULARES SUBYACENTES A LA EXTINCION DE VIRUS Y CONTRIBUIR A DISPONER DE OPCIONES DE TRATAMIENTO PARA EL COVID-19, CUASIESPECIES\ESTABILIDAD DEL GENOMA VIRAL\DEFECCION LETAL\ESTRUCTURA DE ARN\POLIMERASA\EXTINCION DE VIRUS\SECUENCIACION MASIVA\SINERGIA\AISLADOS SARS-COV-2 VIRULENTOS