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PID2021-124566OB-I00

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ANALISIS DE INTERACCIONES ARN-PROTEINA Y ARN-ARN EN VIRUS DE LA HEPATITIS C Y SA...

ANALISIS DE INTERACCIONES ARN-PROTEINA Y ARN-ARN EN VIRUS DE LA HEPATITIS C Y SARS-COV-2. DESCUBRIMIENTO DE AGENTES ANTI-SARS-COV-2 QUE BLOQUEAN UN CONTACTO TERCIARIO ARN-ARN LAS ESTRUCTURAS FORMADAS POR MOLECULAS DE ARN DESEMPEÑAN FUNCIONES ESENCIALES EN LOS CICLOS DE REPLICACION DE VIRUS CAPACES DE CAUSAR ENFERMEDADES PANDEMICAS. LOS DOMINIOS 5BSL3.2 Y 3'X DEL ARN GENOMICO DEL VIRUS DE LA HEPATITIS C... ver más

01/01/2021

UCV

145K€

Presupuesto del proyecto: 145K€

Líder del proyecto

FUND UNIVERSIDAD CATOL VCIA S VTE MARTI No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

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FUND UNIVERSIDAD CATOL VCIA S VTE MARTI No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Presupuesto del proyecto 145K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LAS ESTRUCTURAS FORMADAS POR MOLECULAS DE ARN DESEMPEÑAN FUNCIONES ESENCIALES EN LOS CICLOS DE REPLICACION DE VIRUS CAPACES DE CAUSAR ENFERMEDADES PANDEMICAS. LOS DOMINIOS 5BSL3.2 Y 3'X DEL ARN GENOMICO DEL VIRUS DE LA HEPATITIS C (VHC) FORMAN PARTE DE UNA RED DE CONTACTOS ARN-ARN DISTALES QUE REGULA LA REPLICACION Y TRADUCCION DEL VIRUS. SI BIEN EXISTE AMPLIA EVIDENCIA DE QUE ESTOS ELEMENTOS DE ARN DESEMPEÑAN PAPELES CLAVE EN EL CICLO DE REPLICACION DEL VHC, LOS MECANISMOS MOLECULARES RESPONSABLES DE ESTAS FUNCIONES PERMANECEN SIN ACLARAR. RECIENTEMENTE HEMOS DETERMINADO LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DE LOS DOMINIOS 5BSL3.2 Y 3X Y DEL COMPLEJO DISTAL 5BSL3.2-3X. BASANDONOS EN SIMILITUDES ENTRE 5BSL3.2 Y DOMINIOS FUNCIONALES DE ARN DE FLAVIVIRUS, HEMOS CONSTRUIDO UN MODELO DE INTERACCION QUE PUEDE EXPLICAR EL MECANISMO UTILIZADO POR LOS DOMINIOS 5BSL3.2 Y 3X PARA RECONOCER LA POLIMERASA VIRAL NS5B Y FAVORECER EL PROCESO DE REPLICACION. EL PRIMER OBJETIVO DEL PROYECTO ES VALIDAR ESTE MODELO UTILIZANDO UNA ESTRATEGIA BASADA EN MUTAGENESIS DIRIGIDA Y EXPERIMENTOS DE FLUORESCENCIA. LA CONFIRMACION DE ESTA HIPOTESIS CLARIFICARIA LA FUNCION DE 5BSL3.2 Y 3X Y REVELARIA UN MECANISMO DE UNION A POLIMERASA CONSERVADO EN VIRUS DE LA FAMILIA FLAVIVIRIDAE, QUE INCLUYE OTROS PATOGENOS COMO ZIKA O DENGUE. LA SEGUNDA PARTE DEL PROYECTO SE CENTRA EN SARS-COV-2, EL CORONAVIRUS CAUSANTE DE LA ACTUAL PANDEMIA DE COVID-19. EL ARN GENOMICO DE ESTE VIRUS CONTIENE NUMEROSAS ESTRUCTURAS CONSERVADAS Y POSIBLES INTERACCIONES ARN-ARN DISTALES CUYA FUNCION ES AUN DESCONOCIDA. MEDIANTE ANALISIS BIOINFORMATICOS Y FILOGENETICOS, HEMOS DETECTADO UNA HORQUILLA CONSERVADA SITUADA EN LA REGION 3 NO TRADUCIDA DEL VIRUS, 3_SL2, QUE PUEDE FORMAR UN PSEUDONUDO LOCAL CON UNA HORQUILLA 3_SL1 ADYACENTE O BIEN UNA INTERACCION REMOTA CON UNA SECUENCIA EXPUESTA DE LA REGION ORF7B. SE HA PROPUESTO QUE EL PSEUDONUDO ES IMPORTANTE PARA EL PROCESO DE REPLICACION DEL ARN VIRAL, LO QUE SUGIERE QUE LA INTERACCION CON ORF7B PODRIA FORMAR PARTE DE UN INTERRUPTOR FUNCIONAL. HEMOS VERIFICADO LA INTERACCION DISTAL 3_SL2-ORF7B MEDIANTE ELECTROFORESIS, Y EXPERIMENTOS DE MUTAGENESIS ACTUALMENTE EN CURSO INDICAN QUE VARIACIONES SINONIMAS EN LOS NUCLEOTIDOS DE 3_SL2 Y ORF7B IMPLICADOS EN EL CONTACTO DISTAL IMPIDEN EL RESCATE DEL VIRUS. EN BASE A ESTOS RESULTADOS, EL SEGUNDO OBJETIVO DEL PROYECTO ES UN ANALISIS ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL DE LA HORQUILLA 3_SL2 Y SUS CONTACTOS TERCIARIOS CON 3_SL1 Y ORF7B MEDIANTE EXPERIMENTOS DE RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR (RMN) Y GENETICA REVERSA. POR OTRO LADO, SE NECESITAN NUEVOS ANTIVIRALES PARA TRATAR INDIVIDUOS INFECTADOS POR SARS-COV-2 Y PREVENIR NUEVOS BROTES EPIDEMICOS CAUSADOS POR CORONAVIRUS. EL TERCER OBJETIVO DEL PROYECTO ES LA IDENTIFICACION DE COMPUESTOS CAPACES DE BLOQUEAR LOS CONTACTOS TERCIARIOS ESTABLECIDOS POR LA HORQUILLA 3_SL2. PARA ALCANZAR ESTA META IMPLEMENTAREMOS UN ENSAYO DE FLUORESCENCIA PARA DETECTAR EL COMPLEJO 3_SL2-ORF7B Y LO UTILIZAREMOS PARA CRIBAR UNA QUIMIOTECA ENFOCADA FORMADA POR COMPUESTOS CON PROPIEDADES FAVORECEDORAS DE UNION A ARN. LOS COMPUESTOS IDENTIFICADOS EN EL CRIBADO SERAN EVALUADOS MEDIANTE EXPERIMENTOS DE RMN Y ENSAYOS CELULARES PARA DETERMINAR UNION A ARN, TOXICIDAD CELULAR Y ACTIVIDAD ANTI-SARS-COV-2. POSTERIORMENTE LEVAREMOS A CABO UN PROCESO ITERATIVO DE OPTIMIZACION CON OBJETO DE SELECCIONAR UN CABEZA DE SERIE CON PROPIEDADES APROPIADAS PARA CONTINUAR SU DESARROLLO COMO AGENTE ANTIVIRAL. RN\VIRUS\SARS-COV-2\POLIMERASA\HEPATITIS C\FARMACO\ESTRUCTURA\CRIBADO\CONTACTO TERCIARIO\COVID-19

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