Descripción del proyecto
EL SPLICING ALTERNATIVO ES UN PROCESO ESENCIAL PARA LA CORRECTA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA Y LA HOMEOSTASIS CELULAR, LA MAQUINARIA QUE LO CONTROLA, EL SPLICEOSOMA, EMPLEA UN NUCLEO DE RIBONUCLEOPROTEINAS Y UN CONJUNTO DE FACTORES DE SPLICING PARA PROCESAR SECUENCIAS DE ARN NO CODIFICANTES (INTRONES) Y CODIFICANTES (EXONES), GENERANDO DISTINTAS VARIANTES DE SPLICING DEL MISMO GEN, DIVERSOS MECANISMOS REGULAN ESTE PROCESO PARA GARANTIZAR UNA CORRECTA HOMEOSTASIS DEL METABOLISMO DEL ARN, CUYA DESREGULACION PUEDE AUMENTAR LA ONCOGENESIS/AGRESIVIDAD EN DIFERENTES TIPOS DE CANCER, ESTOS SISTEMAS INCLUYEN LA DEGRADACION MEDIADA POR ARN-NONSENSE MEDIATED DECAY (NMD) Y EL COMPLEJO ARN-EXOSOMA, ADEMAS, SE HA DEMOSTRADO QUE EL RENDIMIENTO DEL PROCESO DE SPLICING INFLUYE EN OTROS MECANISMOS CLAVE QUE CONTROLAN LA EXPRESION GENICA Y LA ESTABILIDAD DEL GENOMA, COMO LA FORMACION DE R-LOOPS, UN TIPO DE ESTRUCTURAS HIBRIDAS DE ARN-ADN RELACIONADAS CON EL SPLICING, ESTAS MAQUINARIAS Y SU REGULACION SON POCO CONOCIDAS EN CANCER Y, PARTICULARMENTE, EN LOS TUMORES NEUROENDOCRINOS (TNE), UNA PATOLOGIA RARA PERO EMERGENTE QUE, DEBIDO A SU COMPLEJIDAD Y HETEROGENEIDAD, ES MUY DIFICIL DE DETECTAR, MANEJAR Y TRATAR, RECIENTEMENTE IDENTIFICAMOS VARIANTES DE SPLICING ABERRANTES Y CAMBIOS EN LA MAQUINARIA ASOCIADOS A MAL PRONOSTICO EN LOS TNE, LO QUE NOS LLEVA A LA HIPOTESIS DE QUE, DURANTE EL DESARROLLO Y LA PROGRESION DE LOS TNE, LAS MAQUINARIAS DE SPLICING Y METABOLISMO DEL ARN SUFREN UNA DESREGULACION SEVERA, QUE ALTERA EL TRANSCRIPTOMA E INFLUYE EN PROCESOS CELULARES CLAVE, ES PROBABLE QUE ESTA DESREGULACION ESTE ASOCIADA A ALTERACIONES DE PERFILES MUTACIONALES Y CLINICOPATOLOGICOS DE PACIENTES CON TNE, LO QUE PROPORCIONA UNA NUEVA Y VALIOSA VENTANA DE INFORMACION SOBRE SU FISIOPATOLOGIA, EL OBJETIVO GENERAL DE ESTE PROYECTO ES EL DESPLIEGUE DE UNA NOVEDOSA ESTRATEGIA SPLICEOSOMICA PARA ALCANZAR UN CONOCIMIENTO PROFUNDO Y ORIGINAL DE LA EXPRESION DE LAS VARIANTES DE SPLICING Y LAS MAQUINARIAS RESPONSABLES DEL SPLICING Y EL METABOLISMO DE ARN EN UNA COHORTE AMPLIA, REPRESENTATIVA Y BIEN DOCUMENTADA DE MUESTRAS DE TNE DE DIFERENTES LOCALIZACIONES, SE EVALUARA LA RELACION DE HALLAZGOS SPLICEOSOMICOS CON CARACTERISTICAS MUTACIONALES Y CLINICO-PATOLOGICAS DE LOS PACIENTES, CON EL OBJETIVO FINAL DE MEJORAR LA CLASIFICACION MOLECULAR DE LOS TNE Y EVALUAR NUEVAS VARIANTES MOLECULARES COMO MARCADORES DE DIAGNOSTICO, PRONOSTICO Y HERRAMIENTAS PARA DESCUBRIR NUEVOS OBJETIVOS TERAPEUTICOS, CON ESTE FIN, SE CREARA UN CONSORCIO INTERNACIONAL QUE CONTRIBUIRA CON UNA COHORTE DE 40 MUESTRAS DE CADA TIPO DE TNE (PULMON, PANCREATICO Y GASTROINTESTINAL) PARA REALIZAR UN ANALISIS TRANSCRIPTOMICO (RNA-SEQ) Y ESTABLECER UN PAISAJE SPLICEOSOMICO, A TRAVES DE ANALISIS BIOINFORMATICOS, SE OBTENDRA INFORMACION QUE, JUNTO CON SU RELACION CON LOS PERFILES MUTACIONALES Y CLINICOS DE LOS PACIENTES, PERMITIRA IDENTIFICAR ELEMENTOS MOLECULARES CON POTENCIAL DIAGNOSTICO Y/O PRONOSTICO Y REFINAR LA TAXONOMIA MOLECULAR DE LOS TNE, ESTO SE CORROBORARA EN UNA COHORTE DE VALIDACION DE TNE INDEPENDIENTE Y MAS NUMEROSA (>600), FINALMENTE, SELECCIONAREMOS POSIBLES DIANAS TERAPEUTICAS Y EVALUAREMOS SU POTENCIAL FUNCIONAL COMO OBJETIVOS ACCIONABLES/FARMACOLOGICOS CON UNA BATERIA DE ENSAYOS IN VITRO E IN VIVO, EN RESUMEN, ESPERAMOS PROPORCIONAR INFORMACION ORIGINAL Y UTIL PARA MEJORAR EL CONOCIMIENTO Y EL TRATAMIENTO DE LOS TNE Y ACERCAR ESTA PATOLOGIA A LA MEDICINA PERSONALIZADA DE PRECISION, SPLICING ALTERNATIVO\SPLICEOSOMA\TUMOR NEUROENDOCRINO\RNA-SEQ\PANEL MUTACIONAL\MARCADORES DIAGNOSTICOS/TERAPEUTICOS