DESARROLLO DE UNA HERRAMIENTA BASADA EN ADN AMBIENTAL PARA DETECTAR Y CUANTIFICA...
DESARROLLO DE UNA HERRAMIENTA BASADA EN ADN AMBIENTAL PARA DETECTAR Y CUANTIFICAR DE HONGOS PATOGENOS EMERGENTES.
EL IMPACTO DE HONGOS PATOGENOS EN LA AGRICULTURA, ACUICULTURA, GANADERIA, RIQUEZA FORESTAL Y LOS ECOSISTEMAS, ESTA SIENDO RECONOCIDO CADA VEZ MAS COMO UNA AMENAZA GLOBAL DE LA SEGURIDAD ALIMENTARIA, RECURSOS NATURALES Y ECOSISTEMA...
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Descripción del proyecto
EL IMPACTO DE HONGOS PATOGENOS EN LA AGRICULTURA, ACUICULTURA, GANADERIA, RIQUEZA FORESTAL Y LOS ECOSISTEMAS, ESTA SIENDO RECONOCIDO CADA VEZ MAS COMO UNA AMENAZA GLOBAL DE LA SEGURIDAD ALIMENTARIA, RECURSOS NATURALES Y ECOSISTEMAS. ALGUNOS HONGOS ESTAN ASOCIADOS CON LOS PRIMEROS CASOS DOCUMENTADOS DE EXTINCION DE ESPECIES POR ENFERMEDADES INFECCIOSAS QUE HAN OCASIONADO UNA PERDIDA DE BIODIVERSIDAD, Y UNA AMENAZA A LA SEGURIDAD ALIMENTARIA. ALGUNAS DE LA ENFERMEDADES DE PLANTAS MAS SEVERAS SON DEBIDAS A HONGOS PATOGENOS Y OOMYCETES, Y SE HAN MANIFESTADO COMO ENFERMEDADES EMERGENTES CON GRAN FUERZA Y VIRULENCIA DURANTE LAS ULTIMAS DECADAS, DESTRUYENDO CULTIVOS Y BOSQUES NATURALES Y URBANOS (P.E., LA GRAFIOSIS, EL CHANCRO DEL CASTAÑOY LA FUSARIOSIS DEL CEREAL, PRODUCIDAS RESPECTIVAMENTE POR OPHISTOMA ULMI, CRYPHONECTRIA PARASITICA, Y FUSARIUM GRAMINEARUM, O LA PODREDUMBRE DE LA PATATA PRODUCIDA POR PHYTOPHTHORA INFESTANS (OOMYCOTA). EN ANIMALES, MORTALIDADES MASIVAS DE TORTUGAS MARINAS, Y EL DECLIVE DE ARRECIFES DE CORALES SON DEBIDOS F.KERATOPLASTICUM Y F. FALCIFORME, Y ASPEGILLUS SIDOWII, RESPECTIVAMENTE. EN ECOSISTEMAS ACUATICOS, ESPECIES DE OOMYCETES COMO SAPROLEGNIA PARASITICA CAUSA IMPORTANTES PERDIDAS ECONOMICAS EN LA ACUICULTURA, Y APHANOMYCES ASTACI, S. DICLINA Y S. FERAX SON RESPONSABLES DEL DECLIVE GLOBAL DE CRUSTACEOS Y ANFIBIOS. LAS LIMITACIONES DE LAS METODOLOGIAS BASADAS EN AISLAMIENTO CON CULTIVOS SELECTIVOS, Y EN PCR NO NOS PERMITEN AUMENTAR NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE ESTAS ENFERMEDADES. EXISTEN POCOS ESTUDIOS QUE INTENTAN CUANTIFICAR Y ESTABLECER EN MUESTRAS BIOLOGICAS: (1) LAS CONCETRACIONES DE PATOGENOS; (2) SUS VARIACIONES EN DISTINTAS AREAS BIOGEOGRAFICAS, Y (3) LOS UMBRALES QUE DESENCADENAN EMERGENCIA DE LA ENFERMEDAD. SIN EMBARGO, METODOLOGIAS DESARROLLADAS RECIENTEMENTE BASADAS EN ADN-AMBIENTAL BARCODING Y METAGENOMICA ESTAN POSIBILITANDO UN ESTUDIO MAS EFICIENTE DE MUESTRAS AMBIENTALES. LA CREACION EN EL RJB-CSIC GRACIAS A PROYECTOS NACIONALES Y EUROPEOS DE UNO DE LOS MAS IMPORTANTE BANCOS DE ADN Y DE BASE DE DATOS DE SECUENCIAS DE ADN DE HONGOS PATOGENOS EMERGENTES Y APOYADOS POR UNA COLECCION DE CULTIVOS CONSERVADA Y TAXONOMICAMENTE SOLIDA, REPRESENTA UNA OPORTUNIDAD IDEAL PARA EL DESARROLLO DE METODOS PARA MUESTRAS AMBIENTALES CON TECNICAS DE SECUENCIACION DE NUEVA GENERACION. ESTA INFRAESTRUCTURA REPRESENTA LA BASE PARA: (1) DESARROLLAR TECNICAS BASADAS EN ADN-AMBIENTAL PARA ESTUDIOS DE METABARCODING UN AMPLIO NUMERO DE MUESTRAS DE DISTINTOS HABITATS Y HOSPEDANTES. LOS MIEMBROS DEL EQUIPO DE TRABAJO FORMAN UN RED DE ESPECIALISTAS QUE NOS PROPORCIONA UNA BUENA OPORTUNIDAD PARA LA OBTENCION DE MUESTRAS AMBIENTALES DE CADA PATOGENO. ESTA RED E INFRAESTRUCTURA SERVIRA DE APOYO PARA EL DESARROLLO DE UNA METODO BASADO EN ADN-AMBIENTAL PARA LA IDENTIFICACION Y CUANTIFICACION DE UN GRAN NUMERO DE MUESTRAS. LOS BENEFICIOS INMEDIATOS DE LA PUESTA EN MARCHA DE ESTA METODOLOGIA SERAN LA POSIBILIDAD DE DETECTAR UMBRALES DE CONCENTRACION DE PATOGENOS DESENCADENANTES DE ENFERMEDAD, LA OPTIMIZACION DE MODELOS DE PREDICCION DE ENFERMEDADES YA EXISTENTES Y GENERADOS POR NUESTRO GRUPO). A MEDIO PLAZO, ESTA METODOLOGIA NOS FACILITARA LA COMPRENSION SOBRE LA DINAMICA ESPACIO-TEMPORAL DE ESTAS ENFERMEDADES, Y LA IDENTIFICACION DE ESCENARIOS DE RIESGO PARA CULTIVOS, ECOSISTEMAS Y ESPECIES AMENAZADAS. TODO ELLO NOS AYUDARA EN EL DISEÑO DE MEDIDAS PREVENTIVAS Y DE CONTROL MAS EFICIENTES PARA ESTAS ENFERMEDADES EMERGENTES. ONGOS\METABARCODING\ENFERMEDADES EMERGENTES\Y AGRICULTURA\ACUICULTURA\BIODIVERSIDAD\PATOGENOS\OOMYCETES
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