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CPP2021-008989

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Nuevo método para la detección e identificación de patógenos en etapas tempranas...

Nuevo método para la detección e identificación de patógenos en etapas tempranas de infección de cultivos con interés agroindustrial (AgroGenDetec) Las enfermedades producidas por patógenos de plantas, especialmente patógenos fúngicos, tienen un gran impacto en la agricultura y su economía derivada, así como en el manejo de los recursos naturales. El movimiento de germoplasma... ver más

01/01/2021

MICROGAIA BIOTECH

146K€

Presupuesto del proyecto: 146K€

Líder del proyecto

MICROGAIA BIOTECH Está constituido por las siguientes actividades: actividad principal: investigación y desarrollo experimental en biotecnología (cnae: 7211)....

TRL 3-4 | 73K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01

RETOS COLABORACION 21: Proyectos en colaboración público-p... Préstamos de hasta el 95% para la realización de proyectos de desarrollo experimental en cooperación...

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Líder del proyecto

MICROGAIA BIOTECH Está constituido por las siguientes actividades: actividad principal: investigación y desarrollo experimental en biotecnología (cnae: 7211)....

TRL 3-4 | 73K€

Presupuesto del proyecto 146K€

Descripción del proyecto Las enfermedades producidas por patógenos de plantas, especialmente patógenos fúngicos, tienen un gran impacto en la agricultura y su economía derivada, así como en el manejo de los recursos naturales. El movimiento de germoplasma y cualquier otro material vegetal para uso en agricultura, ornamentación y silvicultura puede implicar un gran riesgo de propagación de enfermedades y plagas.El logro del proyecto actual tiene como objetivo desarrollar un nuevo método para la detección e identificación de patógenos fúngicos en infecciones en etapas tempranas mediante la caracterización de la "huella genética" de elementos moleculares que regulan la interacción específica planta-patógeno. Esta huella se basa en pequeños ARN no codificantes (sncRNA) encargados de regular este proceso. Actualmente no existe una herramienta molecular similar capaz de realizar la detección e identificación de patógenos durante las etapas más tempranas de las infecciones. En este contexto, el proyecto se enmarca en la prioridad temática de Alimentación, Bioeconomía, Recursos Naturales y Medio Ambiente.El desarrollo de esta herramienta molecular permitirá dotar al sector Agroalimentario de capacidad de decisión para aplicar medidas tempranas de cuarentena, contención y/o tratamiento de la infección en diferentes cultivos, i) cuando la infección aún no está fenotípicamente desarrollada en el cultivo, y ii) en un tiempo efectivo reduciendo enormemente (y en muchos casos totalmente) las posibles pérdidas económicas debidas a un amplio espectro de infecciones provocadas por patógenos en múltiples cultivos protegiendo la agricultura y la industria agroalimentaria.Las técnicas y métodos disponibles actualmente para la detección e identificación de patógenos fúngicos en cultivos tienen muchas limitaciones, no son lo suficientemente sensibles y efectivos para abordar este problema o simplemente no existen para muchos de los patógenos. Son métodos que no son capaces de realizar una detección de infección en estadios tempranos, limitando su uso a estadios tardíos, cuando existen síntomas visuales y la infección ya se ha establecido y extendido por todo el cultivo. Este proyecto se desarrollará a través de un enfoque multidisciplinar, teniendo un carácter muy innovador desde varios puntos de vista:1) este nuevo método se basa en el papel fundamental de los sncRNAs que juegan durante la patogénesis de la enfermedad tras la invasión de hongos en las plantas al interactuar con diferentes clases de genes de resistencia. Existe un patrón de expresión diferencial de los sncRNAs debido principal y específicamente a los tipos de especies vegetales y la especificidad de los patógenos y sus especies específicas, respectivamente del patógeno y en cada cultivo. Esta gran especificidad se debe a que, ante una infección, y como mecanismo de defensa, cada hongo patógeno ha desarrollado la capacidad de manipular la red reguladora de defensa de las plantas.2) Metodológicamente, utiliza técnicas de última generación muy eficientes basadas en la secuenciación de última generación (NGS de alto rendimiento), metodologías bioinformáticas avanzadas, el desarrollo de pruebas de detección basadas en la relación estructura funcional-secuencia de los sncRNAs, entre otras.3) la eliminación de las limitaciones y debilidades técnicas de los métodos actuales como se mencionó anteriormente.El conocimiento obtenido permitirá desarrollar un método de detección e identificación muy temprana de múltiples patógenos fúngicos en cultivos industriales de gran importancia económica y agrícola, a nivel nacional pero también internacional, además de la detección de patógenos fúngicos en frutos y semillas, mientras del proyecto se pueden derivar otras nuevas aplicaciones como la detección e identificación de otros patógenos que contengan ARN como virus, gusanos, artrópodos o incluso desarrollos aplicables a la identificación de antagonistas y otros organismos benéficos asociados a la planta.

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