DESARROLLO DE MODELOS QUANTITATIVOS PARA ENTENDER LA EVOLUCION DE LAS REDES GENI...
DESARROLLO DE MODELOS QUANTITATIVOS PARA ENTENDER LA EVOLUCION DE LAS REDES GENICAS DE IDENTIDAD CELULAR EN ANIMALES
LOS TIPOS CELULARES SON LA UNIDAD FUNCIONAL BASICA QUE CONSTITUYE A LOS ANIMALES. CADA CELULA EN UN ANIMAL MULTICELULAR COMPARTE LA MISMA INFORMACION GENETICA Y LAS DISTINTAS IDENTIDADES CELULARES SON EL RESULTADO DEL ACCESO DIFER...
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Descripción del proyecto
LOS TIPOS CELULARES SON LA UNIDAD FUNCIONAL BASICA QUE CONSTITUYE A LOS ANIMALES. CADA CELULA EN UN ANIMAL MULTICELULAR COMPARTE LA MISMA INFORMACION GENETICA Y LAS DISTINTAS IDENTIDADES CELULARES SON EL RESULTADO DEL ACCESO DIFERENCIAL A ESTA INFORMACION. A TRAVES DE LA ACCION DE LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION, CADA CELULA ACCEDE A UNA COMBINACION DE ELEMENTOS GENETICOS (GENES Y REGIONES REGULADORAS) QUE CONSTITUYEN LO QUE LLAMAMOS LA RED GENICA DE IDENTIDAD CELULAR. EL DESARROLLO DE LAS NUEVAS TECNOLOGIAS DE GENOMICA DE CELULAS INDIVIDUALES (SINGLE-CELL GENOMICS) HA REVOLUCIONADO EL ESTUDIO DE LA DIVERSIDAD CELULAR EN DISTINTOS ORGANISMOS, PERMITIENDO EL DESARROLLO DE LOS PRIMEROS ATLAS CELULARES IN DISTINTAS ESPECIES. SIN EMBARGO, RECONSTRUIR A PARTIR DE ESTOS ATLAS COMO EVOLUCIONAN LOS TIPOS CELULARES SIGUE REPRESENTADO UN ENORME RETO, DADO QUE ESTOS TIPOS CELULARES SON FENOTIPOS COMPLEJOS DEFINIDOS POR CARACTERES (GENES, ELEMENTOS REGULADORES, ETC.) A MENUDO CON HISTORIAS EVOLUTIVAS DISTINTAS. ADEMAS, HASTA AHORA LOS ESFUERZOS PARA CARACTERIZAR LA DIVERSIDAD CELULAR SE HAN CENTRADO EN ORGANISMOS FILOGENETICAMENTE DISTANTES, COMPLICANDO LA INTERPRETACION EVOLUTIVA. EN ESTE PROYECTO ABORDAREMOS ESTOS PROBLEMAS COMPARANDO REDES GENICAS ENTRE ESPECIES CERCANAS PARA ENTENDER COMO PODEMOS USAR ESTAS REDES GENICAS PARA RECONSTRUIR LA EVOLUCION DE LOS TIPOS CELULARES. A ESTE FIN, COMBINAREMOS GENOMICA FUNCIONAL CON METODOS FILOGENETICOS PARA MODELIZAR Y COMPARAR REDES GENICAS DE IDENTIDAD CELULAR EN MULTIPLES ESPECIES PERTENECIENTES A DOS LINAJES ANIMALES: PLACOZOA Y CNIDARIA. LOS PLACOZOOS SON UN FILO ANIMAL BASAL CON EL PLAN CORPORAL MAS SIMPLE CONOCIDO ENTRE LOS ANIMALES MULTICELULARES (DE VIDA LIBRE) Y COMPUESTO POR MENOS DE 20 TIPOS CELULARES. LOS CNIDARIOS SON UN FILO DIVERSO QUE INCLUYE CORALES, ANEMONAS Y MEDUSAS, Y TIENE UNA POSICION FILOGENETICA CLAVE PARA ENTENDER LA EVOLUCION DEL DESARROLLO EMBRIONARIO Y LA DIVERSIDAD CELULAR ANIMAL. DESARROLLANDO MODELOS CUANTITATIVOS DE LA EVOLUCION DE LAS REDES GENICAS CELULARES PODREMOS ESTABLECER LAS BASES UNA FILOGENIA CELULAR, TRANSFORMANDO NUESTRA CAPACIDAD ENTENDER LA EVOLUCION CELULAR A PARTIR DE DATOS DE GENOMICA FUNCIONAL. SIMULTANEAMENTE, ESTE PROYECTO NOS PERMITIRA CUANTIFICAR LAS DINAMICAS DE DISTINTOS TIPOS DE CAMBIOS (EN CIS Y EN TRANS) EN LA ARQUITECTURA DE LAS REDES GENICAS DE IDENTIDAD CELULAR Y DETERMINAR SU CONTRIBUCION A LA DIVERSIFICACION FUNCIONAL Y EVOLUTIVA DE LOS TIPOS CELULARES. EN CONJUNTO, NUESTRA APROXIMACION DE BIOLOGIA EVOLUTIVA DE SISTEMAS AVANZARA EL CONOCIMIENTO DE LOS PRINCIPIOS FUNDAMENTALES DE LA EVOLUCION CELULAR Y LOS PRINCIPALES DETERMINANTES DE LA EVOLVABILIDAD DE LOS TIPOS CELULARES, AMBOS ASPECTOS CENTRALES PARA ENTENDER EL DESARROLLO Y EVOLUCION ANIMAL. VOLUCION ANIMAL\GENOMICA FUNCIONAL\FILOGENIA MOLECULAR\GENOMICA COMPARADA\BIOLOGIA DE LA CROMATINA\FACTORES DE TRANSCRIPCION\ADAPTACION GENOMICA\DIFERENCIACION CELULAR\EVOLUCION DE SISTEMAS COMPLEJOS\REGULACION GENICA
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