Descripción del proyecto
EL MAYOR DESAFIO AL QUE SE ENFRENTA EL CAMPO DE LA INMUNOTERAPIA DEL CANCER ES RACIONALIZAR Y AMPLIAR LA APLICACION CLINICA DE LOS INHIBIDORES DE PUNTOS DE CONTROL INMUNITARIO (IPCI) EN LA MAYORIA DE PACIENTES (>80%) QUE ACTUALMENTE NO SE BENEFICIAN DE ESTA TERAPIA, LA COMPRENSION MOLECULAR Y LA IMMUNOMONITORIZACION PRE-CLINICA DE COMO EL ESTADO METABOLICO INTRINSECO DE LAS CELULAS TUMORALES Y LOS CAMBIOS METABOLICOS EXTRINSECOS EN LA DISPONIBILIDAD/UTILIZACION DE NUTRIENTES MEDIADOS POR LA DIETA REGULAN TANTO LA EXPRESION DE LOS PUNTOS DE CONTROL INMUNITARIO COMO LA EFICACIA DE LA INMUNOTERAPIA, PODRIAN GUIAR EL USO RACIONAL DE FARMACOS ANTI-METABOLICOS Y DIETAS COMO ESTRATEGIAS PERSONALIZADAS CAPACES DE AMPLIAR EL ESPECTRO DE PACIENTES ONCOLOGICOS SUSCEPTIBLES DE BENEFICIARSE DE LOS IPCIS, ESTE PROYECTO DEFINIRA LAS DEPENDENCIAS METABOLICAS Y LA REGULACION DIETETICA DE LOS MECANISMOS TUMORALES INTRINSECOS DE ESCAPE AL SISTEMA INMUNE Y DE RESISTENCIA A LA INMUNOTERAPIA MEDIANTE EL DESARROLLO DE CUATRO OBJETIVOS COMPLEMENTARIOS: PRIMERO, UN CRIBADO CRISPR DEL ATLAS GENOMICO DEL METABOLISMO PERMITIRA LA IDENTIFICACION DE LAS REDES Y NODOS METABOLICOS ESENCIALES PARA LA EXPRESION CONSTITUTIVA E INDUCIBLE DE LOS PCIS EN LAS CELULAS TUMORALES, PARA PONER DE MANIFIESTO LA RELEVANCIA TERAPEUTICA DE LAS INTERACCIONES ENTRE EL METABOLISMO Y LOS PCIS, LOS CRIBADOS SE LLEVARAN A CABO EN CONDICIONES METABOLICAS SEMEJANTES A LAS EXISTENTES EN EL LIQUIDO INTERSTICIAL TUMORAL, SEGUNDO, LA MONITORIZACION EN TIEMPO REAL DE LA ACTIVIDAD CITOTOXICA DE LOS LINFOCITOS T EN MODELOS CELULARES ISOGENICOS EDITADOS CON CRISPR EN SUS GENES METABOLICOS PONDRA DE MANIFIESTO LAS DEPENDENCIAS METABOLICAS DE MECANISMOS TUMORALES INTRINSECOS DE ESCAPE INMUNOLOGICO INDEPENDIENTES DE LOS PCIS, CON LA ADICION/ELIMINACION ESPECIFICA DE METABOLITOS Y NUTRIENTES CARACTERISTICOS DE CIERTAS INTERVENCIONES DIETETICAS (P, EJ,, RESTRICCION CALORICA, DIETA CETOGENICA, RESTRICCION DE METIONINA, SERINA Y/O GLICINA) DETALLAREMOS LA CAPACIDAD DE LAS MISMAS PARA MODIFICAR LA EXPRESION DE PCIS Y/O OTROS MECANISMOS DE RESPUESTA INMUNE DE LAS CELULAS TUMORALES, ASI COMO PARA GENERAR INTERACCIONES LETALES SINTETICAS EN COMBINACION CON IPCIS, TERCERO, UN ANALISIS INTEGRADO DE LAS DEPENDENCIAS METABOLICAS DE LOS PCIS Y OTROS MECANISMOS INTRINSECOS DE ESCAPE INMUNITARIO CON DATOS TRANSCRIPTOMICOS DISPONIBLES EN EL PROYECTO ATLAS DEL GENOMA DEL CANCER (TCGA) PERMITIRA LA GENERACION DE FIRMAS PAN-TUMORALES IMMUNO-METABOLICAS, EMPLEAREMOS APROXIMACIONES METABOLOMICAS/FLUXOMICAS PARA IDENTIFICAR EL EXO-METABOLOMA SECRETADO EN EL MEDIO EXTRACELULAR POR ESTADOS CELULARES RESISTENTES A LA INMUNOTERAPIA, DEFINIENDO ASI UNA HUELLA METABOLICA QUE PODRIA FACILITAR EL EMPLEO DE BIOPSIAS LIQUIDAS PARA LA MONITORIZACION EN TIEMPO REAL DE LA RESPUESTA A IPCIS, CUARTO, MODELOS MATEMATICOS MULTI-ESCALA PERMITIRAN LA PUESTA A PUNTO DE UNA PLATAFORMA IN SILICO DE ENSAYOS CLINICOS PARA GENERAR MAPAS DE EFICACIA DE ESTRATEGIAS TERAPEUTICAS COMBINANDO INTERVENCIONES METABOLICAS/DIETETICAS E IPCIS, LA DEFINICION DEL CODIGO METABOLICO Y DIETETICO QUE SUBYACE A LOS MECANISMOS TUMORALES INTRINSECOS DE EVASION INMUNOLOGICA Y SENSIBILIDAD/RESISTENCIA A LOS IPCIS ABRIRA UN CAMINO SIN PRECEDENTES EN LA IMPLEMENTACION Y OPTIMIZACION DE LA INMUNOTERAPIA DE PRECISION, LO QUE PERMITIRIA LA CONVERSION METABOLICA DE TUMORES FRIOS QUE SE ESCONDEN DE LOS AGENTES INMUNES EN CALIENTES SENSIBLES A LA INMUNOTERAPIA, CANCER\METABOLISMO\INTERVENCIONES DIETETICAS\AGENTS MIMETICOS DE LA DIETA\PUNTOS DE CONTROL INMUNITARIO\EVASION INMUNITARIA\INMUNOTERAPIA\RESISTENCIA A LA INMUNOTERAPIA\BIOLOGIA COMPUTACIONAL\ENSAYOS CLINICOS IN SILICO