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PID2020-120322RB-C21

Financiado

DELINEANDO EL PERFIL MUTACIONAL DEL SARS COV2 EN LA ISLA DE SICILIA: ASPECTOS FU...

DELINEANDO EL PERFIL MUTACIONAL DEL SARS COV2 EN LA ISLA DE SICILIA: ASPECTOS FUNCIONALES LA PANDEMIA DE COVID-19, UNICA EXPERIENCIA PARABELICA DE ESPAÑA DE LOS ULTIMOS 70 AÑOS, HA MOVILIZADO AL IP DE ESTE SUBPROYECTO Y A SU GRUPO EN UN VERDADERO ESFUERZO DE GUERRA. YA EN EL ESFUERZO ANTI-COVID19 CON UN PROYECTO DE 1 A... ver más

01/01/2020

CSIC

254K€

Presupuesto del proyecto: 254K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2020-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 254K€

Descripción del proyecto LA PANDEMIA DE COVID-19, UNICA EXPERIENCIA PARABELICA DE ESPAÑA DE LOS ULTIMOS 70 AÑOS, HA MOVILIZADO AL IP DE ESTE SUBPROYECTO Y A SU GRUPO EN UN VERDADERO ESFUERZO DE GUERRA. YA EN EL ESFUERZO ANTI-COVID19 CON UN PROYECTO DE 1 AÑO DEL INSTITUTO DE SALUD CARLOS III (DESARROLLAR UNA PROTEINA ANTIVIRAL), AHORA PROPONE EXTENDER SU ESFUERZO TRES AÑOS MAS EXPLOTANDO LA INFRAESTRUCTURA CREADA EN EL IBV-CSIC PARA EL PROYECTO CORTO Y COORDINANDOSE CON UN GRUPO VIROLOGICO DE LA UNIVERSIDAD CH-CEU DE VALENCIA QUE TIENE LINEA DIRECTA CON UN GRAN LABORATORIO DE VIGILANCIA ANTIINFECCIOSA DE SICILIA, AGENTE CENTRAL DEL DIAGNOSTICO POR PCR DEL COVID-19 EN LA ISLA. ITALIA HA DETERMINADO MUY POCAS SECUENCIAS DE GENOMA DE SARS-COV-2 (NINGUNA DE SICILIA). SI SE CONCEDE ESTE PROYECTO COORDINADO, EL GRUPO DEL CEU DETERMINARA AL MENOS 500 SECUENCIAS GENICAS PARA LA PROTEINA DE LA ESPICULA VIRAL (PROTEINA S) EN AISLADOS INDEPENDIENTES DE SARS-COV-2, LA MAYORIA DE SICILIANOS PERO TAMBIEN MUCHAS DE INMIGRANTES AFRICANOS. SE PREVE LA IDENTIFICACION DE NUEVAS VARIANTES EN TAN GRAN ACERVO MUESTRAL. ESTE SUBPROYECTO PROPONE ESTUDIAR LAS CONSECUENCIAS FUNCIONALES E INMUNITARIAS DE LA VARIACION OBSERVADA EN LA PROTEINA S. LA PROTEINA S ES CLAVE EN LA ENTRADA CELULAR DEL VIRUS, DIANA MAYOR DEL SISTEMA INMUNE Y PIEZA CENTRAL DE LAS VACUNAS ANTI-COVID19. NUEVAS VARIANTES DE PROTEINA S PODRIAN TENER FUERTE IMPACTO EN LA CAPACIDAD VIRAL PARA UNIRSE A SU RECEPTOR ACE2, TRADUCIBLE EN CAMBIOS EN INFECCIOSIDAD Y VIRULENCIA, PUDIENDO CAUSAR NUEVAS OLAS DE LA PANDEMIA E INCLUSO SER AGENTES DE ESCAPE AL CONTROL VACUNAL Y DE RESISTENCIA A LOS ANTIVIRALES. POR ESO ES CRUCIAL ESTUDIAR LAS CONSECUENCIAS FUNCIONALES DE CAMBIOS EN LA SECUENCIA DE ESA PROTEINA APARECIDAS EN LA POBLACION, LO QUE CONSTITUYE EL OBJETO GLOBAL DE ESTE SUBPROYECTO. EN PARTICULAR EXAMINAREMOS LOS EFECTOS DE LAS MUTACIONES EN LA PROTEINA S EN SU INTERACCION CON SU RECEPTOR ACE2 EN UNA PIPELINE YA ESTABLECIDA POR EL GRUPO QUE 1) PRODUCE LA PROTEINA S, SU FRAGMENTO S1 Y EL DOMINIO DE UNION AL RECEPTOR (RBD) AISLADO, PERMITIENDO ADEMAS INTRODUCIR EN ELLAS RAPIDAMENTE LAS MUTACIONES DESEADAS; 2) PRODUCE LA FORMA SOLUBLE DE ACE2 HUMANA, MONOMERICA (ACE2SHORT) Y DIMERICA (ACE2LONG); 3) MIDE LA AFINIDAD PARA LAS INTERACCIONES DE LA ESPICULA VIRAL-ACE2 MEDIANTE UNA VARIEDAD DE HERRAMIENTAS BIOFISICAS (RESONANCIA DE PLASMON SPR, INTERFEROMETRIA DE BIOCAPA BLI, TERMOFORESIS, SEC-MALS, ELECTROFORESIS NATIVA, MICROCALORIMETRIA ISOTERMICA). ESTA PIPELINE TAMBIEN SE USARA PARA MONITORIZAR POSIBLES RESISTENCIAS DE LAS FORMAS VIRALES MUTANTES FRENTE A LAS INTERVENCIONES FARMACOLOGICAS PREVENTIVAS Y TERAPEUTICAS (VACUNAS, MABS, ANTIVIRALES). ADEMAS, SE LLEVARAN A CABO ESTUDIOS CRISTALOGRAFICOS (EN QUE EL GRUPO ESTA MUY DUCHO) Y, EVENTUALMENTE, DE CRIOMICROSCOPIA ELECTRONICA (CON AYUDA DE UN GRUPO DE CRIOEM DEL IBV LIDERADO POR EL DR. JOSE LUIS LLACER) PARA DETERMINAR EL IMPACTO ESTRUCTURAL DE LAS MUTACIONES EN LA PROTEINA S CON EL FIN DE COMPRENDER SUS EFECTOS SOBRE LA FUNCIONALIDAD DE DICHA PROTEINA. UN ENSAYO DE ENTRADA CELULAR (CELULAS VERO) CON UN VIRUS PSEUDOTIPADO QUE EXPONE LA PROTEINA S DE LAS DIFERENTES CEPAS DEL SARS-COV-2, ACTUALMENTE EN USO POR VR A TRAVES DE COLABORACION, TAMBIEN PODRIA SER UTILIZADO PARA CORROBORAR EN CELULAS VIVAS LOS EFECTOS OBSERVADOS EN ENSAYOS CON MOLECULAS AISLADAS. ARS-COV-2\FRACASO VACUNAL\RESISTENCIA A ANTIVIRALES\CEPAS VIRALES\EXPRESION EN BACULOVIRUS-CELULAS DE INSE\AFINIDAD ESPICULA-ACE2\VARIANTES DE SECUENCIA\ESPICULA\FILOGENIA MOLECULAR\GENOMA VIRAL

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