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CGL2016-75694-P

Financiado

DECONSTRUYENDO EL ADN RIBOSOMICO: DE LA SECUENCIA AL CROMOSOMA A TRAVES DEL ARBO...

DECONSTRUYENDO EL ADN RIBOSOMICO: DE LA SECUENCIA AL CROMOSOMA A TRAVES DEL ARBOL DE LA VIDA RDNA-LIFE TIENE COMO OBJETIVO EXPLORAR LA DINAMICA EVOLUTIVA DE LOS GENES DEL ARN RIBOSOMICO (ADNR), UN DINAMISMO SORPRENDENTEMENTE ALTO, DADO SU PAPEL CRUCIAL EN LA SINTESIS DE LOS RIBOSOMAS Y POR TANTO EN LA VIDA EN LA TIERRA. E... ver más

01/01/2016

CSIC

161K€

Presupuesto del proyecto: 161K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

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Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2016-01-01

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 161K€

Descripción del proyecto RDNA-LIFE TIENE COMO OBJETIVO EXPLORAR LA DINAMICA EVOLUTIVA DE LOS GENES DEL ARN RIBOSOMICO (ADNR), UN DINAMISMO SORPRENDENTEMENTE ALTO, DADO SU PAPEL CRUCIAL EN LA SINTESIS DE LOS RIBOSOMAS Y POR TANTO EN LA VIDA EN LA TIERRA. EXISTEN CUATRO GENES DE ADNR: EL 18S, EL 5.8S Y EL 26S, CODIFICADOS EN UN SOLO OPERON, Y EL GEN DEL ARNR 5S GENERALMENTE CODIFICADO FUERA DE AQUEL OPERON. ESTOS ADNR ESTAN PRESENTES EN GRAN NUMERO, DE 50 A 13.000 COPIAS POR CELULA, ORGANIZADOS EN TANDEM. SIN EMBARGO, A PESAR DE SU IMPORTANCIA Y ABUNDANCIA, VARIOS ASPECTOS DE LA BIOLOGIA DE ESTAS MOLECULAS ESENCIALES PARA LA VIDA SIGUEN SIENDO ENIGMATICOS, EN PARTICULAR SU MODO DE EVOLUCION, ORGANIZACION GENOMICA, Y REGULACION EPIGENETICA. RDNA-LIFE ASPIRA A DECONSTRUIR EL ADN RIBOSOMICO CON LOS OBJETIVOS DE: (1) DEFINIR EL MODELO DE EVOLUCION MOLECULAR QUE EXPLICA MEJOR EL ALTO DINAMISMO DEL ADNR Y LAS DIFERENCIAS EN FUNCION DEL TIPO DE GEN, (2) EVALUAR EL IMPACTO DE LA EPIGENETICA EN LA EVOLUCION DEL ADNR Y (3) ESTABLECER EL ESCENARIO GLOBAL DE ORGANIZACIONES DE ADNR EN EL ARBOL DE LA VIDA.EL ENFOQUE DE RDNA-LIFE SE CENTRA PRINCIPALMENTE EN EL REINO VEGETAL, Y VAMOS A UTILIZAR COMO MODELOS DOS PARES DE ESPECIES DE LOS GENEROS ARTEMISIA Y TRAGOPOGON. SU PARENTESCO EVOLUTIVO (AMBOS PERTENECEN A LA FAMILIA ASTERACEAE) JUNTO CON LAS DIFERENTES ORGANIZACIONES DE ADNR QUE PRESENTAN (EN ARTEMISIA TODOS LOS GENES DE ARNR ESTAN UNIDOS, MIENTRAS QUE EN TRAGOPOGON EL GEN 5S ESTA SEPARADO DEL RESTO), LOS DIFERENTES TAMAÑOS DE GENOMA, NIVELES DE PLOIDIA, Y NUMEROS Y POSICIONES DE LOS LOCI DE ADNR EN LOS CROMOSOMAS HACEN ATRACTIVO SU ESTUDIO. ADEMAS LA COMPARACION ENTRE AMBOS PROMETE RESULTADOS INTERESANTES.LA SECUENCIACION DE ALTO RENDIMIENTO (NGS) Y LOS AVANCES EN EPIGENETICA VAN A PERMITIRNOS ABORDAR CUESTIONES CENTRALES SOBRE LA EVOLUCION DE ESTOS GENES. OBTENDREMOS NUEVOS CONOCIMIENTOS SOBRE EVOLUCION CONCERTADA, PSEUDOGENIZACION, CONTROL DEL TAMAÑO Y DE LA ESTABILIDAD DEL GENOMA Y SOBRE LA RELACION ENTRE LOS ELEMENTOS TRANSPONIBLES Y EL ADNR. ANTICIPAMOS RESULTADOS DE AMPLIO INTERES PARA LOS BIOLOGOS EVOLUTIVOS QUE MEJORARAN NUESTRA COMPRENSION SOBRE EVOLUCION MOLECULAR. RDNA-LIFE TIENE UN MARCADO CARACTER MULTIDISCIPLINARIO, COMBINANDO BOTANICA, BIOLOGIA EVOLUTIVA, GENOMICA Y EPIGENETICA CON LAS TECNICAS MAS PUNTERAS, INCLUYENDO LA NGS, LA SECUENCIACION BISULFITO DE TODO EL GENOMA Y EL USO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS. RDNA-LIFE IMPLICA TAMBIEN METODOS NANOBIOTECNOLOGICOS PARA PRODUCIR MAPAS GENOMICOS Y EL USO DE LA MICROSCOPIA CONFOCAL PARA OBSERVAR EL ESTADO DE METILACION DE ADNR EN FIBRAS DE ADN EXTENDIDAS. LA VIABILIDAD DEL PROYECTO ESTA GARANTIZADA POR LA ACREDITADA TRAYECTORIA EN EL ESTUDIO DEL ADNR DE LA DRA. SONIA GARCIA (INVESTIGADORA PRINCIPAL, IP) ASI COMO DE LOS MIEMBROS DEL EQUIPO DE TRABAJO. VARIOS DE LOS INVESTIGADORES INVOLUCRADOS EN RDNA-LIFE COLABORAN TAMBIEN EN EL ESTABLECIMIENTO Y MANTENIMENTO DE LA BASE DE DATOS PLANT RDNA DATABASE (WWW.PLANTRDNADATABASE.COM), RECURSO QUE SERA UTILIZADO Y MEJORADO EN EL MARCO DEL PROYECTO. RDNA-LIFE PROMOVERA LA INDEPENDENCIA Y LIDERAZGO CIENTIFICO DE LA IP. POR ULTIMO, ADEMAS DE EXPLORAR CUESTIONES BASICAS DE LAS AREAS DE INVESTIGACION DE LA INSTITUCION DE LA IP (INSTITUTO BOTANICO DE BARCELONA-CSIC), EL PROYECTO CONTRIBUIRA A LA EXCELENCIA CIENTIFICA EN BIOLOGIA EVOLUTIVA A NIVEL NACIONAL E INTERNACIONAL. DN REPETITIVO\TAMAÑO DEL GENOMA.\ORGANIZACIÓN DEL GENOMA\NGS\EVOLUCIÓN MOLECULAR\EPIGENÉTICA\ELEMENTOS TRANSPONIBLES\CROMOSOMAS\BIOINFORMÁTICA\ADN RIBOSÓMICO

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