Descripción del proyecto
LOS MICRORNAS (MIRNAS) SON UNA EXTENSA CLASE DE PEQUEÑOS RNAS NO CODIFICANTES QUE ACTUAN COMO REPRESORES GENICOS A NIVEL POST-TRANSCRIPCIONAL A TRAVES DE LA UNION, POR COMPLEMENTARIEDAD IMPERFECTA, DEL MIRNA AL RNA MENSAJERO DEL GEN QUE REGULAN, CADA MIRNA PUEDE CONTROLAR CENTENARES DE GENES CONSTRUYENDO ASI COMPLEJAS REDES REGULADORES E INFLUENCIANDO TODO TIPO DE PROCESOS BIOLOGICOS, ACTUALMENTE SE RECONOCE EL APORTE FUNDAMENTAL DE LOS MIRNAS A LA DIVERSIDAD FENOTIPICA HUMANA, A LA VEZ QUE SE LES OTORGA UN IMPORTANTE PAPEL EN ENFERMEDAD, AUNQUE DE MANERA GENERAL SE ADMITE QUE LOS MIRNAS POSEEN UNA FUNCION ADAPTATIVA, HASTA EL MOMENTO SOLO UNOS POCOS TRABAJOS HAN ESTUDIADO LOS MIRNAS HUMANOS BAJO UNA PERSPECTIVA EVOLUTIVA POR LO QUE PRACTICAMENTE SE DESCONOCE EN QUE MEDIDA LA SELECCION NATURAL HA ACTUADO SOBRE ESTAS REGIONES: ¿DE ENTRE TODOS LOS MIRNA CUALES SON FUNCIONALMENTE MAS IMPORTANTES Y, POR LO TANTO, SE MANTIENEN POR LA ACCION DE LA SELECCION NATURAL? ¿CUALES SON LAS FUNCIONES ADAPTATIVAS Y FUNCIONALES ASOCIADAS A LAS NOVEDADES EVOLUTIVAS QUE SE HAN GENERADO EN LAS REGIONES DE MIRNAS? ¿SE HAN PRODUCIDO EN EL GENOMA HUMANO FENOMENOS DE DUPLICACION RECIENTES QUE INVOLUCREN A LOS MIRNAS? LA INVESTIGACION PROPUESTA PRETENDE PROPORCIONAR ALGUNAS RESPUESTAS A ESTOS INTERROGANTES AUN SIN RESOLVER, TENIENDO EN CUENTA LA GRAN DIVERSIDAD DE MIRNAS EXISTENTE EN EL GENOMA HUMANO, EL PRINCIPAL OBJETIVO DEL PROYECTO ES DETERMINAR LA RELACION ENTRE SELECCION NATURAL, ESTRUCTURA Y FUNCION EN LAS REGIONES DE MIRNAS, EL PROYECTO SURGE A PARTIR DE SOLIDOS RESULTADOS ANTERIORES, ALGUNOS DE ELLOS OBTENIDOS POR NUESTRO GRUPO, QUE APOYAN FIRMEMENTE EL PAPEL ADAPTATIVO DE LOS MIRNAS EN DIVERSAS POBLACIONES HUMANAS ASI COMO EN SUSCEPTIBILIDAD A ENFERMEDAD, DICHOS ANTECEDENTES APUNTAN AL EXITO DEL PROYECTO Y HACEN CREER QUE ES POSIBLE RESPONDER A LAS PREGUNTAS PREVIAMENTE PLANTEADAS, PREGUNTAS QUE, HASTA EL MOMENTO, HAN SIDO PRACTICAMENTE INEXPLORADAS, EL PRINCIPAL PROPOSITO DEL PROYECTO ES, POR LO TANTO, OBTENER UNA IMAGEN COMPLETA DE LOS PROCESOS EVOLUTIVOS OCURRIDOS RECIENTEMENTE A NIVEL DE LAS REGIONES DE MIRNAS EN EL GENOMA HUMANO, EL PROYECTO, QUE COMBINA ENFOQUES TEORICOS Y COMPUTACIONALES CON TRABAJO EXPERIMENTAL, CONTEMPLA LOS SIGUIENTE OBJETIVOS CONCRETOS: 1,- ESTUDIO DE LA VARIABILIDAD GENETICA (SNPS) Y GENOMICA (VARIANTES DE NUMERO DE COPIA) EN LAS REGIONES DE MIRNAS Y ESTUDIO DE LAS SEÑALES DE SELECCION NATURAL EN DICHAS REGIONES EN POBLACIONES HUMANAS GENETICAMENTE BIEN CARACTERIZADAS, SE REALIZARAN EXPERIMENTOS DE RE-SEQUENCIACION Y CGH EN MUESTRAS DE HAPMAP ASI COMO DIVERSOS TESTS EVOLUTIVOS 2,- ANALISIS DE LA ASOCIACION ENTRE CAMBIOS GENETICOS Y/O GENOMICOS QUE AFECTAN A REGIONES ESPECIFICAS DE MIRNAS Y EL NIVEL DE EXPRESION DE DICHOS MIRNAS (PCR CUANTITATIVA EN RNA DE MUESTRA DE HAPMAP), ASI COMO A NIVEL DE TODO EL TRANSCRIPTOMA (ANALISIS DE DATOS PUBLICOS), 3,- ANALISIS DE LAS CONSECUENCIAS FUNCIONALES DE LAS NOVEDADES EVOLUTIVAS DESCUBIERTAS EN LOS MIRNAS (MUTACIONES Y/O CAMBIOS GENOMICOS DE NUMERO DE COPIA) A TRAVES PRINCIPALMENTE DE EXPERIMENTOS DE TRANSFECCION DE MIRNAS Y ESTUDIOS FUNCIONALES QUE PERMITIRAN DETECTAR DIFERENCIAS EN LOS NIVELES DE REPRESION GENICA O CAMBIOS EN EL ESPECTRO DE GENES DIANA, EL DESARROLLO DEL PROYECTO PROPORCIONARA UNA PANORAMA COMPLETO DE LAS SEÑALES DE ADAPTACION PRESENTES EN LAS REGIONES DE MIRNAS, ASI COMO UNA PERSPECTIVA MAS AMPLIA DE LAS RELACIONES EXISTENTES ENTRE DIVERSIDAD Y FUNCION DEL GENOMA,