DECODING A VIRUS ACHILLES HEEL: THE AFRICAN SWINE FEVER VIRUS INTERACTOME
LAS EPIDEMIAS RECIENTES DEBIDAS A VIRUS HUMANOS O ANIMALES HAN DEMOSTRADO SU ENORME IMPORTANCIA POTENCIAL. EL VIRUS DE LA PESTE PORCINA AFRICANA (VPPA), CONSIDERADO LA MAYOR AMENAZA RE-EMERGENTE PARA LA GANADERIA DESDE QUE HACE 10...
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Descripción del proyecto
LAS EPIDEMIAS RECIENTES DEBIDAS A VIRUS HUMANOS O ANIMALES HAN DEMOSTRADO SU ENORME IMPORTANCIA POTENCIAL. EL VIRUS DE LA PESTE PORCINA AFRICANA (VPPA), CONSIDERADO LA MAYOR AMENAZA RE-EMERGENTE PARA LA GANADERIA DESDE QUE HACE 10 AÑOS SE HA DISEMINADO EN 3 CONTINENTES, EUROPA, ASIA Y AFRICA CAUSANDO UN GRAN IMPACTO SOCIO-ECONOMICO EN LA SALUD ANIMAL. POR LO TANTO, EL RETO PRINCIPAL ES DESARROLLAR ESTRATEGIAS PARA PREVENIR Y CONTROLAR LA ENFERMEDAD MIENTRAS NO HAYA VACUNAS O TRATAMIENTOS DISPONIBLES ESTAS SOLO SE PODRAN DESARROLLAR CONOCIENDO LAS FUNCIONES DE LAS PROTEINAS VIRALES Y SUS INTERACCIONES CON PROTEINAS DEL HUESPED. ESTE CONOCIMIENTO SERA CRITICO PARA ENTENDER COMO LAS PROTEINAS VIRICAS SE DIRIGEN A LAS FUNCIONES CELULARES PARA PERMITIR LA REPLICACION Y DISEMINACION DEL VIRUS. PARA CONSEGUIRLO UTILIZAREMOS BIOLOGIA DE SISTEMAS PARA MAPEAR LAS INTERACCIONES DE FORMA SISTEMATICA. EN EL PROYECTO, 6 PARTICIPANTES DE INSTITUTOS LIDERES EN SALUD ANIMAL (ANSES, FLI, INIA, INRAE, TPI) Y BIOINFORMATICA (UTARTU), COMBINARAN SU EXPERIENCIA EN VPPA E INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA PARA DEFINIR Y VALIDAR EL PRIMER INTERACTOMA DE VPPA. COMO PUNTO DE PARTIDA, SE DESARROLLARA UN ENSAYO DE DOBLE HIBRIDO EN LEVADURAS (Y2H) USANDO 80 PROTEINAS SELECCIONADAS CODIFICADAS POR VPPA COMO CEBO PARA EL MUESTREO DE UNA LIBRERIA DE CDNA DE MACROFAGO PORCINO, LAS CELULAS DIANA DE LA REPLICACION DE VPPA. SE COMPLETARA CON CROMATOGRAFIA DE AFINIDAD Y ESPECTROMETRIA DE MASAS (AP-MS) Y ESTUDIOS FUNCIONALES DE LA RESPUESTA A INTERFERON (IFN) Y LA AUTOFAGIA QUE JUEGAN UN IMPORTANTE PAPEL EN LA VIRULENCIA Y PATOGENESIS DEL VPPA. EN PARALELO A ESTOS ESTUDIOS PROTEOMICOS NO DIRIGIDOS, SE HARAN ESTUDIOS FUNCIONALES DE DETERMINADAS PROTEINAS EN LAS MENCIONADAS VIAS. SE SELECCIONARAN LAS INTERACCIONES MEDIANTE ANALISIS IN SILICO EN BASE A SU PAPEL BIOLOGICO Y/O ALTO GRADO DE CONECTIVIDAD EN EL INTERACTOMA. LAS MAS RELEVANTES SERAN VALIDADAS POR CO-INMUNOPRECIPITACION, AP-MS Y NANOLUC Y2H Y LA AFINIDAD DE UNION CARACTERIZADA POR TERMOFORESIS A MICROESCALA. TRAS CONFIRMAR LAS INTERACCIONES FISICAS POR ANALISIS BIOQUIMICO, SU SIGNIFICACION BIOLOGICA SERA ENSAYADA DE FORMA INDEPENDIENTE EN EL CONTEXTO DE LA INFECCION, MEDIANTE DELECCIONES DE GENES DE LAS PROTEINAS QUE INTERACTUAN O SILENCIANDO INTERACTORES DEL HUESPED. USANDO ESTA ESTRATEGIA, EVALUAREMOS LAS FUNCIONES PRO O ANTIVIRALES POTENCIALES ASOCIADAS A LAS INTERACCIONES IDENTIFICADAS. EL PROYECTO DEL INTERACTOMA DEL VIRUS DE LA PESTE PORCINA AFRICANA ASFVINT SE HA DISEÑADO PARA IDENTIFICAR LAS VIAS DE SEÑALIZACION CELULAR, MODULOS FUNCIONALES Y MAQUINARIA CELULAR QUE SON MANIPULADOS POR EL VIRUS PARA SU PROPIO BENEFICIO O INCLUSO QUE SON ESENCIALES PARA LA REPLICACION DE VPPA. EL CONOCIMIENTO DE ESTAS VIAS REPRESENTA UN RECURSO VALIOSO PARA EL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS ANTIVIRALES. EL DESCIFRAR INTERACCIONES MOLECULARES VIRUS-HUESPED, ABRIRA NUEVAS PERSPECTIVAS PARA PREDECIR FUTURAS EMERGENCIAS Y DESARROLLAR CONTRAMEDIDAS EFECTIVAS PARA EL CONTROL DE LA ENFERMEDAD, TALES COMO COMPUESTOS ANTI-INFECCIOSOS DE AMPLIO ESPECTRO Y VACUNAS FRENTE AL VIRUS DISEÑADAS DE FORMA RACIONAL. ESTE PORCINA AFRICANA\VIRUS ATENUADOS\INMUNIDAD INNATA\FUNCIONALIDAD GENICA\INTERACTOMA
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