Descripción del proyecto
LAS CELULAS MADRE EMBRIONARIAS (EN INGLES, ESCS) SON CELULAS PLURIPOTENTES Y, POR TANTO, POSEEN UN ALTO POTENCIAL EN MEDICINA REGENERATIVA. ADEMAS, REPRESENTAN UN SISTEMA FASCINANTE PARA ESTUDIAR LOS PRINCIPIOS QUE REGULAN LA PLASTICIDAD CELULAR. EL ESTADO PLURIPOTENTE ESTA REGULADO POR VARIOS FACTORES DE TRANSCRIPCION QUE EJERCEN CONTROL SOBRE LA DECISION DE AUTO-RENOVACION O DIFERENCIACION. LAS ESCS SE CARACTERIZAN TAMBIEN POR UN ESTADO DE HIPER-TRANSCRIPCION Y UNA CROMATINA DESCONDENSADA. SORPRENDENTEMENTE, ESTA PLASTICIDAD EPIGENETICA DEPENDE DE LOS ELEVADOS NIVELES DE TRADUCCION DE VARIOS MODIFICADORES DE CROMATINA QUE SE DEGRADAN DE FORMA CONSTANTE. DE HECHO, NUMEROSAS EVIDENCIAS SUGIEREN QUE EL CONTROL POST-TRANSCRIPCIONAL Y TRADUCCIONAL SON PROCESOS FUNDAMENTALES PARA LA PLURIPOTENCIA. POR TANTO, ES NECESARIO REALIZAR UNA CARACTERIZACION SISTEMATICA DE LA SINTESIS Y DEGRADACION DE PROTEINAS PARA ENTENDER MEJOR EL ESTADO PLURIPOTENTE.LA ABUNDANCIA DE UNA PROTEINA ES EL RESULTADO DE SUS TASAS DE SINTESIS Y DEGRADACION, CONOCIDAS CONJUNTAMENTE COMO RECAMBIO PROTEICO. ESTE RECAMBIO DEPENDE DE VARIOS SISTEMAS: RNABP, MIRNAS, CHAPERONAS, EL SISTEMA UBIQUITINA-PROTEASOMA Y LA AUTOFAGIA. EN UN ESTADO BASAL, EL RECAMBIO ES CONSTANTE PARA MANTENER LA HOMEOSTASIS DEL PROTEOMA; PERO EN RESPUESTAS DINAMICAS, LAS TASAS DE SINTESIS Y DEGRADACION VARIAN. EL ESTUDIO DEL RECAMBIO DE PROTEINAS SE PUEDE REALIZAR MEDIANTE LA TECNICA DE SILAC CON EXPERIMENTOS TIPO PULSO. EN ESTOS EXPERIMENTOS DE SILAC DINAMICO, LAS CELULAS SON TRANSFERIDAS A UN MEDIO DE CULTIVO SILAC Y ANALIZADAS A DISTINTOS TIEMPOS. LA TASA CON LA QUE EL PEPTIDO PESADO APARECE REFLEJA SU SINTESIS, MIENTRAS QUE LA DESAPARICION DE LA FORMA LIGERA NOS INFORMA SOBRE SU DEGRADACION.LA HIPOTESIS DE ESTE PROYECTO ES QUE EL ANALISIS SISTEMATICO DEL RECAMBIO DE PROTEINAS EN ESCS NOS PERMITIRA ENTENDER COMO ESTAS CELULAS MANTIENEN EL ESTADO PLURIPOTENTE. PARA ELLO, SE DESARROLLARAN E IMPLEMENTARAN METODOLOGIAS INNOVADORAS PARA ANALIZAR LA DINAMICA DE PROTEINAS EN PLURIPOTENCIA. ESTE SERA UN PROYECTO ALTAMENTE MULTI-DISCIPLINAR QUE INCLUYE ESPECTROMETRIA DE MASAS, PULSOS DE MARCAJE METABOLICO, BIOLOGIA DE CELULAS MADRE, BIOLOGIA MOLECULAR Y BIOINFORMATICA, TODAS ELLAS, AREAS EN LAS QUE POSEO UNA AMPLIA EXPERIENCIA. LA PROPUESTA ESTA ESTRUCTURADA EN TRES OBJETIVOS INTERCONECTADOS:1. MEDIANTE LA COMBINACION DE SILAC DINAMICO Y MARCAJE ISOBARICO, LLEVARE A CABO UN ANALISIS DEL RECAMBIO DE PROTEOMA ASI COMO SUS TASAS DE SINTESIS, Y DEGRADACION EN DIFERENTES ESTADOS PLURIPOTENTES Y DURANTE LA DIFERENCIACION.2. APLICARE ESTA TECNOLOGIA PARA ESTUDIAR COMO ESTAS CELULAS RESPONDEN A DIFERENTES PERTURBACIONES CONTRA LOS TRES ELEMENTOS PRINCIPALES DE LA RED DE PROTEOSTASIS (LA SINTESIS, EL PLEGAMIENTO Y LA DEGRADACION).3. VALIDARE EL PAPEL FUNCIONAL EN EL MANTENIMIENTO DE LA PLURIPOTENCIA DE VARIAS PROTEINAS CANDIDATAS DERIVADAS DE TODOS ESTOS ANALISIS.ESTOS ANALISIS GENERARAN UN MAPA PRECISO DEL CICLO DE VIDA DEL PROTEOMA EN ESCS Y NOS PERMITIRAN ENTENDER DE QUE MANERA EL RECAMBIO DE PROTEINAS REGULA EL ESTADO DE LA PLURIPOTENCIA. ADEMAS, ESTOS DATOS REVELARAN REGULADORES MOLECULARES ESENCIALES PARA EL ESTADO EPIGENETICO CARACTERISTICO DE LAS ESCS. POR ULTIMO, TODO ESTE CONOCIMIENTO SERA IMPORTANTE PARA UN MEJOR CULTIVO DE LAS ESCS Y SU POSIBLE APLICACION EN LA CLINICA. ROTEOMICA\DEGRADACION PROTEICA\SINTESIS PROTEICA\HOMEOSTASIS DEL PROTEOMA\PLURIPOTENCIA\CELULAS MADRE\ESPECTROMETRIA DE MASAS