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PID2020-119451GB-I00

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COMPRENSION DE LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA PARA LA BIOTECNOLOGIA VEGETA...

COMPRENSION DE LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA PARA LA BIOTECNOLOGIA VEGETAL LAS PLANTAS ESTAN EXPUESTAS A UN AMBIENTE VARIABLE, POR LO QUE NECESITAN ADAPTAR SU DESARROLLO, METABOLISMO Y FISIOLOGIA A LAS CONDICIONES LOCALES DE CRECIMIENTO. ESTA PLASTICIDAD ES POSIBLE GRACIAS A LA EXISTENCIA DE REDES TRANSC... ver más

01/01/2020

CSIC

169K€

Presupuesto del proyecto: 169K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 169K€

Descripción del proyecto LAS PLANTAS ESTAN EXPUESTAS A UN AMBIENTE VARIABLE, POR LO QUE NECESITAN ADAPTAR SU DESARROLLO, METABOLISMO Y FISIOLOGIA A LAS CONDICIONES LOCALES DE CRECIMIENTO. ESTA PLASTICIDAD ES POSIBLE GRACIAS A LA EXISTENCIA DE REDES TRANSCRIPCIONALES ESPECIFICAS DE SEÑAL-RESPUESTA QUE VAN A PERMITIR REPROGRAMAR EL DESARROLLO DE LA PLANTA EN FUNCION DE LOS ESTIMULOS MEDIOAMBIENTALES. LA REGULACION DE ESTAS REDES RESIDE EN LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION ESPECIFICOS DE SECUENCIA (TFS), PROTEINAS REGULADORAS RESPONSABLES DE LA ACTIVACION O REPRESION TRANSCRIPCIONAL DE LOS GENES DIANA, GRACIAS AL RECONOCIMIENTO ESPECIFICO DE SECUENCIAS CORTAS DE DNA (TFBS) LOCALIZADAS EN SUS REGIONES REGULADORAS. LA CARACTERIZACION DE LOS TFBS Y DE LOS GENES DIANA HA AVANZADO CONSIDERABLEMENTE EN LOS ULTIMOS AÑOS GRACIAS AL DESARROLLO DE METODOLOGIAS DE ALTO RENDIMIENTO, TANTO "IN VIVO" COMO "IN VITRO", CONTRIBUYENDO A DESCIFRAR EL CODIGO REGULADOR TRANSCRIPCIONAL. SIN EMBARGO, DEBE HABER MUCHOS OTROS FACTORES QUE CONTRIBUYAN AL RECONOCIMIENTO ESPECIFICO DE DIANAS, PERO SOLO ALGUNOS DE ELLOS ESTAN EMPEZANDO A CONOCERSE. RECIENTEMENTE HEMOS DEMOSTRADO LA EXISTENCIA DE SECUENCIAS FLANQUEANTES AL TFBS QUE SON NECESARIAS PARA LA ESPECIFICACION DE LAS DIANAS Y, ADEMAS, HEMOS OBSERVADO EL PAPEL QUE PUEDE JUGAR LA METILACION DE CITOSINAS EN LA UNION DEL TF. EN ESTE PROYECTO, SE PROFUNDIZARA EN ALGUNOS FACTORES CLAVE QUE CONTRIBUYEN A LA ESPECIFICACION DE GENES DIANA Y, MAS IMPORTANTE, SE DISEÑARAN SISTEMAS MODELO CON UNA CLARA VOCACION PARA EXPLORAR SU POTENCIAL BIOTECNOLOGICO. PARA ELLO, SE SEGUIRAN DIFERENTES APROXIMACIONES QUE CONTRIBUIRAN A ALCANZAR LOS SIGUIENTES OBJETIVOS: - OBJETIVO 1. APROXIMACIONES PARA LA DEFINICION DE REGIONES REGULADORAS EN GENOMAS VEGETALES, ENTRE LAS QUE ESTUDIAREMOS EL PAPEL DE TFBS FUERA DE REGIONES PROMOTORAS AGUAS ARRIBA DEL GEN. ADEMAS, DESARROLLAREMOS UNA NUEVA ESTRATEGIA PARA ANALIZAR LA CAPACIDAD DE UNION DE TFS IN VITRO A DNA PROCEDENTE DE CROMATINA ACTIVA (DAP-ON-ATAC).- OBJETIVO 2. REGULACION COMBINATORIA DE LA EXPRESION GENICA EN CONDICIONES AMBIENTALES CAMBIANTES, CON UN INTERES PARTICULAR EN EL ESTUDIO DE LA COOPERACION DE TFS EN LA RESPUESTA A UNA SEÑAL Y A UNA COMBINACION DE ESTRESES AMBIENTALES. - OBJETIVO 3. DISEÑO DE NUEVAS VARIANTES DE TFS ENCAMINADAS A UNA MAYOR ADAPTACION DE LAS PLANTAS AL MEDIO, BIEN POR MANIPULACION DE LA ESTRUCTURA O BIEN MEDIANTE LA EXPLOTACION DE LA VARIACION NATURAL PARA DESCUBRIR VARIANTES ALELICAS DE TFS RELEVANTES PARA LOS FENOTIPOS ADAPTATIVOS. LA CONSECUCION DE LOS OBJETIVOS PROPUESTOS SERA POSIBLE GRACIAS A DIFERENTES ABORDAJES BASADOS EN ESTRATEGIAS DE GENOMICA, GENOMICA COMPARATIVA, BIOLOGIA MOLECULAR Y GENETICA QUE CONTRIBUIRAN A ESTABLECER ALGUNOS PRINCIPIOS MOLECULARES QUE GOBIERNAN EL RECONOCIMIENTO DE DNA Y COMO USARLOS PARA UNA POSIBLE APLICACION BIOTECNOLOGICA. ACTOR DE TRANSCRIPCION\BIOTECNOLOGIA VEGETAL\ELEMENTOS CIS-REGULADORES\REDES TRANSCRIPCIONALES\UNION DNA\GENES DIANA

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