Descripción del proyecto
LAS PLANTAS ESTAN EXPUESTAS A UN AMBIENTE VARIABLE, POR LO QUE NECESITAN ADAPTAR SU DESARROLLO, METABOLISMO Y FISIOLOGIA A LAS CONDICIONES LOCALES DE CRECIMIENTO, ESTA PLASTICIDAD ES POSIBLE GRACIAS A LA EXISTENCIA DE REDES TRANSCRIPCIONALES ESPECIFICAS DE SEÑAL-RESPUESTA QUE VAN A PERMITIR REPROGRAMAR EL DESARROLLO DE LA PLANTA EN FUNCION DE LOS ESTIMULOS MEDIOAMBIENTALES, LA REGULACION DE ESTAS REDES RESIDE EN LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION ESPECIFICOS DE SECUENCIA (TFS), PROTEINAS REGULADORAS RESPONSABLES DE LA ACTIVACION O REPRESION TRANSCRIPCIONAL DE LOS GENES DIANA, GRACIAS AL RECONOCIMIENTO ESPECIFICO DE SECUENCIAS CORTAS DE DNA (TFBS) LOCALIZADAS EN SUS REGIONES REGULADORAS, LA CARACTERIZACION DE LOS TFBS Y DE LOS GENES DIANA HA AVANZADO CONSIDERABLEMENTE EN LOS ULTIMOS AÑOS GRACIAS AL DESARROLLO DE METODOLOGIAS DE ALTO RENDIMIENTO, TANTO IN VIVO COMO IN VITRO, EN LAS QUE NUESTRO LABORATORIO HA HECHO IMPORTANTES APORTACIONES, CONTRIBUYENDO A DESCIFRAR EL CODIGO REGULADOR TRANSCRIPCIONAL, EN LA ACTUALIDAD, Y SE CONOCEN LOS PERFILES DE UNION A DNA DE MAS 850 TFS DE PLANTAS, CUBRIENDO LA MAYOR PARTE DE FAMILIAS Y SUBFAMILIAS DE TFS, LO QUE HA LLEVADO A ESTABLECER ALGUNOS PRINCIPIOS DE LA UNION A DNA DE LOS TFS EUCARIOTAS, SI BIEN ESTE CONOCIMIENTO ESTA COMENZANDO A APORTAR LAS BASES PARA LA IDENTIFICACION DE DIANAS DE TFS, FUNDAMENTALMENTE EN ARABIDOPSIS, AUN DESCONOCEMOS LOS DETERMINANTES QUE PERMITEN EL RECONOCIMIENTO ESPECIFICO DE DETERMINADAS DIANAS, ASI COMO EL EFECTO QUE PUEDEN PRODUCIR OTROS COMPONENTES MODULADORES, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES CONTRIBUIR A ESTABLECER LAS BASES QUE GOBIERNAN EL RECONOCIMIENTO A DNA DE LOS TFS PARA PODER IDENTIFICAR EL CONJUNTO DE DIANAS DE CUALQUIER TF DE CUALQUIER ESPECIE, FUNDAMENTALMENTE A PARTIR DE LA INFORMACION QUE SE OBTENGA DE UNA PLANTA MODELO COMO ES ARABIDOPSIS THALIANA Y DE SU EXTRAPOLACION A OTRAS ESPECIES, SE ABORDARAN PARA ELLO DIFERENTES FACETAS QUE CONSTITUYEN LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS EN LOS QUE SE FUNDAMENTA ESTA PROPUESTA, TAL Y COMO SE INDICA A CONTINUACION:- OBJETIVO 1, ESTUDIO DE LOS DETERMINANTES INTRINSECOS DEL DNA QUE PROMUEVEN SU RECONOCIMIENTO ESPECIFICO, EN ESTA FACETA SE TENDRAN EN CUENTA DIFERENTES COMPONENTES DE FORMA Y ESTRUCTURA DEL DNA QUE CONTRIBUYEN AL RECONOCIMIENTO POR PARTE DEL TF, ASI COMO DE SU CONSERVACION EN ESPECIES PROXIMAS, - OBJETIVO 2, ESTUDIO DE LOS DETERMINANTES DE LOS TFS QUE MODULAN EL RECONOCIMIENTO ESPECIFICO DE DIANAS, AQUI SE ESTUDIARA MEDIANTE DOS ESTRATEGIAS DIFERENTES COMO AFECTA LA HETERODIMERIZACION DE LOS TFS AL RECONOCIMIENTO DEL DNA, ADEMAS, SE ESTUDIARAN OTROS FACTORES INTRINSECOS A LOS TFS QUE PROMUEVEN EL RECONOCIMIENTO DIVERGENTE DEL DNA DE ALGUNOS TFS DE LA FAMILIA DOF, - OBJETIVO 3, DESARROLLO DE UN REPOSITORIO Y MOTOR DE BUSQUEDA PARA LA IDENTIFICACION DE SECUENCIAS CIS-REGULADORAS DE PLANTAS, A TRAVES DE ESTE OBJETIVO, SE RECOPILARA TODA LA INFORMACION DE LA LITERATURA Y LA OBTENIDA EN NUESTRO LABORATORIO PARA CREAR UN MOTOR DE USO PUBLICO Y SENCILLO QUE PERMITA IDENTIFICAR ELEMENTOS CIS-REGULADORES RELEVANTES EN CUALQUIER PROCESO BIOLOGICO DE INTERES Y EN CUALQUIER ESPECIE, EL DESARROLLO DE ESTOS OBJETIVOS CONTRIBUIRA DE FORMA RELEVANTE AL ESTABLECIMIENTO DE LOS PRINCIPIOS QUE DETERMINAN EL RECONOCIMIENTO DE LOS TFS A SUS GENES DIANA, ADEMAS, SE FACILITARA LA TRANSLACION DE ESTE CONOCIMIENTO EN UNA ESPECIE MODELO A PLANTAS CON INTERES AGRONOMICO, FACTOR TRANSCRIPCIONAL\UNIÓN A DNA\DIANAS\REDES TRANSCRIPCIONALES\ELEMENTOS CIS-REGULADORES\PLANTAS