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RTI2018-095118-A-I00

Financiado
COMPLEJOS ARGONAUTA1 DE PLANTAS: IDENTIFICACION DE SUS COMPONENTES PROTEICOS Y D...
COMPLEJOS ARGONAUTA1 DE PLANTAS: IDENTIFICACION DE SUS COMPONENTES PROTEICOS Y DE RNA, Y AJUSTE FINO DEL SILENCIAMIENTO MEDIANTE SU PROGRAMACION POR PEQUEÑOS RNAS ARTIFICIALES LAS PROTEINAS ARGONAUTA (AGO) DE PLANTAS CONSTITUYEN LOS COMPLEJOS EFECTORES QUE REGULAN LAS RUTAS DE SILENCIAMIENTO GENICO MEDIADAS POR PEQUEÑOS RNAS (SRNAS) RESPONSABLES DE PROCESOS BIOLOGICOS TAN IMPORTANTES COMO EL DESARROLLO,... LAS PROTEINAS ARGONAUTA (AGO) DE PLANTAS CONSTITUYEN LOS COMPLEJOS EFECTORES QUE REGULAN LAS RUTAS DE SILENCIAMIENTO GENICO MEDIADAS POR PEQUEÑOS RNAS (SRNAS) RESPONSABLES DE PROCESOS BIOLOGICOS TAN IMPORTANTES COMO EL DESARROLLO, LA REMODELACION DE LA CROMATINA, LA RESPUESTA A ESTRESES Y LA DEFENSA ANTIVIRAL, LAS PROTEINAS AGO INTERACCIONAN CON OTRAS PROTEINAS, Y CARGAN SRNAS QUE LES SIRVEN DE GUIA PARA RECONOCER Y SILENCIAR AQUELLOS RNAS DIANA QUE PRESENTAN UN ALTO GRADO DE COMPLEMENTARIEDAD DE BASES CON RESPECTO AL SRNA GUIA, LAS PROTEINAS AGO PUEDEN SER PROGRAMADAS MEDIANTE SRNAS ARTIFICIALES DISEÑADOS COMPUTACIONALMENTE, CON OBJETO DE SILENCIAR GENES CONCRETOS EN ESTUDIOS DE FUNCION GENICA O EN PROGRAMAS DE MEJORA DE CULTIVOS,AGOAFULL BUSCA DESARROLLAR NUEVO CONOCIMIENTO Y HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS PARA LA MEJORA DE CULTIVOS A LA VEZ QUE PRETENDE ABORDAR DOS CUESTIONES IMPORTANTES DEL CAMPO DE INVESTIGACION DE LAS PROTEINAS AGO DE PLANTAS, EN PRIMER LUGAR, SE DESCONOCE EL CONJUNTO DE INTERACTORES PROTEICOS Y DE RNA DE LAS AGO DE PLANTAS, EMPLEAREMOS UN ABORDAJE MULTIDISCIPLINAR PARA TRATAR DE IDENTIFICAR, A NIVEL GENOMICO, LOS INTERACTOMAS PROTEICO Y DE RNA DE LA PROTEINA AGO1 DE ARABIDOPSIS, PARA LUEGO EVALUAR HASTA QUE PUNTO DICHOS INTERACTOMAS SON DINAMICOS DURANTE LA RESPUESTA A UN ESTRES BIEN CARACTERIZADO COMO ES EL ESTRES SALINO, EN CUANTO A LA IDENTIFICACION DE RNAS DIANA, EMPLEAREMOS NUESTRA RECIENTE METODOLOGIA DE IMMUNOPRECIPITACION DE RNA SEGUIDA DE SECUENCIACION MASIVA (RIP-SEQ) BASADA EN MUTANTES CATALITICOS DE AGO1 PARA AISLAR Y SECUENCIAR LOS RNAS DIANA DE AGO1, EN CUANTO A LA IDENTIFICACION DE INTERACTORES PROTEICOS, PROCEDEREMOS A PURIFICAR POR CROMATOGRAFIA DE AFINIDAD COMPLEJOS AGO1 PREVIAMENTE ETIQUETADOS CON EL EFICIENTE SISTEMA TWIN-STEP TAG O TST, PARA LUEGO ANALIZAR LAS MUESTRAS EN PLATAFORMAS DE ESPECTROMETRIA DE MASAS DE ALTO RENDIMIENTO, EN SEGUNDO LUGAR, ES IMPORTANTE DESTACAR QUE LAS HERRAMIENTAS BASADAS EN SRNAS ARTIFICIALES HAN SIDO OPTIMIZADAS PARA SU BAJO COSTE, ALTO RENDIMIENTO Y ELEVADA EFICACIA DE SILENCIAMIENTO, PERO NO PERMITEN LA REGULACION FINA DE LA ACTIVIDAD DEL SRNA ARTIFICIAL EN CASO DE NECESITAR INDUCIR UN DETERMINADO GRADO DE SILENCIAMIENTO, UTILIZAREMOS NUESTRAS RECIENTES HERRAMIENTAS BASADAS EN SRNAS ARTIFICIALES PARA EXPLORAR SI AGO1 PUEDE SER PROGRAMADA MEDIANTE SRNAS ARTIFICIALES PARA LA REGULACION FINA DE LA EXPRESION GENICA EN ARABIDOPSIS, Y TAMBIEN PARA GENERAR ALTOS NIVELES DE RESISTENCIA ANTIVIRAL EN CULTIVOS DE INTERES AGRONOMICO COMO TOMATE,SI EL PRESENTE PROYECTO SE DESARROLLA DE FORMA EXITOSA, ENTENDEREMOS MUCHO MEJOR COMO LA INFORMACION RELATIVA AL SILENCIAMIENTO ES PROCESADA Y EXPRESADA A NIVEL DE COMPLEJO EFECTOR AGO, Y EN PARTICULAR EN RESPUESTA A ESTRES SALINO, ADEMAS, HABREMOS DESARROLLADO UNA METODOLOGIA QUE PERMITIRA EXAMINAR EN EL FUTURO LOS CAMBIOS EN LOS COMPLEJOS AGO EN RESPUESTA A OTROS ESTRESES BIOTICOS Y ABIOTICOS, ASIMISMO, HABREMOS GENERADO NUEVAS HERRAMIENTAS BASADAS EN SRNAS ARTIFICIALES PARA LA REGULACION FINA DE LA EXPRESION GENICA EN PLANTAS, Y PARA INDUCIR ELEVADOS NIVELES DE RESISTENCIA ANTIVIRAL EN PLANTAS, EN DEFINITIVA, ESPERAMOS QUE TANTO EL CONOCIMIENTO COMO LAS HERRAMIENTAS QUE DESARROLLAREMOS DURANTE ESTE PROYECTO AYUDEN A PLANTEAR APROXIMACIONES BIOTECNOLOGICAS MAS EFICACES EN LA PROTECCION DE CULTIVOS FRENTE A DISTINTOS ESTRESES, Y DE ESTA FORMA SE PUEDA GARANTIZAR LA DISPONIBILIDAD DE ALIMENTO EN LOS AÑOS VENIDEROS, SILENCIAMIENTO MEDIADO POR RNA\ARGONAUTA\PEQUEÑO RNA\PEQUEÑO RNA ARTIFICIAL\RIP-SEQ\ESPECTROMETRÍA DE MASAS\INTERACTOR\REGULACIÓN FINA\RESISTENCIA ANTIVIRAL\PLANTA ver más
01/01/2018
CSIC
145K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 145K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M