Descripción del proyecto
LOS MICROARN (MIRNAS) SON PEQUEÑAS MOLECULAS DE ARN QUE JUEGAN UN PAPEL CRUCIAL EN LA REGULACION GENICA EN PLANTAS. LOS MIRNAS SE PROCESAN A PARTIR DE TRANSCRITOS PRIMARIOS CON UNA ESTRUCTURA DE TALLO-BUCLE CARACTERISTICA (PRI-MIRNAS) POR LA ENZIMA DICER LIKE 1 (DCL1). LOS DUPLEXES DE MIRNA/MIRNA* MADUROS SON METILADOS Y EXPORTADOS AL CITOPLASMA, DONDE INICIAN EL SILENCIAMIENTO DE GENES EN ASOCIACION CON LA PROTEINA ARGONAUTA 1. LA BIOGENESIS DE LOS MIRNAS EN LAS PLANTAS FUE DESCRIPTA POR MUCHO TIEMPO COMO UN MECANISMO DE PROCESAMIENTO DE ARN PASO A PASO SIMILAR AL DE LOS ANIMALES. SIN EMBARGO, DESCUBRIMIENTOS RECIENTES HAN DEMOSTRADO QUE LA BIOGENESIS DE LOS MIRNAS EN LAS PLANTAS ES UN PROCESO DINAMICO Y FLUIDO. POR EJEMPLO, RECIENTEMENTE HEMOS DESCUBIERTO QUE EL PROCESAMIENTO DE MIRNAS PUEDE OCURRIR MIENTRAS LOS PRI-MIRNAS ESTAN AUN UNIDOS A LA RNA POLIMERASA II, LO QUE PROPORCIONA EVIDENCIA DEL ACOPLAMIENTO ENTRE LA TRANSCRIPCION Y EL PROCESAMIENTO DE MIRNAS.RECIENTEMENTE HEMOS DESCUBIERTO QUE EL COMPLEJO DE PROCESAMIENTO DE MIRNAS RECONOCE LOS PRI-MIRNAS NACIENTES, LO QUE SUGIERE QUE EL COMPLEJO SE ENSAMBLA UTILIZANDO EL PRI-MIRNA COMO UN ELEMENTO DE CONGREGACION. SIN EMBARGO, PARA EL MOMENTO EN QUE SE TRANSCRIBE LA REGION DE TALLO-BUCLE DEL PRI-MIRNA, Y PODRIA SER RECONOCIDO POR EL COMPLEJO PROCESADOR, LA TRANSCRIPCION CASI HA CULMINADO. ESTO SUGIERE QUE AL MENOS UNA PARTE DEL COMPLEJO DE PROCESAMIENTO YA ESTA ASOCIADO A LOS LOCI DE MIRNA ANTES DE QUE COMIENCE LA TRANSCRIPCION DE PRI-MIRNA PERMITIENDO ASI UN INICIO RAPIDO DEL PROCESAMIENTO CO-TRANSCRIPCIONAL. POR LO TANTO, HIPOTETIZAMOS QUE EL ACOPLAMIENTO ENTRE LA TRANSCRIPCION Y EL PROCESAMIENTO DE MIRNAS DEPENDE DE UNA RONDA INICIAL DE TRANSCRIPCION PARA PREPARAR EL SISTEMA, LO QUE PERMITE EL RECLUTAMIENTO INICIAL DE PROTEINAS DE ANDAMIO QUE RECLUTAN POSTERIORMENTE EL COMPLEJO DE PROCESAMIENTO A LOS LOCI DE MIRNA. EN ESTE SENTIDO, EL RECONOCIMIENTO INICIAL DE UN PRI-MIRNA NACIENTE POR DCL1 PUEDEDESENCADENAR LA ASOCIACION DE FACTORES ACCESORIOS A LA CROMATINA QUE CODIFICA MIRNAS. ESTAS PROTEINAS PODRIAN PERMANECER ASOCIADAS INCLUSO SIN ACTIVIDAD TRANSCRIPTICIONAL Y FACILITAR EL ENSAMBLAJE DEL COMPLEJO Y EL PROCESAMIENTO DE PRI-MIRNAS EN RONDAS SUBSIGUIENTES DE TRANSCRIPCION. BASADO EN NUESTROS RESULTADOS ANTERIORES, ES POSIBLE QUE DICHO "PRIMING" DEL PROCESAMIENTO CO-TRANSCRIPTIONAL DEPENDA DE LA INTERACCION ESTABLE DE ALGUNAS PROTEINAS INVOLUCRADAS EN LA BIOGENESIS DE MIRNA CON R-LOOPS QUE SE ENCUENTRAN CERCA DE LOS SITIOS DE INICIO DE TRANSCRIPCION DE GENES MIRNA.EN ESTE PROYECTO, NUESTRO OBJETIVO ES EXPLORAR ESTAS HIPOTESIS AL RESPONDER LAS SIGUIENTES PREGUNTAS: ¿COMO RECONOCE EL COMPLEJO DE PROCESAMIENTO LOS LOCI DE MIRNA Y CUAL ES LA DINAMICA DEL PROCESAMIENTO CO-TRANSCRIPTIONAL DE MIRNA? ¿Y POR QUE LOS R-LOOPS EN GENES MIRNA PROMUEVEN EL ACOPLAMIENTO ENTRE LA TRANSCRIPCION Y EL PROCESAMIENTO? AL ABORDAR ESTAS PREGUNTAS, NUESTRO OBJETIVO ES ARROJAR LUZ SOBRE LOS INTRINCADOS PROCESOS SUBYACENTES A LA BIOGENESIS DE MIRNA EN LAS PLANTAS Y OBTENER UNA COMPRENSION MAS PROFUNDA DE LAS IMPLICACIONES FUNCIONALES DE NUESTROS RECIENTES DESCUBRIMIENTOS. ARNS PEQUEÑOS\SILENCIAMIENTO GENICO\EPIGENETICA\R-LOOPS\TRANSCRIPCION\MIRNA\MICRO ARNS