CARACTERIZACION DE NUEVOS RIBOZIMAS DE AUTOCORTE Y RNAS CIRCULARES EN EUCARIOTAS...
CARACTERIZACION DE NUEVOS RIBOZIMAS DE AUTOCORTE Y RNAS CIRCULARES EN EUCARIOTAS: MECANISMOS, FUNCIONES Y POTENCIAL APLICACION BIOTECNOLOGICA
EN LOS ULTIMOS AÑOS, EL ESTUDIO DEL RNA HA DADO LUGAR A INFINIDAD DE AVANCES EN BIOLOGIA. DESDE SU DESCUBRIMIENTO COMO INTERMEDIARIO EN TRADUCCION, PASANDO POR SU ROL CLAVE EN SINTESIS PROTEICA O LOS MAS RECIENTES DESCUBRIMIENTOS...
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Descripción del proyecto
EN LOS ULTIMOS AÑOS, EL ESTUDIO DEL RNA HA DADO LUGAR A INFINIDAD DE AVANCES EN BIOLOGIA. DESDE SU DESCUBRIMIENTO COMO INTERMEDIARIO EN TRADUCCION, PASANDO POR SU ROL CLAVE EN SINTESIS PROTEICA O LOS MAS RECIENTES DESCUBRIMIENTOS EN EL CAMPO DE LOS RNAS NO CODIFICANTES, LAS FUNCIONES DEL RNA NO PARECEN TENER FIN. EL PUNTO DE INFLEXION SOBRE NUESTRO CONOCIMIENTO DEL RNA SE DIO EN LOS AÑOS 80 CON EL DESCUBRIMIENTO DE LOS RNAS CATALITICOS O RIBOZIMAS. PARADOJICAMENTE, Y HASTA HACE SOLO UNOS AÑOS, EL ESTUDIO DE LA MAYORIA DE RIBOZIMAS HABIA QUEDADO RESTRINGIDO A RAROS EJEMPLOS EN AGENTES INFECCIOSOS DE RNA CIRCULAR. EN 2010, MI GRUPO ABRIO UNA NUEVA LINEA DE TRABAJO AL DESCUBRIR LA UBICUIDAD DE PEQUEÑOS RNAS CATALITICOS COMO LA RIBOZIMA MODELO DE CABEZA DE MARTILLO O HAMMERHEAD (HHR), ENCONTRANDO MULTITUD DE HHR GENOMICAS DESDE BACTERIAS A ANTI-ONCOGENES HUMANOS, CON FUNCIONES BIOLOGICAS AUN POR CARACTERIZAR. EN NUESTRO ULTIMO PROYECTO DEL PLAN NACIONAL I+D+I (2018-2020) DEMOSTRAMOS QUE LAS HHRS NO SOLO ESTAN EN RETROTRANSPOSONES MINIMOS (O RETROZIMAS) TIPO LTR DE PLANTAS, SINO TAMBIEN EN RETROZIMAS TIPO NO-LTR DE ANIMALES. DE FORMA ANALOGA A LO VISTO EN PLANTAS, LOS RETROZIMAS DE ANIMALES SE EXPRESAN ABUNDANTEMENTE COMO PEQUEÑOS RNAS CIRCULARES SIMILARES A AGENTES SUBVIRALES DE PLANTAS. RECIENTEMENTE, HEMOS EXTENDIDO Y PERFECCIONADO NUESTRAS BUSQUEDAS BIOINFORMATICAS, ENCONTRANDO VARIANTES TOTALMENTE NUEVAS DE LAS RIBOZIMAS TWISTER Y HHR EN MULTITUD DE GENOMAS EUCARIOTAS, ASI COMO EN NOVEDOSOS RNAS VIRALES TIPO HEPATITIS DELTA DE ANIMALES. ESTAS RIBOZIMAS ESTARIAN IMPLICADAS TANTO EN FAMILIAS DE RETROTRANSPOSONES Y RNAS CIRCULARES, COMO EN PROCESOS DE DOMESTICACION FUNCIONAL RELACIONADAS CON EL SPLICING Y REGULACION DE DIVERSOS GENES EN ANIMALES. EN EL PRESENTE PROYECTO QUEREMOS EN PRIMER LUGAR ESTUDIAR CON DETALLE EL MECANISMO DE AUTOCORTE CATALIZADO POR LAS RIBOZIMAS DESCUBIERTAS, QUE EN EL CASO DE LAS HHR PARECEN UTILIZAR UN NOVEDOSO SISTEMA DE CORTE DEL RNA A LARGA DISTANCIA. POR OTRO LADO, QUEREMOS ESTUDIAR LAS RIBOZIMAS DETECTADAS COMO MOTIVOS CONSERVADOS EN INTRONES DE DIVERSOS GENES DE ABEJAS MELIFERAS (GENUS APIS) USANDO PLANTAS COMO SISTEMA MODELO. DATOS PRELIMINARES SUGIEREN QUE ESTAS RIBOZIMAS TENDRIAN UN PAPEL TANTO EN EL SPLICING DEL PRE-MRNA (SIMILAR AL PROPUESTO PARA RIBOZIMAS INTRONICAS DE MAMIFEROS) COMO EN FENOMENOS DE REGULACION GENICA VIA CIRCRNAS. YA POR ULTIMO, Y BASANDONOS EN NUESTRA EXPERIENCIA EN PEQUEÑAS RIBOZIMAS DE CORTE Y EN CIRCRNAS GENOMICOS, EN ESTE PROYECTO QUEREMOS DESARROLLAR UNA NUEVA HERRAMIENTA BIOTECNOLOGICA BASADA EN RNAS CIRCULARES. ESTE ULTIMO OBJETIVO CONSISTIRA EN EL DISEÑO DE PEQUEÑOS CIRCRNAS (200-1,000 NT) CONTENIENDO EN SU SECUENCIA MULTIPLES RIBOZIMAS (DE ENTRE 40-60 NT CADA UNA) DIRIGIDAS CONTRA UN RNA DIANA, QUE BIEN PUEDE SER UN RNA CELULAR (CON OBJETO DE CONTROLAR LA EXPRESION GENICA) O TAMBIEN VIRAL (CON OBJETO DE DESARROLLAR UN POTENCIAL FARMACO CONTRA CUALQUIER VIRUS DE RNA). CONSIDERAMOS QUE GRACIAS AL CONOCIMIENTO Y AVANCES RECIENTES EN EL CAMPO DE LAS RIBOZIMAS, UNIDO A LA ELEVADA ESTABILIDAD Y ACUMULACION OBSERVADA EN NUESTROS CIRCRNAS GENOMICOS, ESTA PROPUESTA DE UNA NUEVA GENERACION DE TIJERAS MOLECULARES EMBEBIDAS EN CIRCRNAS (SCISSCIRCS) TIENE UN ELEVADO POTENCIAL BIOTECNOLOGICO QUE DEBE SER EXPLORADO. IBOZIMAS\VIRUS DE RNA\RNA CIRCULAR\SPLICING\RETROTRANSPOSONES
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