Descripción del proyecto
LA INVESTIGACION EN EL CAMPO DEL RNA ES PROBABLEMENTE UNA DE LAS AREAS DE CONOCIMIENTO QUE MAS NOVEDADES HA GENERADO EN BIOLOGIA DURANTE LAS ULTIMAS DECADAS, DESTACANDO ESPECIALMENTE LOS AVANCES EN RNAS NO CODIFICANTES (NCRNAS) RESPONSABLES DE IMPORTANTES PROCESOS BIOLOGICOS, ESTOS NCRNAS VAN DESDE PEQUEÑAS (Y LARGAS) SECUENCIAS DE "RNAS GUIA" IMPLICADOS DE RUTAS DE DEFENSA Y REGULACION, TALES COMO EL RNAI/SILENCIAMIENTO EN EUCARIOTAS O CRISPR EN PROCARIOTAS, HASTA MOTIVOS DE RNA ESTRUCTURADOS COMO RIBOSWITCHES Y RIBOZIMAS, ENTRE MUCHOS OTROS, EN 2010, MI GRUPO ABRIO UNA NUEVA LINEA DE TRABAJO SOBRE NCRNAS AL DESCUBRIR LA IMPORTANCIA Y UNIVERSALIDAD DE LOS PEQUEÑOS RNAS CATALITICOS COMO EL RIBOZIMA MODELO HAMMERHEAD, HISTORICAMENTE, ESTE Y OTROS PEQUEÑOS RIBOZIMAS DE AUTOCORTE SE VENIAN CONSIDERANDO COMO CURIOSIDADES BIOLOGICAS, PERO NOSOTROS HEMOS DEMOSTRADO QUE EN REALIDAD ESTAN CONSERVADOS EN MULTITUD DE GENOMAS DESDE PROCARIOTAS A METAZOOS, INCLUYENDO ANTI-ONCOGENES HUMANOS, CON FUNCIONES AUN POR CARACTERIZAR, EL ANTERIOR PROYECTO DEL PLAN NACIONAL I+D+I (2015-2017) NOS HA PERMITIDO DESCUBRIR QUE, EN PLANTAS, MUCHOS DE LOS RIBOZIMAS GENOMICOS ESTAN IMPLICADOS EN LA ACUMULACION CELULAR DE UNA NOVEDOSA FORMA DE RNAS CIRCULARES SIMILARES A AGENTES SUBVIRALES COMO SATELITES VIRALES Y VIROIDES, PERO QUE EN REALIDAD HAN RESULTADO SER UNA FAMILIA SINGULAR DE RETROELEMENTOS EUCARIOTICOS NO DESCRITA HASTA LA FECHA, Y QUE HEMOS DENOMINADO RETROZIMAS, ESTOS RESULTADOS, UNIDOS A NUESTROS DESCUBRIMIENTOS PREVIOS DE RIBOZIMAS EN RETROTRANSPOSONES TIPO PENELOPE DE PROTISTAS, PLANTAS, HONGOS Y ANIMALES, NOS HAN PERMITIDO DESVELAR LA IMPORTANCIA DE LOS RNAS CATALITICOS EN LA RETROTRANSPOSICION DEL RNA/DNA EN EUCARIOTAS, EN ESTE NUEVO PROYECTO QUEREMOS ESTUDIAR LOS MECANISMOS QUE ESTOS RIBOZIMAS UTILIZAN DURANTE LA MOVILIZACION DE LOS RETROTRANSPOSONES USANDO PLANTAS COMO SISTEMA MODELO, ADEMAS, Y COMBINANDO APROXIMACIONES BIOINFORMATICAS Y MOLECULARES, QUEREMOS EXPLORAR DIVERSAS FAMILIAS DE RETROTRANSPOSONES EN PLANTAS Y ANIMALES QUE NOS PERMITIRAN CONOCER NUEVOS DETALLES FUNCIONALES DE ESTOS ELEMENTOS, ASI COMO IDENTIFICAR POSIBLES NUEVOS RNAS CATALITICOS Y REGULADORES, DENTRO DE ESTA LINEA, CARACTERIZAREMOS LOS RIBOZIMAS TIPO TWISTER QUE RECIENTEMENTE HEMOS DETECTADO EN CIERTOS RETROTRANSPOSONES DE PLANTAS Y ANIMALES, PARA ELLO, NOS CENTRAREMOS EN EL ANALISIS DE LAS NUMEROSAS COPIAS TWISTER DETECTADAS EN EL GENOMA DE MANZANO (MALUS DOMESTICA), POR ULTIMO, CONTINUAREMOS LA CARACTERIZACION DE LOS RETROZIMAS DE PLANTAS Y LOS ABUNDANTES RNAS CIRCULARES ASOCIADOS A ESTE RETROELEMENTO, PLANTAS TRANSGENICAS QUE EXPRESAN CIRCRNAS SERAN CARACTERIZADAS MOLECULARMENTE CON EL OBJETIVO DE CONFIRMAR LAS DIVERSAS HIPOTESIS EN RELACION A ESTOS ABUNDANTES RNA CIRCULARES, TALES COMO SUS CAPACIDADES AUTOREPLICATIVAS Y/O DE EDITADO, EL PORQUE DE SUS ALTOS NIVELES DE ACUMULACION (ESTUDIO DE PROMOTORES VERSUS ESTABILIDAD DEL CIRCRNA), SU LOCALIZACION SUBCELULAR O SU POSIBLE PAPEL EN OTRAS FUNCIONES BIOLOGICAS DENTRO DE LA PLANTA (EJ, ESPONJAS DE PEQUEÑOS RNAS), DENTRO DE ESTA LINEA DE ESTUDIO SOBRE LOS RETROZIMAS, TAMBIEN QUEREMOS CONFIRMAR LA PRESENCIA DE RNAS CIRCULARES CON HAMMERHEADS EN ANIMALES, TANTO INVERTEBRADOS COMO VERTEBRADOS, LO QUE NOS PERMITIRA GENERALIZAR LA PRESENCIA DE LA FAMILIA DE RETROZIMAS DENTRO DEL REINO EUCARIOTA, ASI COMO ABRIR LA PUERTA A UNA NUEVA HERRAMIENTA BIOTECNOLOGICA BASADA EN ESTOS ENIGMATICOS CIRCULOS DE RNA, RNA CIRCULAR\RIBOZIMA\RETROTRANSPOSON\GENÓMICA