Descripción del proyecto
LA FRESA (FRAGARIA X ANANASSA) ES UNO DE LOS CULTIVOS FRUTALES MAS POPULARES GRACIAS AL SABOR Y AROMA UNICOS DE SUS FRUTOS, SIENDO ESTOS DOS CARACTERES PARAMETROS CLAVE DE LA CALIDAD, Y LOS CUALES SE ADQUIEREN DURANTE EL PROCESO DE MADURACION. LA MADURACION DE LA FRESA ES UN PROCESO GENETICAMENTE PROGRAMADO Y ALTAMENTE COORDINADO QUE CONDUCE A CAMBIOS ESTRUCTURALES Y BIOQUIMICOS COMO EL ABLANDAMIENTO DE LOS RECEPTACULOS Y EL AUMENTO DEL CONTENIDO DE AZUCARES, ANTOCIANINAS, COMPUESTOS VOLATILES Y VITAMINAS. ADEMAS DEL PAPEL YA CONOCIDO DE DIFERENTES FITOHORMONAS EN EL CONTROL DE LA MADURACION DEL FRUTO DE FRESA, TAMBIEN SE HAN IDENTIFICADO VARIOS FACTORES DE TRANSCRIPCION (TFS) COMO REGULADORES IMPORTANTES DE PROCESOS ESPECIFICOS RELACIONADOS CON LA MADURACION. SIN EMBARGO, SE HAN DESCRITO POCOS REGULADORES CON UN PAPEL GENERAL EN LA REGULACION DE LA MADURACION DE LA FRESA HASTA LA FECHA. POR LO TANTO, NUESTRO GRUPO ESTA INTERESADO EN LA IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DE TFS CENTRALES EN DICHA REGULACION, ASI COMO EN DESCIFRAR SUS REDES GENICAS REGULADORAS (GRNS) ASOCIADAS. UN ESTUDIO TRANSCRIPTOMICO GLOBAL DURANTE LA MADURACION DEL FRUTO DE FRESA NOS PERMITIO IDENTIFICAR UNA SERIE DE TFS CANDIDATOS PARA DESEMPEÑAR UN PAPEL IMPORTANTE EN ESTE PROCESO. ENTRE ELLOS, SELECCIONAMOS DOS TF PARA ESTUDIOS FUNCIONALES: FARIF Y FARPL, QUE PERTENECEN A LAS FAMILIAS NAC Y TALE DE TF RESPECTIVAMENTE, GENERANDO LINEAS DE SILENCIAMIENTO MEDIANTE RNAI Y DE SOBREEXPRESION PARA AMBOS GENES. UNA CARACTERIZACION EXHAUSTIVA DE LAS LINEAS FARIF Y UN ANALISIS FENOTIPICO BASICO DEL FARPL CONFIRMARON QUE ESTOS DOS TF SON ESENCIALES PARA LA REGULACION DE LA MADURACION DE FRESA.POR LO TANTO, EN ESTE PROYECTO, ESTUDIAREMOS MAS A FONDO EL PAPEL BIOLOGICO DE ESTOS TFS. BREVEMENTE, UNO DE LOS OBJETIVOS SERA DESCIFRAR EL MECANISMO MOLECULAR POR EL CUAL FARIF CONTROLA LA MADURACION DEL FRUTO DE FRESA, IDENTIFICANDO SUS GENES DIANA, ASI COMO SUS PROTEINAS INTERACTORAS. ADEMAS, GENERAREMOS LINEAS MUTANTES CRISPR/CAS9 PARA ESTUDIAR MAS A FONDO EL PAPEL BIOLOGICO DE ESTE TF. POR OTRO LADO, REALIZAREMOS UNA CARACTERIZACION FENOTIPICA Y MOLECULAR EXHAUSTIVA DE FARPL, CON EL FIN DE CONOCER QUE GENES, PROCESOS Y VIAS METABOLICAS ESTAN REGULADAS POR ESTE TF. ADEMAS, PUESTO QUE FARPL NO SOLO SE EXPRESA DURANTE LA MADURACION DEL FRUTO, SINO TAMBIEN EN TEJIDOS MERISTEMATICOS, EN ESTE PROYECTO ESTUDIAREMOS SU PAPEL ESPECIFICO EN LA PROMOCION DE LA MADURACION MEDIANTE LA GENERACION DE LINEAS DE RNAI QUE SILENCIARAN ESPECIFICAMENTE LA EXPRESION DE FARPL EN EL FRUTO Y NO EN LOS MERISTEMOS. FINALMENTE, REALIZAREMOS UN ESTUDIO DE ASOCIACION UTILIZANDO TODOS LOS DATOS OMICOS OBTENIDOS PARA FARIF Y FARPL PARA OBTENER UNA VISION INTEGRADA DE LOS PROCESOS Y GENES QUE REGULAN, ASI COMO LOS CAMBIOS METABOLICOS QUE CONLLEVA ESA REGULACION.SE HAN ESTUDIADO EL PAPEL DE VARIOS GENES ESTRECHAMENTE RELACIONADOS CON FARIF Y FARPL EN DIFERENTES ESPECIES. ESTOS TFS REGULAN PROCESOS DE DESARROLLO COMPLETAMENTE DIFERENTES, COMO LA SENESCENCIA, APERTURA O ABSCISION DE FRUTOS DE ARABIDOPSIS, MAIZ Y ARROZ, ASI COMO LA MADURACION EN FRUTOS DE TOMATE. SIN EMBARGO, TODOS CONDUCEN FINALMENTE A LA DISPERSION DE SEMILLAS, QUE ES TAMBIEN LA CONSECUENCIA FINAL DE LA MADURACION DE FRUTOS DE FRESA. POR LO TANTO, EN ESTE PROYECTO REALIZAREMOS ESTUDIOS DE COMPLEMENTACION EN ARABIDOPSIS Y MUTANTES DE TOMATE PARA DETERMINAR EL GRADO DE CONSERVACION EVOLUTIVA DE LA FUNCION BIOLOGICA DE ESTOS TFS. RAGARIA\CRISPR/CAS9\CHIP-SEQ\METABOLOMICA\TRANSCRIPTOMICA\FACTOR DE TRANCRIPCION\RED GENICA REGULATORIA\MADURACION\FRUTO\FRESA