Descripción del proyecto
EL PROYECTO SOLICITADO ES UN PROYECTO DE GENOMICA FUNCIONAL EN FRUTO DE FRESA, ES CONTINUACION DE ANTERIORES PROYECTOS EN LOS QUE SE HAN GENERADO DATOS MOLECULARES Y FUNCIONALES QUE HAN POSIBILITADO NO SOLO LA ELUCIDACION DEL PAPEL QUE JUEGAN DETERMINADOS GENES EN LA MADURACION DEL FRUTO DE FRESA Y RELACIONADOS CON LA CALIDAD DE FRUTO, SINO QUE TAMBIEN SE HAN DESARROLLADO METODOLOGIAS Y GENERADO HERRAMIENTAS MOLECULARES SUSCEPTIBLES DE SER APLICADAS AL PRESENTE PROYECTO,EL PROYECTO QUE SE SOLICITA TIENE TRES OBJETIVOS PRINCIPALES Y UN OBJETIVO MENOR, EL PRIMERO DE LOS OBJETIVOS PRINCIPALES ESTA ENFOCADO AL ESCLARECIMIENTO DE LA FUNCION QUE DESEMPEÑAN 4 FACTORES DE TRANSCRIPCION, EN LA REGULACION DE LOS PROCESOS QUE MOTIVAN EL DESARROLLO Y MADURACION DEL RECEPTACULO DEL FRUTO DE FRESA (FRAGARIA X ANANASSA)(GENES FASTYLE 2,1, FAYABBY, FAMYB 10 (R2R3), FADOF, FANAC), UN SEGUNDO OBJETIVO, ES LA DETERMINACION DE LA FUNCION FISIOLOGICA QUE, EN EL PROCESO ESTUDIADO, DESEMPEÑAN GENES CUYA EXPRESION ES EXCLUSIVAMENTE INDUCIBLE EN LA FASE DE MADURACION DEL FRUTO, ES ESPECIFICA DE FRUTO Y NO POSEEN HOMOLOGIA DE SECUENCIA CON LA DE OTROS GENES DESPOSITADOS EN LAS BASES DE DATOS (GENES FAC25A11 Y FAFRA1914), EL TERCER OBJETIVO, MUY APLICADO BIOTECNOLOGICAMENTE, ES LA OBTENCION DE HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS ADECUADAS PARA LLEVAR A CABO APROXIMACIONES DE CISGENIA EN FRUTOS DE FRESA Y ORIENTADAS A UNA MEJORA TANTO DE SU CALIDAD COMO DE LAS CARACTERISTICAS SALUDABLES DEL MISMO, TAMBIEN SE INCLUYE EN ESTE OBJETIVO LA REALIZACION DE UNA PRUEBA DE FUNCION, EL OBJETIVO MENOR, ESTA REFERIDO A LA GENERACION DE UN MICROARRAY DE FRESA DE OLIGOS QUE CONTENGA UNA REPRESENTACION DE TODOS LOS GENES DEL GENOMA DE FRAGARIA, PARA PODER ABORDAR ESTOS OBJETIVOS SE PROPONE UN PLAN DE TRABAJADO BASADO EN: A) TRANSGENESIS, APROXIMACION METODOLOGICA MAS EFECTIVA, EN FRESA, PARA OBTENER INFORMACION DIRECTA RELACIONADA CON LA FUNCION DE GENES IMPLICADOS EN LA MADURACION DEL FRUTO,2) B) UTILIZACION DE HERRAMIENTAS MOLECULARES, DESARROLLADAS EN PROYECTOS ANTERIORES EN EL GRUPO SOLICITANTE PARA EL CASO DE FRESA (MICROARRAYS, LASER CAPTURE MICRODISSECTION, QRT-PCR, SISTEMAS GATEWAY, ETC,) O COLABORACIONES CON OTROS GRUPOS DE INVESTIGACION (METABOLOMICA Y AGROINFILTRACIONES), DE ACUERDO CON LO ANTERIORMENTE INDICADO SE PROPONE UN PLAN DE TRABAJO QUE CONTIENE TRES GRUPOS DE ACTIVIDADES, 1) GENERACION DE 4 LINEAS TRANSGENICAS QUE SOBRE-EXPRESEN Y 1 LINEA TRANSGENICA QUE SILENCIE LA EXPRESION DE LOS GENES QUE CODIFICAN 5 FACTORES DE TRANSCRIPCION Y CUYA EXPRESION ES INDUCIBLE EN ESTADIOS DE MADURACION Y SENESCENCIA DEL RECEPTACULO DEL FRUTO (OXFASTYLE 2,1; OXFAYABBY; OXFADOF; OXFANAC; RNAIFAMYB 10), LOS FRUTOS DE LA LINEAS TRANSGENICAS SE EVALUARAN FENOTIPICA, MOLECULAR, TRANSCRIPTOMICA Y METABOLOMICAMENTE, 2) GENERACION DE 2 LINEAS TRANSGENICAS CON LA EXPRESION DE LOS GENES FAC25A11 Y FAFRA1914 SILENCIADA (FAC25A11-RNAI Y FAFRA1914-RNAI), SE PROCEDERA AL MISMO TIPO DE EVALUACION QUE LA DE LOS FRUTOS DE LAS LINEAS ANTERIORES, 3) EVALUACION TRANSCRIPTOMICA DE VARIEDADES SILVESTRES DE FRAGARIA DEL BANCO DE GERMOPLASMA DE FRESA, CLONAJE DE GENES DE INTERES Y PRUEBA DE FUNCION DE LA EXPRESION DE UNO DE ELLOS PARA APROXIMACIONES DE CISGENIA, 4) ANALISIS BIOINFORMATICO DE LA SECUENCIA DEL GENOMA DE FRAGARIA Y SELECCION DE GENES NO CONTENIDOS EN EL MICROARRAY DE 18K, GENERACION DE UN NUEVO MICROARRAY DE OLIGOS QUE CONTENGA REPRESENTADO TODO EL GENOMA DE FRAGARIA,