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CGL2015-70750-P

Financiado

CAMBIOS TRANSCRIPTOMICOS PROVOCADOS POR UN PARASITO INTRAGENOMICO

EL PARASITISMO ES MUY FRECUENTE EN LA NATURALEZA DISFRAZADO DE MULTIPLES MANERAS Y A DISTINTOS NIVELES, DESDE GENES A ESPECIES, EL RECIENTE DESARROLLO DE LA SECUENCIACION MASIVA HA ABIERTO NUEVAS POSIBILIDADES PARA ESCLARECER EL S... ver más

01/01/2015

UGR

143K€

Presupuesto del proyecto: 143K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE GRANADA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 5507

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Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01

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Participantes

UGR

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE GRANADA

Total investigadores 5507

Presupuesto del proyecto 143K€

Descripción del proyecto EL PARASITISMO ES MUY FRECUENTE EN LA NATURALEZA DISFRAZADO DE MULTIPLES MANERAS Y A DISTINTOS NIVELES, DESDE GENES A ESPECIES, EL RECIENTE DESARROLLO DE LA SECUENCIACION MASIVA HA ABIERTO NUEVAS POSIBILIDADES PARA ESCLARECER EL SIGNIFICADO BIOLOGICO DE LOS PARASITISMOS MEDIANTE ANALISIS TRANSCRIPTOMICO DOBLE EN HOSPEDADOR Y PARASITO, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS LLEVAR A CABO ESTE TIPO DE ANALISIS PARA UN PARASITO INTRAGENOMICO: LOS CROMOSOMAS B PARASITICOS DEL SALTAMONTES EYPREPOCNEMIS PLORANS, UN SISTEMA EN EL QUE TENEMOS 35 AÑOS DE EXPERIENCIA QUE LO HAN CONVERTIDO EN UNO DE LOS SISTEMAS MEJOR CONOCIDOS, Y EN PARADIGMA DEL MODELO CASI-NEUTRO DE LA EVOLUCION DE LOS CROMOSOMAS B, EN NUESTRO PROYECTO ANTERIOR PROGRESAMOS MUCHO EN EL CONOCIMIENTO MOLECULAR DE LOS CROMOSOMAS B MEDIANTE EL USO DE LA SECUENCIACION MASIVA, QUE NOS SIRVIO PARA DESCUBRIR MUCHAS SECUENCIAS REPETITIVAS EN LAS QUE EL CROMOSOMA B ESTA ENRIQUECIDO, Y TAMBIEN PARA DETECTAR LA PRESENCIA DE 10 GENES PARA PROTEINAS, LOCALIZADOS EN EL B, TALES COMO, POR EJEMPLO, EL GEN QUE CODIFICA PARA LA SUBUNIDAD CAPG DE LA CONDENSINA I, CUYAS 17 COPIAS SE TRANSCRIBEN ACTIVAMENTE, ADEMAS, NUESTROS ESTUDIOS TRANSCRIPTOMICOS MASIVOS MEDIANTE RNASEQ Y MICROARRAYS, REVELARON LA EXISTENCIA DE 275 GENES QUE MUESTRAN EXPRESION DIFERENCIAL ENTRE LAS HEMBRAS CON Y SIN CROMOSOMAS B, EN EL PROYECTO QUE PROPONEMOS AHORA, QUEREMOS CONTINUAR ESTE ANALISIS REALIZANDO RNASEQ EN GONADAS Y TEJIDOS SOMATICOS DE ADULTOS CON Y SIN B DE AMBOS SEXOS, ESTOS RESULTADOS SERAN ANALIZADOS JUNTO CON LOS OBTENIDOS EN UN EXPERIMENTO CON EMBRIONES, CUYOS RESULTADOS ESTAMOS ANALIZANDO ACTUALMENTE, Y ESTO NOS PROPORCIONARA, ADICIONALMENTE, UNA PERSPECTIVA ONTOGENICA SOBRE COMO EL GENOMA DE E, PLORANS SE ADAPTA A LA PRESENCIA DE LOS CROMOSOMAS B PARASITICOS MEDIANTE CAMBIOS EN LA EXPRESION GENICA, OBTENER UNA RESPUESTA A ESTA CUESTION CONSTITUYE EL PRIMER OBJETIVO DE ESTA PROPUESTA CIENTIFICA, ADEMAS, EL CARACTER INTRAGENOMICO DEL PARASITO ANALIZADO AQUI IMPLICA QUE SOLO PODEMOS ANALIZAR UN TRANSCRIPTOMA COMUN, INCLUYENDO LA EXPRESION DE LOS GENES LOCALIZADOS EN LOS CROMOSOMAS A Y B, POR TANTO, SERA NECESARIO IDENTIFICAR QUE CAMBIOS TRANSCRIPTOMICOS CONSTITUYEN UNA RESPUESTA DEL GENOMA HOSPEDADOR Y CUALES SE DEBEN A LA EXPRESION DE LOS GENES LOCALIZADOS EN EL CROMOSOMA PARASITO, ESTE SERA EL SEGUNDO OBJETIVO DE NUESTRA PROPUESTA, PARA EL CUAL HEMOS DISEÑADO UN PROTOCOLO BASADO EN TRES PASOS SECUENCIALES, CUYA UTILIDAD YA HEMOS COMPROBADO, EL TERCER OBJETIVO TRATARA DE AVERIGUAR EL SIGNIFICADO BIOLOGICO DE LOS TRANSCRITOS QUE PROVIENEN DE LOS GENES PARA PROTEINAS LOCALIZADOS EN LOS CROMOSOMAS B, CON ESTE PROPOSITO, ANALIZAREMOS SEMICUANTITATIVAMENTE LA CANTIDAD DE PROTEINA CAPG, MEDIANTE WESTERN BLOTTING, EN INDIVIDUOS CON DIFERENTES NUMEROS DE CROMOSOMAS B, ESTO INDICARA SI EL EXCESO DE TRANSCRITOS PARA CAPG, OBSERVADO EN INDIVIDUOS CON CROMOSOMA B, ES ACOMPAÑADO POR UNA MAYOR CANTIDAD DE PROTEINA CAPG Y, POR TANTO, SI LOS TRANSCRITOS DEL B SON TRADUCIDOS, ESTO SERA MUY INFORMATIVO SOBRE EL POSIBLE ESTRES METABOLICO IMPUESTO POR LOS CROMOSOMAS B CUYE EXPRESION GENICA PUEDE REPRESENTAR UNA CARGA PARA LAS MAQUINARIAS TRANSCRIPCIONAL Y TRADUCCIONAL, ASI COMO PARA EL CONTROL POSTRADUCCIONAL DE LA CALIDAD DE LAS PROTEINAS, EN CONJUNTO, ESPERAMOS DESVELAR COMO RESPONDE EL GENOMA HOSPEDADOR A LA PRESENCIA DEL CROMOSOMA B DESENCADENANDO CAMBIOS TRANSCRIPTOMICOS DIRIGIDOS A AMORTIGUAR LOS EFECTOS DE ESTOS PARASITOS, CROMOSOMAS B\EXPRESIÓN GÉNICA\PARÁSITO INTRAGENÓMICO\RNASEQ\SECUENCIACIÓN MASIVA\TRANSCRIPTOMA

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