Descripción del proyecto
LOS INTRONES DEL GRUPO II (GII) SON ARNS CATALITICOS QUE ACTUAN COMO RETROELEMENTOS MOVILES Y QUE MADURAN A TRAVES DE UN INTERMEDIARIO EN LAZO, SIGUIENDO UN MECANISMO SIMILAR A LOS INTRONES DEL ESPLICEOSOMA, LA MOVILIDAD DE ESTOS INTRONES ES MEDIADA POR COMPLEJOS DE RIBONUCLEOPROTEINA (RNP) QUE CONSISTEN EN LA TRANSCRIPTASA INVERSA (RT)-MATURASA CODIFICADA POR EL INTRON (IEP) Y LA FORMA EN LAZO DEL INTRON ESCINDIDO, LA SECUENCIA DIANA DE 20 A 35 PB ES RECONOCIDA PRINCIPALMENTE POR EL COMPONENTE DE ARN DE LA RNP A TRAVES DE APAREAMIENTOS DE BASES (WATSON-CRICK) ENTRE LAS SECUENCIAS DEL ARN DEL INTRON (EBS) Y LAS SECUENCIAS DE UNION AL INTRON EN LA DIANA (IBS), UNA SERIE DE CARACTERISTICAS HACEN A LOS GII, UNOS ELEMENTOS UTILES EN BIOTECNOLOGIA CONOCIDOS COMO TARGETRONES, YA QUE COMBINAN UNA ALTA EFICIENCIA DE INTEGRACION EN LA SECUENCIA DIANA CON UNA ESPECIFICIDAD QUE PUEDE SER CAMBIADA DE FORMA SEGURA: I) RECONOCEN SU ADN DIANA PRINCIPALMENTE A TRAVES DE APAREAMIENTOS DE BASES, LO QUE HACE QUE SU ESPECIFICIDAD PUEDA SER CAMBIADA, MODIFICANDO LAS SECUENCIAS EBS DENTRO DEL ARN DEL INTRON, II) SON ELEMENTOS MOVILES CON UNA ALTA EFICIENCIA DE INTEGRACION, SIN NECESITAR POR ELLO DEL USO DE MARCADORES GENETICOS, III) NO DEPENDEN DE RECOMBINACION HOMOLOGA, QUE ES INEFICIENTE EN MUCHAS BACTERIAS Y CELULAS EUCARIOTAS, IV) LOS TARGETRONES NO INDUCEN ROTURA DE DOBLE CADENA EN EL ADN, LA INVESTIGACION BASICA SOBRE ESTOS RETROELEMENTOS Y SUS MECANISMOS BIOQUIMICOS PUEDE LLEVAR A APLICACIONES PRACTICAS EN INGENIERIA GENETICA CON NUEVAS OPORTUNIDADES Y DESAFIOS, ADEMAS, EL EXAMEN DE LOS GENOMAS BACTERIANOS Y DE ARQUEAS HA REVELADO LA PRESENCIA DE RTS, CERCANAS FILOGENETICAMENTE A LAS RTS CODIFICADAS POR LOS GII Y QUE ESTAN ASOCIADAS A UN SUBTIPO PARTICULAR DE REPETICIONES PALINDROMICAS CORTAS AGRUPADAS Y REGULARMENTE INTERESPACIADAS (CRISPR), ASI, PARECE PLAUSIBLE QUE LA ASOCIACION DE UNA RT A LOS SISTEMAS CRISPR-CAS HAYA EXTENDIDO LA INMUNIDAD CONTRA SECUENCIAS DE ARN PARASITAS Y REGIONES DE ADN CON ALTA TRANSCRIPCION EN FAGOS Y PLASMIDOS, AUNQUE EXISTE UNA ENORME CANTIDAD DE INFORMACION Y DE APLICACIONES DE LAS TECNOLOGIAS BASADAS EN CRISPR/CAS, EL SIGNIFICADO BIOLOGICO DE LA ASOCIACION DE UNA RT CON ESTOS SISTEMAS NECESITA SER EXPLORADO, NUESTRO GRUPO ES UN REFERENTE EN EL CAMPO DE LOS GII Y DESCUBRIO EL INTRON RMINT1, Y DESDE ENTONCES HEMOS APORTADO INFORMACION ACERCA DE SUS ASPECTOS EVOLUTIVOS Y DE LAS RT-MATURASAS QUE CODIFICAN, MODOS DE MADURACION, RECONOCIMIENTO DE LA SECUENCIA DE ADN DIANA, MECANISMOS DE MOVILIDAD Y APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS, EL OBJETIVO GENERAL DE ESTA PROPUESTA ES OBTENER UN CONOCIMIENTO MAS PROFUNDO DE LA GENETICA, BIOQUIMICA Y BIOLOGIA MOLECULAR DE LOS GII Y LAS TRANSCRIPTASAS INVERSAS RELACIONADAS QUE PUEDAN DAR LUGAR A NUEVAS APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS, LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS SON: 1) CARACTERIZAR IN VITRO LA REACCION BIOQUIMICA DE LAS RNPS RECONSTITUIDAS CON FORMA LINEAL DE RMINT1 SOBRE MOLECULAR DIANAS DE ARN Y ADN, 2) CONTINUAR EL DESARROLLO DE RMINT1 COMO TARGETRON Y AMPLIAR SU USO EN BACTERIAS, 3) DESARROLLAR RMINT1 COMO HERRAMIENTA EN EL CONTROL DE LA EXPRESION GENICA, 4) ADAPTAR EL USO DE RMINT1 COMO TARGETRON EN CELULAS EUCARIOTAS, Y 5) DETERMINAR EL PAPEL DE LAS RTS ASOCIADAS A LOS SISTEMAS CRISPR/CAS EN EL PROCESO DE ADAPTACION, ESTE PROYECTO PUEDE CONSIDERARSE COMO CIENCIA BASICA DE EXCELENCIA, UTIL PARA ENFRENTAR LOS DESAFIOS DE LA SOCIEDAD ACTUAL, Y TAMBIEN RELEVANTE PARA EL LIDERAZGO INDUSTRIAL, ARNS CATALÍTICOS\CAS\CRISPR\INTRONES DEL GRUPO II\RETROELEMENTOS\RIBOZIMAS\TARGETRON\TRANSCRIPTASAS INVERSAS