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BFU2012-39482

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BIOLOGIA DE PROTEINAS DE MEMBRANA

APROXIMADAMENTE EL 20-30% DE LAS PAUTAS DE LECTURA ABIERTA DE UN GENOMA CODIFICAN PROTEINAS DE MEMBRANA HELICOIDALES (PMH). NO OBSTANTE, EN LOS LIBROS DE TEXTO ACTUALES LAS PROTEINAS DE MEMBRANA OCUPAN MENOS DE UN 10% DE SU EXTENS... ver más

01/01/2012

164K€

Presupuesto del proyecto: 164K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE VALÈNCIA (ESTUDI GENERAL) No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2012-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE VALÈNCIA (ESTUDI GENERAL) No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Presupuesto del proyecto 164K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto APROXIMADAMENTE EL 20-30% DE LAS PAUTAS DE LECTURA ABIERTA DE UN GENOMA CODIFICAN PROTEINAS DE MEMBRANA HELICOIDALES (PMH). NO OBSTANTE, EN LOS LIBROS DE TEXTO ACTUALES LAS PROTEINAS DE MEMBRANA OCUPAN MENOS DE UN 10% DE SU EXTENSION. ESTE LIMITADO CONOCIMIENTO SOBRE LA BIOLOGIA DE LAS PROTEINAS DE MEMBRANA, PONE DE MANIFIESTO LA NECESIDAD DE ESTUDIOS TANTO CUALITATIVOS COMO CUANTITATIVOS.ESTE PROYECTO SE PLANTEA LA CUESTION BIOLOGICA DE COMO DECIDEN LAS CELULAS ENTRE INCORPORAR LOS SEGMENTOS POCO HIDROFOBICOS EN EL NUCLEO DE LA MEMBRANA, O DISPONERLOS EN LA INTERFASE ENTRE LA MEMBRANA Y EL AGUA CIRCUNDANTE. TAMBIEN TIENE COMO OBJETIVO LA BUSQUEDA DE CHAPERONAS MOLECULARES QUE ASISTEN EN EL DIRECCIONAMIENTO E INTEGRACION DE LAS PMH EN MEMBRANAS BIOLOGICAS, MEDIANTE EL USO DE UNA APROXIMACION PROTEOMICA A GRAN ESCALA. ADEMAS, LA FUNCION DE ALGUNAS PUTATIVAS CHAPERONAS SERA VERIFICADA UTILIZANDO TECNICAS DE FOTOENTRECRUZAMIENTO.CONCRETAMENTE, NOS CENTRAMOS EN CUATRO OBJETIVOS PRINCIPALES: 1) UTILIZACION DE APROXIMACIONES COMPUTACIONALES Y EXPERIMENTALES PARA INVESTIGAR LOS REQUISITOS DE SECUENCIA, DE LONGITUD, Y DECOMPOSICION DE AMINOACIDOS PARA SU INSERCION MEDIANTE EL TRANSLOCON. EL USO DE UN ENSAYO DE INSERCION IN VITRO, PERMITIRA DEFINIR DE UNA MANERA SISTEMATICA LA LONGITUD MINIMA DE LOS FRAGMENTOS TM DISEÑADOS COMPUTACIONALMENTE (CON UNA DISTRIBUCION DE AMINOACIDOS BASADA EN SU FRECUENCIA NATURAL) PARA SER INSERTADOS EN LA MEMBRANA MEDIANTE LA MAQUINARIA CELULAR. 2) LAS PROPIEDADES ESTRUCTURALES Y QUIMICAS DE LA INTERFASE LIPIDICA SON CLARAMENTE DIFERENTES A LAS DEL RESTO DE LA BICAPA LIPIDICA. DEBIDO A QUE UNA PORCION SIGNIFICATIVA DE LAS PMHS RESIDEN EN ESTA REGION TAN COMPLEJA, ES IMPORTANTE ENTENDER LA ENERGETICA Y TERMODINAMICA DE LAS INTERACCIONES POLIPEPTIDICAS EN ELLA. UTILIZANDO EL TRANSLOCON COMO HERRAMIENTA SE ANALIZARAN SEGMENTOS POLIPEPTIDICOS DISEÑADOS. CON ELLO, NOS PROPONEMOS DETERMINAR EL CODIGO DE SECUENCIA ESPECIFICO PARA UNA DISPOSICION INTERFACIAL, LO QUE PROPORCIONARA UNA ESCALA BIOLOGICA DE HIDROFOBICIDAD INTERFACIAL. 3) SE HA POSTULADO LA EXISTENCIA DE CHAPERONAS DE PROTEINAS DE MEMBRANA QUE ASISTAN A LA INSERCION DE DOMINIOS TM EN LAS MEMBRANAS BIOLOGICAS. PROPONEMOS LA BUSQUEDA MEDIANTE APROXIMACIONES PROTEOMICAS DE PROTEINAS CON CAPACIDAD DE RECONOCER E INTERACCIONAR CON FRAGMENTOS TM, ES DECIR QUE PUEDAN SER CANDIDATAS A CHAPERONAS DE PMHS. 4) PESE A SER UN COMPONENTE ESENCIAL PARA LA TRANSLOCACION O INSERCION EN LA MEMBRANA DE ALGUNAS PROTEINAS SECRETADAS O DE MEMBRANA, LA FUNCION DE LA PROTEINA TRAM (TRANSLOCATING CHAIN-ASSOCIATING MEMBRANE PROTEIN) ES AUN DESCONOCIDA. ASI, SE LA HA RELACIONADO CON LA INTEGRACION DE FRAGMENTOS TM POCO HIDROFOBICOS, LO QUE IMPLICA QUE PODRIA ESTAR ACTUANDO COMO CHAPERONA DE FRAGMENTOS TM NO OPTIMOS. SE PROPONE ESTUDIAR ESTA POSIBILIDAD MEDIANTE EL USO DE TECNICAS DE FOTOENTRECRUZAMIENTO APLICADAS SOBRE UN CONJUNTO DE SEGMENTOS TM CONTENIENDO RESIDUOS CARGADOS EN LA REGION DEL TM.EN CONJUNTO, ESTOS ESTUDIOS APORTARAN UN MODELO CUANTITATIVO Y UNA VISION MAS COMPLETA DEL PROCESO DE INTEGRACION EN MEMBRANAS, LO QUE GENERA, A NUESTRO ENTENDER, UN PROYECTO DE INVESTIGACION COHERENTE Y DE PRIMER NIVEL EN EL AMBITO DE LAS CIENCIAS BIOMEDICAS, CON EL OBJETIVO GLOBAL DE ENTENDER COMO LAS PMHS ADOPTAN SU ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL EN LA MEMBRANA, PROPORCIONANDO ADEMAS UN VALIOSO ENTORNO PARA LA FORMACION DE ESTUDIANTES DE DOCTORADO Y POSTDOCTORALES.

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