BIOCATALISIS COMPUTACIONAL: UNA APROXIMACION AL DISEÑO RACIONAL DE INHIBIDORES E...
BIOCATALISIS COMPUTACIONAL: UNA APROXIMACION AL DISEÑO RACIONAL DE INHIBIDORES ENZIMATICOS Y BIOCATALIZADORES CON APLICACIONES EN BIOMEDICINA
EL PRESENTE PROYECTO ESTA DEDICADO A LA APLICACION DE METODOS DE SIMULACION MULTIESCALA AL ESTUDIO DE REACCIONES BIOQUIMICAS COMPLEJAS Y AL DISEÑO DE NUEVOS COMPUESTOS CON FUERTES IMPLICACIONES PARA PROBLEMAS RELACIONADOS CON LA S...
EL PRESENTE PROYECTO ESTA DEDICADO A LA APLICACION DE METODOS DE SIMULACION MULTIESCALA AL ESTUDIO DE REACCIONES BIOQUIMICAS COMPLEJAS Y AL DISEÑO DE NUEVOS COMPUESTOS CON FUERTES IMPLICACIONES PARA PROBLEMAS RELACIONADOS CON LA SALUD HUMANA. LOS DOS GRUPOS COORDINADOS EN ESTA INICIATIVA HAN ESTADO TRABAJANDO COLABORATIVAMENTE EN EL DESARROLLO Y USO DE METODOS MULTIESCALA PARA EL ESTUDIO DE REACCIONES ENZIMATICAS DURANTE CASI TRES DECADAS, DEMOSTRANDO QUE ESTOS METODOS ESTAN LO SUFICIENTEMENTE MADUROS COMO PARA BRINDAR RESPUESTAS UTILES A ALGUNOS DE LOS PROBLEMAS MAS IMPORTANTES Y URGENTES QUE ENFRENTA LA CIENCIA, COMO LA ACTUAL PANDEMIA DE COVID-19. EN ESTE PROYECTO, LOS DOS GRUPOS CONTINUARAN EN SUS ESFUERZOS COMPARTIDOS DEDICADOS AL DESARROLLO CONTINUO DE NUEVOS METODOS Y ESTRATEGIAS COMPUTACIONALES PARA UN DISEÑO MAS PRECISO DE INHIBIDORES Y BIOCATALIZADORES.LOS OBJETIVOS DEL PROYECTO SE HAN AGRUPADO EN TRES PAQUETES (WORK PACKAGES, WPS) DIFERENTES: WP A, DESARROLLOS METODOLOGICOS; WP B, DISEÑO DE INHIBIDORES ENZIMATICOS Y WP C, DISEÑO DE BIOCATALIZADORES CON APLICACIONES A PROBLEMAS DE SALUD. EN WP A INTENTAREMOS AMPLIAR LAS POSIBILIDADES DE LAS ESTRATEGIAS COMPUTACIONALES ACTUALES. EN ESTE SENTIDO, INCORPORAREMOS ESTRATEGIAS DE MACHINE LEARNING PARA MEJORAR LA EFICIENCIA DE LOS METODOS ACTUALES QM/MM Y PARA AYUDAR A LA PREDICCION DE NUEVOS COMPUESTOS. TAMBIEN TRABAJAREMOS EN EL DESARROLLO DE NUEVAS ESTRATEGIAS ADAPTADAS AL ESTUDIO DE LOS CAMBIOS CONFORMACIONALES QUE SE PRODUCEN DURANTE EL CICLO CATALITICO DE LAS ENZIMAS, ABRIENDO EL ABANICO DE APLICACIONES DE LOS METODOS ACTUALES. EL RESULTADO DE ESTE PAQUETE DE TRABAJO SE UTILIZARA EN PROBLEMAS PRACTICOS RELACIONADOS CON PROBLEMAS DE SALUD. EN WP B NOS CENTRAREMOS EN EL ESTUDIO Y DISEÑO DE INHIBIDORES DE ENZIMAS. PRESTAREMOS ESPECIAL ATENCION A LA INHIBICION DE LAS ENZIMAS (PROTEASA PRINCIPAL, PROTEASA TIPO PAPAINA Y HELICASA) DEL VIRUS SARS-COV-2, EN UN INTENTO DE CONTRIBUIR AL DESARROLLO DE NUEVOS FARMACOS PARA COMBATIR LA PANDEMIA DE COVID-19. COMO DOS DE ESTAS ENZIMAS PERTENECEN A LA FAMILIA DE LAS CISTEINA PROTEASAS, TAMBIEN DEDICAREMOS PARTE DE NUESTROS ESFUERZOS AL ESTUDIO DE LA INHIBICION DE OTRAS CISTEINA PROTEASAS HUMANAS (CATEPSINAS Y CASPASAS) IMPLICADAS EN DIFERENTES ENFERMEDADES, COMO EL CANCER Y EL ALZHEIMER. EN WP C NUESTRA INVESTIGACION SE CENTRARA EN EL DISEÑO DE NUEVOS BIOCATALIZADORES PARA DOS IMPORTANTES PROBLEMAS QUE AFECTAN A LA SALUD HUMANA: EL DISEÑO DE ENZIMAS PARA DEGRADAR LOS DESECHOS PLASTICOS Y PARA MEJORAR EL TRATAMIENTO DE LA LEUCEMIA. LOS LOGROS OBTENIDOS DEL WP A SERAN FUNDAMENTALES PARA TENER UNA MEJOR Y MAS COMPLETA COMPRENSION DE LOS PROCESOS EN ESTUDIO Y TENER PREDICCIONES MAS PRECISAS DE MUTACIONES Y/O MODIFICACIONES QUIMICAS QUE NOS PERMITAN ALCANZAR LAS PROPIEDADES DESEADAS.EL SUBPROYECTO REALIZADO POR EL GRUPO DE LA UV SE CENTRARA EN EL DESARROLLO DE NUEVOS METODOS PARA EXPLORAR CAMBIOS CONFORMACIONALES EN WP A. EN CUANTO A LAS APLICACIONES, NUESTRO GRUPO CONTRIBUIRA, EN COLABORACION CON EL GRUPO DE LA UNIVERSIDAD JAUME I, AL ESTUDIO DE LA INHIBICION DEL SARS-COV-2 Y DE CISTEINA PROTEASAS HUMANAS (WP B). EN WP C NUESTRO GRUPO SERA EL RESPONSABLE DE LA LINEA DEDICADA AL DISEÑO DE NUEVAS ASPARAGINASAS PARA EL TRATAMIENTO DE LA LEUCEMIA. LOS AVANCES ALCANZADOS POR LOS DOS GRUPOS, TANTO EN DESARROLLOS METODOLOGICOS COMO EN ESTRATEGIAS DE DISEÑO, SERAN COMPARTIDOS CON EL FIN DE MEJORAR LAS OPORTUNIDADES DE EXITO DE AMBAS LINEAS. ETODOS MULTIESCALA\ASPARAGINASES\PETASAS\CISTEINA PROTEASAS\COVID-19\DISEÑO DE BIOCATALIZADORES\DISEÑO DE INHIBIDORES\ENZIMAS\MACHINE LEARNINGver más
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