Descripción del proyecto
LA RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS SE HA CONVERTIDO EN UN PROBLEMA SANITARIO ACUCIANTE. EL PRINCIPAL MECANISMO RESPONSABLE DE LA DISEMINACION DE GENES DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS ES LA CONJUGACION BACTERIANA. POR TANTO, LA BUSQUEDA DE INHIBIDORES DEL PROCESO CONJUGATIVO PUEDE SER UNA ALTERNATIVA EFICAZ EN LA LUCHA CONTRA BACTERIAS MULTIRESISTENTES. EN ESTE CONTEXTO, DIVERSOS GRUPOS HAN AFRONTADO LA BUSQUEDA DE INHIBIDORES DE LA CONJUGACION MEDIANTE METODOS DE HIGH THROUPUT SCREENING. SIN EMBARGO, MUCHOS DE LOS COMPUESTOS SELECCIONADOS HAN RESULTADO SER INESPECIFICOS. EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS DESARROLLAR NUEVAS COMPUESTOS MEDIANTE EL DISEÑO RACIONAL DE DROGAS BASADO EN LA ESTRUCTURA DE MOLECULAS DIANA. EN UN TRABAJO RECIENTE HEMOS DEMOSTRADO QUE TRWD, LA TRAFFIC ATPASE DEL SISTEMA CONJUGATIVO R388, ES LA DIANA DE ACIDOS GRASOS INSATURADOS, QUE SON INHIBIDORES ESPECIFICOS DE LA CONJUGACION. LA CARACTERIZACION DE LAS CONSTANTES CINETICAS INHIBITORIAS Y EL AJUSTE POR ORDENADOR DEL SITIO DE UNION DE LOS INHIBIDORES A LA ESTRUCTURA DE TRWD NOS HA PERMITIDO DEFINIR EL MECANISMO DE INHIBICION. EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS USAR METODOS DE HIGH THROUGHPUT IN SILICO SCREENING PARA DISEÑAR NUEVOS AGENTES INHIBIDORES MAS EFICACES Y POTENTES, QUE SERAN VALIDADOS DESPUES IN VIVO, EN EXPERIMENTOS DE CONJUGACION, E IN VITRO ANALIZANDO EL EFECTO SOBRE LA ACTIVIDAD ATPASA DE TRWD. DEBIDO A LA SIMILITUD DE TRWD CON OTRAS PROTEINAS PERTENECIENTES A LA SUPER-FAMILIA DE "TRAFFIC ATPASES" IMPLICADAS EN VIRULENCIA, LA ESTRATEGIA SEGUIDA EN ESTOS ESTUDIOS PUEDE SER EXTENDIDA A OTROS SISTEMAS BIOLOGICOS DE IMPORTANCIA BIOMEDICA, TALES COMO LA TRANSFERENCIA DE PROTEINAS EFECTORAS POR PARTE DE BACTERIAS PATOGENAS COMO HELICOBACTER PYLORI O BRUCELLA ABORTUS, ENTRE OTRAS.POR OTRO LADO, USAREMOS LA TECNOLOGIA DE NANOPOROS PARA EL ESTUDIO DE MOTORES IMPLICADOS EN LA TRANSLOCACION DE ADN Y PROTEINAS A TRAVES DE MEMBRANAS BIOLOGICAS. EN CONCRETO, PRETENDEMOS CONOCER EL MECANISMO DE DESPLIEGUE DE LA PROTEINA PILOTO CONJUGATIVA TRWC, UNA PROTEINA DE GRAN TAMAÑO (900 KDA) SECRETADA A TRAVES DE LA MEMBRANA BACTERIANA UNIDA A UNA DE LAS CADENAS DE ADN DEL PLASMIDO. USAREMOS TAMBIEN LA TECNOLOGIA DE NANOPOROS PARA EL DESARROLLO DE METODOS ALTERNATIVOS DE SECUENCIACION DE ADN DE TERCERA GENERACION. NOS PROPONEMOS ESTUDIAR EN PARALELO DOS SISTEMAS, TRWB Y TRAB, COMO EJEMPLOS DE TRANSPORTADORES DE SSDNA Y DSDNA, RESPECTIVAMENTE, A TRAVES DE MEMBRANAS LIPIDICAS. AMBOS MOTORES ESTAN DISEÑADOS PARA TRANSLOCAR DNA A TRAVES DE MEMBRANAS EN DIFERENTES PROCESOS CONJUGATIVOS, DE FORMA QUE SUPONEN UNA INTERESANTE ALTERNATIVA PARA SUPERAR LOS PROBLEMAS DE RESOLUCION ESPACIAL Y TEMPORAL QUE PRESENTAN LOS NANOPOROS DE ALPHA-HEMOLISINA. LOS RESULTADOS OBTENIDOS NO SOLO NOS AYUDARAN A AMPLIAR NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LOS MECANISMOS MOLECULARES DE ESTOS MOTORES, SINO QUE ADEMAS PRESENTAN UNA GRAN POTENCIALIDAD DE TRANSFERENCIA TECNOLOGICA Y BIOMEDICA. OTORES MOLECULARES\NANOPOROS\INHIBIDORES\RESISTENCIA A ANTIBIÓTICOS