Descripción del proyecto
LA COMPLEJIDAD FUNCIONAL DE LOS PATRONES EPIGENETICOS SE ESTA EMPEZANDO A DESCIFRAR EN LOS CONTEXTOS DEL DESARROLLO Y ALGUNAS ENFERMEDADES, SIN EMBARGO, TODAVIA ESTAMOS LEJOS DE DISPONES DE UN MAPA NAVEGABLE DEL GENOMA EN EL QUE PROPIEDADES ESTRUCTURALES Y FUNCIONALES SE PUEDEN INTERCONECTAR CON LAS REDES DE SEÑALIZACION CELULAR Y LAS RESPUESTAS BIOLOGICAS,LA REPROGRAMACION EPIGENETICA Y REORGANIZACION DE LOS PROCESOS CELULARES NORMALES SUBYACEN LA ADQUISICION DEL FENOTIPO MALIGNO EN LA CELULA TUMORAL, LA NATURALEZA HETEROGENEA, DINAMICA Y A MENUDO CAOTICA DE LOS GENOTIPOS Y EPIGENOTIPOS DE LA MAYORIA DE CANCERES AÑADEN UNA CAPA DE COMPLEJIDAD, QUE IMPIDE DIBUJAR UN ESCENARIO SIMPLE PARA ENTENDER LA ORGANIZACION ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL DEL GENOMA DE LA CELULA TUMORAL,ADEMAS, LA ARQUITECTURA Y ACTIVIDAD DE LA CROMATINA SON DIFICILMENTE ANALIZABLES Y MUESTRAS PROCEDENTES DE PACIENTES, AFORTUNADAMENTE, LA METILACION DEL DNA PROPORCIONA UN ACCESO PRIVILEGIADO A INFORMACION ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL A PARTIR DE CASI CUALQUIER TIPO DE MUESTRA BIOLOGICA, INCLUYENDO MUESTRAS RECOGIDAS EN PROCEDIMIENTOS CLINICOS RUTINARIOS (POR EJEMPLO, SANGRE, BIOSIAS, SALIVA, ETC,), ADEMAS, MULTIPLES EVIDENCIAS INDICAN QUE LOS PERFILES DE METILACION DEL DNA SE PUEDEN CONSIDERAR PROXYS FIABLES DE LA ARQUITECTURA Y ORGANIZACION FUNCIONAL DE LA CROMATINA, OBJETIVO GENERAL:CARACTERIZAR LOS FENOTIPOS EPIGENETICOS QUE REVELAN LA ORGANIZACION FUNCIONAL DEL GENOMA EN CANCERES HUMANOS E IDENTIFICAR LOS MECANISMOS SUBYACENTES,OBJETIVOS ESPECIFICOS:1,CARACTERIZAR LA MODULARIDAD EPIGENETICA DEL GENOMA DE LA CELULA TUMORAL MEDIANTE LA DECONSTRUCCION DE LA COVARIACION EN LOS PERFILES DE METILACION DEL DNA,2, DETERMINAR EL PAPEL DE LOS RETROTRANSPOSONES ALU EN LA ARQUITECTURA EPIGENOMICA DE LA LAS CELULAS TUMORALES,3, INVESTIGAR LA ASOCIACION ENTRE LA METILACION DEL DNA Y LA ORGANIZACION DE LA CROMATINA Y SU PAPEL EN LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA EN CANCER HUMANO, TRES CASOS PARTICULARES,4, IDENTIFICAR Y CARACTERIZAR LA FUNCIONALIDAD DE CPGS CON UNA METILACION SINGULAR (ODD-CPGS),RESULTADOS ESPERABLES:1, UNA MEJOR COMPRENSION DE LA JERARQUIA DE LOS MECANISMOS QUE CONTROLAN LA REGULACION GENICA EN EL CANCER,2, UN MEJOR CONOCIMIENTO DE LA CONTRIBUCION DE LOS RETROTRANSPOSONES ALU A LA REGULACION GENOMICA3, DESCUBRIMIENTO DE BIOMARCADORES DE RIESGO, PROGRESION, RESPUESTA AL TRATAMIENTO Y ESTRATIFICACION DE LOS PACIENTES DE CANCER,4, IDENTIFICACION DE DIANAS EPIGENETICAS PARA LA PREVENCION Y TRATAMIENTO DEL CANCER, CANCER\CÁNCER COLORRECTAL\EPIGENÉTICA\BIOMARCADOR\METILACIÓN DEL DNA\CROMATINA