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PID2020-114705RB-I00

Financiado

ANALISIS DEL PERFIL DEL MICROBIOTA INTESTINAL EN DOS ESTIRPES DE IBERICO Y SUS C...

ANALISIS DEL PERFIL DEL MICROBIOTA INTESTINAL EN DOS ESTIRPES DE IBERICO Y SUS CRUCES RECIPROCOS CON DIFERENCIAS EN RENDIMIENTO DEL CRECIMIENTO Y CALIDAD DE CARNE ESTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO ESTUDIAR EL EFECTO DEL HOSPEDADOR Y EL MATERNO EN EL PERFIL MICROBIANO EN DOS DE LAS PRINCIPALES ESTIRPES DE CERDO IBERICO (ENTREPELADO [EE] Y RETINTO [RR]) Y SU CRUCE RECIPROCO (RE AND RE) PARA E... ver más

01/01/2020

UPV

263K€

Presupuesto del proyecto: 263K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POLITÈCNICA DE VALÈNCIA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 683

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2020-01-01

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Participantes

UPV

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT POLITÈCNICA DE VALÈNCIA

Total investigadores 683

Presupuesto del proyecto 263K€

Descripción del proyecto ESTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO ESTUDIAR EL EFECTO DEL HOSPEDADOR Y EL MATERNO EN EL PERFIL MICROBIANO EN DOS DE LAS PRINCIPALES ESTIRPES DE CERDO IBERICO (ENTREPELADO [EE] Y RETINTO [RR]) Y SU CRUCE RECIPROCO (RE AND RE) PARA ENTENDER LOS MECANISMOS QUE PRODUCEN DIFERENCIAS EN EFICIENCIA DEL CRECIMIENTO Y CALIDAD DE CARNE EN CERDO IBERICO. PARA ELLO, SE LLEVARA A CABO UN EXPERIMENTO CON 240 MACHOS CASTRADOS DE LOS CUATRO CRUCES (EE, RR, RE AND ER). LOS ANIMALES COMENZARAN EL EXPERIMENTO A LOS 90 DIAS HASTA LA EDAD DE MATADERO (300 DIAS) Y DURANTE ESTE PERIODO SE ALIMENTARAN AD LIBITUM Y SE CONTROLARA EL CONSUMO DE PIENSO. SE REALIZARAN TRES TESTAJES (90, 180 AND 300 D) EN LOS CUALES SE RECOGERAN MUESTRAS DE SANGRE Y HECES Y SE MEDIRA EL PESO Y LA GRASA DORSAL E INTRAMUSCULAR EN VIVO. ASI MISMO, EN MATADERO SE RECOGERAN CARACTERES DE CANAL Y SE MEDIRA LA GRASA DORSAL, INTRAMUSCULAR Y LOS ACIDOS GRASOS DE UNA MUESTRA DE LA GRASA DORSAL Y EL LONGISSIMUS THORACIS. DE LAS MUESTRAS DE SANGRE SE EXTRAERA EL ADN DEL CERDO (HUESPED) Y ADN DEL MICROBIOTA GASTROINTESTINAL DE LAS HECES. EL ADN DEL HOSPEDADOR SERA GENOTIPADO CON UN CHIP COMERCIAL DE ALTA DENSIDAD, ASI COMO SE GENOTIPARAN, CON OPEN ARRAY, 51 SNPS PREVIAMENTE ASOCIADOS CON CRECIMIENTO Y CALIDAD DE CARNE. LA EXTRACCION DEL ADN DE LAS HECES Y SU SECUENCIACION SE HARA CON DOS METODOS DIFERENTES: 1) EXTRACCION DE ADN CON UN KIT COMERCIAL PARA 16S RRNA, AMPLIFICACION DE LA REGION V4-V9 DEL GEN BACTERIAL 16S RRNA CON PRIMER UNIVERSALES Y SECUENCIACION DEL PERFIL MICROBIANO 16S RDNA CON MISEQ (ILLUMINA); 2) EXTRACCION DE DNA CON KIT COMERCIAL DE ANALISIS METAGENOMICOS Y SECUENCIACION COMPLETA CON LA PLATAFORMA HISEQ DE ILLUMINA. UNA VEZ OBTENIDOS LOS FENOTIPOS, GENOTIPOS Y EL CONTEO DE OTUS/TAXA Y GENES FUNCIONALES (EJ. KEGG) REALIZAREMOS LOS SIGUIENTES ANALISIS CON LOS SOTFWARE ACTUALMENTE DISPONIBLES Y LOS DESARROLLADOS POR NOSOTROS MISMOS EN EL PROYECTO. PRIMERO, VALIDAREMOS LOS 51 SNPS, POSIBLES MUTACIONES CAUSALES DE VARIACIONES EN CRECIMIENTO Y CALIDAD DE CARNE EN CERDO IBERICO. SEGUNDO, ANALIZAREMOS EL PERFIL DEL MICROBIOMA POR 16SRNA Y SECUENCIACION COMPLETA EN LAS ESTIRPES RR, EE Y SU CRUCE RECIPROCO (RE Y ER). LA COMPARACION DE LA COMPOSICION DEL MICROBIOMA ENTRE ESTIRPES NOS PERMITIRA DETERMINAR LA EXISTENCIA DE UN EFECTO GENETICO DE LA LINEA DEL HOSPEDADOR. LA COMPARACION DEL MICROBIOMA ENTRE CRUCES RECIPROCOS NOS PERMITIRA EVALUAR EL EFECTO MATERNO EN SU COMPOSICION. ASI MISMO, ESTUDIAREMOS LA RELACION DEL PERFIL DEL MICROBIOMA Y LOS CARACTERES DE CRECIMIENTO Y CALIDAD DE CARNE DE ESTAS POBLACIONES. LAS COMPARACIONES LAS REALIZAREMOS ENTRE EDADES Y ESTIRPES LOS QUE NOS PROPORCIONARA LA EVOLUCION DEL MICROBIOMA Y EL IMPACTO DE HOSPEDADOR Y EFECTO MATERNO A LO LARGO DE LOS ESTADOS PRODUCTIVOS. POSTERIORMENTE LLEVAREMOS A CABO HOLOGENOME ANALISIS EN LO QUE SE ANALIZARAN CONJUNTAMENTE EL GENOMA DEL HOSPEDADOR Y EL METAGENOMA. PARA ELLO, HAREMOS ANALISIS DE ASOCIACION ENTRE EL GENOMA Y LA ABUNDANCIA DE LOS PRINCIPALES OTU/TAXAS Y GENES FUNCIONALES ASOCIADOS AL RENDIMIENTO DEL CRECIMIENTO Y CALIDAD DE CARNE Y EXPLORAREMOS DIVERSAS ESTRATEGIAS PARA PREDECIR LOS FENOTIPOS DE LOS INDIVIDUOS COMBINANDO LOS GENOTIPOS DEL HOSPEDADOR Y LA INFORMACION DEL MICROBIOMA. LOS RESULTADOS DE ESTE PROYECTO AYUDARAN A DESARROLLAR NUEVAS ESTRATEGIAS PARA MEJORAR LA PRODUCTIVIDAD DEL CERDO IBERICO SIN REDUCIR SU CALIDAD DE CARNE Y ROBUSTEZ, LO QUE ES FUNDAMENTAL PARA UNA MEJORA SOSTENIBLE. ERDO IBERICO\EFECTO MATERNO\HOLOGENOME\SEQUENCIACION\EFICIENCIA\CALIDAD DE CARNE\GENOMICA\MICROBIOTA INTESTINAL

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