Descripción del proyecto
LA BIOLOGIA MOLECULAR DE SISTEMAS ES UN CAMPO DE ESTUDIO RELATIVAMENTE NUEVO DESTINADO A EXPLICAR FENOMENOS BIOLOGICOS COMPLEJOS DESDE UN PUNTO DE VISTA GLOBAL, CONSIDERANDO LAS INTERRELACIONES ENTRE DISTINTOS MECANISMOS CELULARES Y MOLECULARES, MEDIANTE UNA APROXIMACION MULTIDISCIPLINAR. LA BIOLOGIA DE SISTEMAS PUEDE SER TREMENDAMENTE UTIL A LA HORA DE ENTENDER LA ETIOLOGIA Y PROGRESION DE LAS ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS Y LOS DESORDENES PSIQUIATRICOS, EN LOS QUE APARECEN AFECTADOS MULTIPLES PROCESOS CELULARES QUE DIFICILMENTE PUEDEN SER EXPLICADOS POR EL FALLO DE UN UNICO COMPONENTE. DICHAS ALTERACIONES PUEDEN TENER LUGAR EN EL NUCLEO, COMPROMETIENDO LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL Y PRODUCIENDO UN PERFIL DE EXPRESION GENICA CARACTERISTICO EN EL CEREBRO DE PACIENTES Y QUE ES DEPENDIENTE DE LA SEVERIDAD Y ESTADIO DE LA ENFERMEDAD. A ESTE PERFIL SE LE CONOCE COMO FIRMA GENETICA DE LA ENFERMEDAD, CUYA REVERSION TRAS CIERTOS TRATAMIENTOS SE CORRELACIONA CON UNA MEJORA A NIVEL SINTOMATOLOGICO. SE PROPONE POR TANTO LA GENERACION DE NUEVOS DATOS DEL TRANSCRIPTOMA REGIONAL Y TEMPORAL DE ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS TAN IMPORTANTES COMO LA ENFERMEDAD DE HUNTINGTON Y LA ENFERMEDAD DE ALZHEIMER. PARA ELLO, SE UTILIZARAN LAS TECNOLOGIAS MAS NOVEDOSAS COMO MICROMATRICES DE EXPRESION DE ULTIMA GENERACION Y LA ULTRASECUENCIACION MASIVA, CON EL FIN DE OBTENER MAS INFORMACION ACERCA DE LA DESREGULACION TRANSCRIPCIONAL OBSERVADA EN DICHAS CONDICIONES IN ANIMALES MODELOS. ADEMAS DE LOS DATOS GENERADOS TRAS DICHO ANALISIS, SE APROVECHARA LA DISPONIBILIDAD DE DATOS DE TRANSCRIPTOMAS YA EXISTENTES, INCLUYENDO PERFILES DE EXPRESION PROPIOS AUN SIN PUBLICAR, CON EL FIN DE REALIZAR UN AMBICIOSO META-ANALISIS PARA EL DISEÑO DE MEJORES ESTRATEGIAS PALIATIVAS. ESTO PERMITIRA LA CONFECCION DE UNA LISTA DE PRIORIDADES DE ESTRATEGIAS, BIEN YA EXISTENTES O BIEN PREDICHAS, DE UNA MANERA CUANTITATIVA. EN DICHO META-ANALISIS SE HARA UN ESPECIAL ENFASIS EN LA CONTRIBUCION DE REGULADORES DE LA EXPRESION DE TRANSCRITOS EN LA GENERACION Y REVERSION DE FIRMAS GENETICAS DE ENFERMEDADES: NOS REFERIMOS A FACTORES DE TRANSCRIPCION, PROTEINAS MODIFICADORAS DE LAS HISTONAS Y MIRNAS. FINALMENTE, LOS RESULTADOS OBTENIDOS EN EL META-ANALISIS, QUE SE ESPERAN SEAN ALTAMENTE INTERESANTES, SERVIRAN PARA EL DISEÑO Y VALIDACION DE ESTRATEGIAS PALIATIVAS MAS PODEROSAS, MEDIANTE LA COMBINACION DE TRATAMIENTOS FARMACOLOGICOS, PROGRAMAS DE ENTRENAMIENTO Y TERAPIA GENICA BASADA EN UN PROGRAMA DE CRUCES DE ANIMALES (GENETICA DE RATONES) E INFECCIONES CON LENTIVIRUS. CON EL OBJETIVO DE PROPONER POSIBLES MECANISMOS QUE EXPLIQUEN EL FENOMENO DE PALIAMIENTO OBSERVADO, SE REALIZARA UN INTENSIVO ESTUDIO GLOBAL PARA DEFINIR LA FIRMA GENETICA DE PALIAMIENTO MEDIANTE EL USO DE MICROMATRICES Y ULTRASECUENCIACION, Y POSTERIOR ANALISIS DE LOS DATOS RESULTANTES DE TRANSCRIPTOMA Y DE OCUPACION GENOMICA. DE ESTA MANERA, LA PRESENTE PROPUESTA INTEGRA GENOMICA GLOBAL (MEDIANTE EL USO DE LAS TECNOLOGIAS MAS NOVEDOSAS), BIOINFORMATICA, ESTUDIOS CONVENCIONALES DE GEN UNICO Y ANALISIS DE COMPORTAMIENTO ANIMAL, CON EL FIN DE IDENTIFICAR LOS COMPONENTES CLAVES DE LA NEURODEGENERACION Y EL DECLIVE COGNITIVO OBSERVADO EN DICHAS ENFERMEDADES, Y MAS ADELANTE, LOS COMPONENTES CLAVES RESPONSABLE DEL PALIAMIENTO TRAS LA VALIDACION DE NUEVAS TERAPIAS EN MODELOS ANIMALES. NFERMEDAD DE HUNTINGTON\BIOINFORMATICA\MICROMATRICES Y ULTRASECUENCIACION\BIOLOGIA DE SISTEMAS\FIRMAS GENETICAS DE ENFERMEDAD\DEREGULACION TRANSCRIPCIONAL\ESTRATEGIAS PALIATIVAS\ENFERMEDAD DE ALZHEIMER