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PID2019-110384GB-C21

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ANALISIS DE LA RED REGULADORA HORMONAL GLOBAL, ATP Y TRANSICIONES DE FASE EN CAN...

ANALISIS DE LA RED REGULADORA HORMONAL GLOBAL, ATP Y TRANSICIONES DE FASE EN CANCER Y CELULAS NORMALES EN LOS ULTIMOS AÑOS, EL LABORATORIO DE MIGUEL BEATO HA GENERADO UNA GRAN CANTIDAD DE MRNA-SEQ, OCUPACION DE CROMATINA CHIP, FOSFOPROTEOMA E INTERACTOMA (RIME) DE CELULAS DE CANCER DE MAMA EXPUESTAS A HORMONAS, EL OBJETIVO ES ESTAB... ver más

01/01/2019

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303K€

Presupuesto del proyecto: 303K€

Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

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Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 303K€

Descripción del proyecto EN LOS ULTIMOS AÑOS, EL LABORATORIO DE MIGUEL BEATO HA GENERADO UNA GRAN CANTIDAD DE MRNA-SEQ, OCUPACION DE CROMATINA CHIP, FOSFOPROTEOMA E INTERACTOMA (RIME) DE CELULAS DE CANCER DE MAMA EXPUESTAS A HORMONAS, EL OBJETIVO ES ESTABLECER LA RED DE SEÑALIZACION JERARQUICA GLOBAL (BASADA EN LOS DATOS ACUMULADOS) DE LA RESPUESTA DE LAS CELULAS DE CANCER DE MAMA A LAS PROGESTINAS, UTILIZANDO ESTADISTICAS Y ENFOQUES DE APRENDIZAJE AUTOMATICO,UNA VEZ QUE SE PROPONGAN UNA O VARIAS REDES HIPOTETICAS ALTERNATIVAS Y COMPLEJOS DE PROTEINAS DE INTERES, SE VALIDARAN UTILIZANDO LAS PERTURBACIONES APROPIADAS, COMPARANDO LOS SISTEMAS DE CULTIVO CELULAR 2D Y 3D, DESPUES DE ESTOS REFINAMIENTOS, LA RED SE PROBARA EN OTRAS LINEAS CELULARES DE CANCER DE MAMA, EN ORGANOIDES DERIVADOS DE PACIENTES Y XENOINJERTOS DE TUMOR DE RATON (CATHRIN BRISKEN) PARA EXPLORAR SU VALOR PREDICTIVO EN CONDICIONES MAS FISIOLOGICAS, LA RED GLOBAL FINAL SERA UN RECURSO IMPORTANTE PARA LA COMUNIDAD EN GENERAL Y PUEDE REVELAR NUEVOS OBJETIVOS POTENCIALES PARA CONTROLAR EL CRECIMIENTO Y LA DIFERENCIACION DE LAS CELULAS DE CANCER DE SENO,ADEMAS, LA PREVALENCIA DE LOS EVENTOS DE TRANSICION DE FASE EN LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL Y LA REMODELACION DE LA CROMATINA SE ESTA VOLVIENDO INDISCUTIBLE, MEDIANTE ENFOQUES DE MICROSCOPIA EN VIVO, CATALINA ROMERO DESCUBRIO QUE EL RECEPTOR PASA DE UN ESTADO DIFUSO EN EL NUCLEOPLASMA A LA FORMACION DE CONDENSADOS NUCLEARES EN CUESTION DE MINUTOS TRAS LA ESTIMULACION HORMONAL, EN COLABORACION CON EL GRUPO DE XAVIER SALVATELLA (IRB, BARCELONA) DESCUBRIMOS QUE EL DOMINIO N-TERMINAL INTRINSECAMENTE DESORDENADO DE PGR FORMA GOTAS DE LIQUIDO IN VITRO, MEDIANTE EL USO DE INHIBIDORES DE PARYLATION Y ATP, TANTO IN VIVO COMO IN VITRO, ACTUALMENTE ESTAMOS INVESTIGANDO LOS EFECTOS DE ESAS VARIABLES EN LA TRANSICION DE FASE PR, POR ULTIMO, A TRAVES DE LA COLABORACION CON EL SINCROTRON ALBA, HEMOS COMENZADO A UTILIZAR LA TOMOGRAFIA DE RAYOS X CRIO-BLANDA CON MICROSCOPIA DE SUPER RESOLUCION STORM CORRELATIVA PARA ESTUDIAR LAS DIFERENTES FASES DE LA ORGANIZACION DE LA CROMATINA EN CELULAS CONGELADAS RAPIDAMENTE ANTES Y DESPUES DE LA HORMONA, EL OBJETIVO ES COMPLETAR ESTOS ESTUDIOS Y ANALIZAR LOS RESULTADOS EN EL CONTEXTO DE LOS CAMBIOS TOPOLOGICOS 3D CONOCIDOS DEL GENOMA ESTABLECIDOS MEDIANTE EL USO DE HI-C DE ALTA RESOLUCION Y TECNICAS RELACIONADAS PARA PROBAR LA IMPORTANCIA RELATIVA DE LA TOPOLOGIA DEL GENOMA Y LAS TRANSICIONES DE FASE EN LA RESPUESTA DE CELULAS A SEÑALES EXTERNAS, CANCER\TERAPEUTICOS\CROMATINA\ATP\REGULACION GENICA\GENOMA 3D\TRANSICION DE FASES\BIOMARCADORES\CELULAS MADRE CANCERIGENAS

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