Descripción del proyecto
LOS HONGOS FILAMENTOSOS EMPLEAN DISTINTAS FORMAS DE VIDA Y MODOS NUTRICIONALES PARA UTILIZAR UNA GRAN DIVERSIDAD DE NICHOS ECOLOGICOS, MUCHOS SON SAPROFITOS, Y SOLO VIVEN SOBRE MATERIA ORGANICA MUERTA O EN DESCOMPOSICION, MIENTRAS QUE OTROS SON PATOGENOS Y PRODUCEN ENFERMEDADES EN PLANTAS Y ANIMALES, NUESTRO OBJETIVO A LARGO PLAZO ES COMPRENDER LA GENETICA Y BASE EVOLUTIVA DE LAS DIFERENCIAS EN ESTILOS DE VIDA QUE PUEDEN ENCONTRARSE ENTRE LOS HONGOS, AL ENTENDER DICHAS DIFERENCIAS, PODREMOS IDENTIFICAR LOS FACTORES GENETICOS QUE SON SINGULARES DE LOS HONGOS PATOGENOS Y APLICAR ESTE CONOCIMIENTO AL DESARROLLO DE NUEVOS METODOS DE CONTROL DE LAS ENFERMEDADES CAUSADAS POR LOS HONGOS, EL ANALISIS COMPUTACIONAL HA MOSTRADO QUE LOS GENES QUE TIENEN UN PAPEL EN LAS INTERACCIONES PLANTA-PATOGENO MUESTRAN CON FRECUENCIA EVIDENCIAS DE UNA RAPIDA EVOLUCION, TALES COMO CAMBIOS RECIENTES EN EL NUMERO DE COPIAS DE LOS GENES Y UNA SELECCION DARWINIANA POSITIVA, ESTO SUGERIRIA A QUE LAS FAMILIAS DE GENES EVOLUCIONAN ACTIVAMENTE PARA QUE EL HONGO PUEDA ADAPTARSE A LOS CAMBIOS EN SU ENTORNO, LA PLANTA HUESPED, PROCESO CONOCIDO COMO EVOLUCION ADAPTATIVA, LLEVANDO A CABO UN ESTUDIO FILOGENOMICO A GRAN ESCALA DE LAS FAMILIAS DE GENES FUNGICOS Y COMBINANDOLO CON OTRAS FUENTES DE INFORMACION, TALES COMO LAS FUNCIONES GENICAS PREDICHAS Y LOS PATRONES DE TRANSCRIPCION DE LOS GENES, PODEMOS SUSTENTAR NUESTROS CONOCIMIENTOS SOBRE LA EVOLUCION DE LAS FAMILIAS DE GENES PARA FACILITAR ASI LA IDENTIFICACION DE AQUELLOS GENES QUE PUEDAN TENER ALGUN PAPEL EN LA INTERACCION PLANTA-HONGO, LOS TRES OBJETIVOS ESPECIFICOS DE ESTE PROYECTO SON: 1) IDENTIFICAR GENES DE HONGOS Y FAMILIAS DE GENES QUE MUESTREN EVIDENCIAS DE EVOLUCION ADAPTATIVA; 2) DESARROLLAR UNA BASE DE DATOS CENTRADA EN EL ESTUDIO DE LA EVOLUCION DE FAMILIAS DE GENES FUNGICOS; 3) COMBINAR EL CONOCIMIENTO DE LA BASE DE DATOS CON LOS PERFILES DE TRASCRIPCION DE UNA GENOTECA DE ADNC SUSTRAIDO DE HOJAS DE MAIZ INFECTADAS CON EL HONGO DE LA ANTRACNOSIS DEL MAIZ (COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA) PARA DESARROLLAR UNA LISTA DE GENES DIANA PARA EL ANALISIS FUNCIONAL, DESARROLLAREMOS TAMBIEN EL ANALISIS FUNCIONAL DE UN GRUPO DE LOS GENES DIANA PARA DEMOSTRAR SU PAPEL EN EL PROCESO DE LA ENFERMEDAD, EL RESULTADO DE ESTE PROYECTO LLEVARA A LA IDENTIFICACION DE NUEVAS DIANAS QUE PUEDEN SER UTILIZADAS PARA EL DESARROLLO DE NUEVAS ESTRATEGIAS DE CONTROL DE PATOGENOS QUE SEAN MENOS AGRESIVAS CON EL ENTORNO QUE LOS TRATAMIENTOS QUIMICOS ACTUALES, genética de hongos fitopatógenos\bioinformática\genómica comparada\filogenómica\evolución\interacción planta-hongo