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CTQ2009-08223

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ACOPLAMIENTO ENTRE DINAMICA Y CATALISIS EN LOS ENZIMAS. DESARROLLO DE METODOS Y...

ACOPLAMIENTO ENTRE DINAMICA Y CATALISIS EN LOS ENZIMAS. DESARROLLO DE METODOS Y ESTUDIO DE LA FAMILIA DE LA KINASA DE NAG Y DE LAS ALDOLASAS DE CLASE II. VARIAS TECNICAS EXPERIMENTALES RECIENTES HAN MOSTRADO QUE EXISTE UN ACOPLAMIENTO ENTRE LA DINAMICA Y LA CATALISIS EN LOS ENZIMAS, TODAVIA HAY MUCHAS CUESTIONES ABIERTAS SOBRE EL MECANISMO Y EL ALCANCE DE ESTE ACOPLAMIENTO, EN ESTA... ver más

01/01/2009

CSIC

41K€

Presupuesto del proyecto: 41K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2009-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 41K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto VARIAS TECNICAS EXPERIMENTALES RECIENTES HAN MOSTRADO QUE EXISTE UN ACOPLAMIENTO ENTRE LA DINAMICA Y LA CATALISIS EN LOS ENZIMAS, TODAVIA HAY MUCHAS CUESTIONES ABIERTAS SOBRE EL MECANISMO Y EL ALCANCE DE ESTE ACOPLAMIENTO, EN ESTA SOLICITUD, PROPONEMOS EL DESARROLLO E IMPLEMENTACION DE UN METODO COMPUTACIONAL Y EL ESTUDIO DE DOS FAMILIAS DE ENZIMAS DISTINTAS, LA FAMILIA DE LA KINASA DE NAG Y LAS ALDOLASAS DE CLASE II,IMPLEMENTAREMOS UN METODO QUE ENLACE LOS MODELOS GROSSO MODO CON LOS POTENCIALES QM/MM CON RESOLUCION ATOMICA, LOS PRIMEROS PERMITEN DESCRIBIR MOVIMIENTOS DE GRAN AMPLITUD EN PROTEINAS, MIENTRAS QUE LOS SEGUNDOS SON NECESARIOS PARA ESTUDIAR LA CATALISIS ENZIMATICA, NUESTRO METODO COMPLEMENTARA LAS TECNICAS EXPERIMENTALES DANDO UNA DESCRIPCION DETALLADA DE COMO SE ACOPLA LA ETAPA MAS RAPIDA, LA REACCION QUIMICA, CON PROCESOS MAS LENTOS, EN PARTICULAR, QUEREMOS ENTENDER COMO DISTINTAS CONFORMACIONES TIENEN DISTINTAS PROPIEDADES CATALITICAS, Y COMO LOS PARAMETROS MACROSCOPICOS SURGEN DE LA DINAMICA ENTRE ESTAS CONFORMACIONES, EL ENFOQUE COMPUTACIONAL SE BASARA EN UN MODELO MULTI-GRANULADO, USANDO ALGORITMOS TIPO INTERCAMBIO DE REPLICAS,TANTO LA FAMILIA DE LA KINASA DE NAG COMO LAS ALDOLASAS DE CLASE II HAN SIDO ESTUDIADAS MEDIANTE CRISTALOGRAFIA DE RAYOS X Y METODOS ENZIMOLOGICOS, AMBAS TECNICAS HAN MOSTRADO PRUEBAS QUE, EN ESTOS ENZIMAS, LOS MOVIMIENTOS DE GRAN AMPLITUD ESTAN ACOPLADOS A LA ETAPA CATALITICA, CATALISIS ENZIMATICA\DINAMICA DE PROTEINAS\METODOS COARSE-GRAINED\DINAMICA MOLECULAR\QUIMICA CUANITCA\QM/MM

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