FIS2008-03845
Financiado
SIMULACION DE PROCESOS REACTIVOS EN PROTEINAS Y ENZIMAS MEDIANTE METODOS DE DINAMICA MOLECULAR AB INITIO
EL DISEÑO DE PROTEINAS Y ENZIMAS CON PROPIEDADES CONTROLADAS (P,E, MAYOR O MENOR ACTIVIDAD), ASI COMO DE NUEVOS FARMACOS, ES UNO DE LOS MAYORES RETOS DE LA BIOLOGIA MOLECULAR ACTUAL, AUN ASI, LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE RIGEN M...
EL DISEÑO DE PROTEINAS Y ENZIMAS CON PROPIEDADES CONTROLADAS (P,E, MAYOR O MENOR ACTIVIDAD), ASI COMO DE NUEVOS FARMACOS, ES UNO DE LOS MAYORES RETOS DE LA BIOLOGIA MOLECULAR ACTUAL, AUN ASI, LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE RIGEN MUCHOS PROCESOS ENZIMATICOS SON TODAVIA UN MISTERIO, EL PRIMER OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES CONTRIBUIR A DESCIFRAR LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE RIGEN LA FUNCION DE ENZIMAS QUE SON FOCO DE ENORME INTERES EN BIOLOGIA MOLECULAR, YA QUE EL CONOCIMIENTO DE ESTOS MECANISMOS PUEDE CONTRIBUIR A MEJORAR LAS TERAPIAS ACTUALES CONTRA ALGUNAS ENFERMEDADES, EL SEGUNDO OBJETIVO ES EL DE CONSOLIDAR UNA NUEVA LINEA DE INVESTIGACION DEDICADA A LA SIMULACION AB INITIO DE PROCESOS BIOLOGICOS, NUESTRA INVESTIGACION SE PUEDE AGRUPAR EN CUATRO LINEAS PRINCIPALES, LAS DOS PRIMERAS (REACTIVIDAD DE CATALASAS Y PEROXIDASAS E INTERACCION ENZIMA-SUBSTRATO EN GLICOSIL HIDROLASAS) ESTAN MUY RELACIONADAS CON EL ANTERIOR PROYECTO FINANCIADO (FIS2005-00655), LAS OTRAS DOS LINEAS DE INVESTIGACION (MECANISMOS DE RECONOCIMIENTO DE SUBSTRATO EN ALDO-KETO REDUCTASAS Y ENLACE DE PEPTIDOS A NANOPARTICULAS DE ORO) SON NUEVAS, LA PRIMERA LINEA DE INVESTIGACION ESTA DEDICADA A DESCIFRAR LOS MECANISMOS ENZIMATICOS Y DE ACTIVACION DE FARMACOS EN CATALASA-PEROXIDASA, UNA ENZIMA BIFUNCIONAL INVOLUCRADA EN LA RESISTENCIA A LA TUBERCULOSIS, EN COMPARACION CON ENZIMAS MONOFUNCIONALES, EN LA SEGUNDA LINEA DE INVESTIGACION, PRETENDEMOS PREDECIR MODIFICACIONES ESPECIFICAS EN LAS ENZIMAS RESPONSABLES DE HIDROLIZAR Y ENSAMBLAR CARBOHIDRATOS (GLICOSIL HIDROLASAS Y TRANSFERASAS) QUE PUEDAN AFECTAR SU ACTIVIDAD CATALITICA, EN LA TERCERA LINEA DE INVESTIGACION, PRETENDEMOS DISEÑAR INHIBIDORES DE ALDO-KETO REDUCTASAS, CUYA IMPLICACION EN EL DESARROLLO DE ALGUNOS TIPOS DE CANCER HA SIDO DEMOSTRADA RECIENTEMENTE, FINALMENTE, LA CUARTA LINEA DE INVESTIGACION ESTA DEDICADA AL ANALISIS DE LA INTERACCION PEPTIDO-AZUFRE EN PEPTIDOS ENLAZADOS A NANOPARTICULAS DE ORO QUE SE USAN EN APLICACIONES BIOMEDICAS, LOS CALCULOS SE REALIZARAN MEDIANTE TECNICAS DE DINAMICA MOLECULAR AB INITIO (AIMD), INCLUYENDO EL METODOS DE METADINAMICA DESARROLLADO RECIENTEMENTE (LAIO Y PARRINELO, PNAS 2002) Y EL ENTORNO PROTEICO SERA TRATADO MEDIANTE LA APROXIMACION QM/MM, TODOS LOS PROYECTOS SE REALIZARAN EN COLABORACION CON GRUPOS EXPERIMENTALES PUNTEROS DE CRISTALOGRAFIA DE PROTEINAS Y BIOTECNOLOGIA [PROF, I, FITA, DEL INSTITUTO DE BIOMEDICINA DE BARCELONA (IRB); PROF, P, LOEWEN DE LA UNIV, DE MANITOBA, CANADA; PROF, A, PLANAS DEL INSTITUTO QUIMICO DE SARRIA-UNIV, RAMON LLULL, BARCELONA; PROF, X, PARES DE LA UNIV, AUTONOMA DE BARCELONA, Y PROF, E, GIRALT DEL IRB BARCELONA], Dinámica molecular ab initio\método Car-Parrinello\Teoria del Funcional de la Densidad\hemoproteínas\catálisis enzimática\glicosil hidrolasas\glicosil transferasas\aldo-keto reductasas\nanopartículas de oro
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2008-01-01
AEI
No se conoce la línea exacta de financiación, pero conocemos el organismo encargado de la revisión del proyecto.
Presupuesto
El presupuesto total del proyecto asciende a
91K€
Líder del proyecto
FUNDACIO PARC CIENTIFIC DE BARCELONA
No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
