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KE07-LDH

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Application of directed evolution to the study of structural enzyme dynamics

We propose to study the importance of structural dynamics to enzymatic catalysis. This will utilise simplified model systems in which a variety of catalytically distinct mutants have been generated though directed evolution. This... ver más

31/05/2011

CNRS

167K€

Presupuesto del proyecto: 167K€

Líder del proyecto

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo FP7 notifico la concesión del proyecto el día 2011-05-31 No tenemos la información de la convocatoria

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CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 167K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto We propose to study the importance of structural dynamics to enzymatic catalysis. This will utilise simplified model systems in which a variety of catalytically distinct mutants have been generated though directed evolution. This research will focus on whether changes to the conformational landscape of enzymes affect catalysis and how the structural scaffold can determine the optimum temperature for enzymatic activity. Two model systems will be used: (i) the lactate dehydrogenase family, chosen because it is the most heavily studied family with regards to thermophilicity; (ii) a designed Kemp elimination catalyst, chosen because it is the first example of an enzyme in which the evolution of the active site and structural scaffold has been decoupled. A synergistic experimental approach will be used to study the mutants generated through directed evolution: - Biophysics (temperature-controlled cryo-crystallography, incoherent neutron scattering, in-cristallo spectroscopy) and detailed data analysis (anisotropic and multiple crystallographic refinement) - Enzyme kinetics (temperature dependent kinetics and Arrhenius plots) - Computational simulation (normal mode analysis and molecular dynamics) This project will constitute, to our knowledge, one of the first attempts to apply directed evolution to the systematic analysis of the importance and evolution of pathways for dynamic conformational change in enzymatic catalysis.

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