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PID2021-127477OB-I00

Financiado

DESVELANDO LA GENOMICA DE LAS BACTERIAS ANAEROBIAS PROCEDENTES DE BACTERIEMIAS

LAS BACTERIAS ANAEROBIAS SON RESIDENTES PREDOMINANTES DE LA MICROBIOTA HUMANA, PERO TAMBIEN SE HALLAN ASOCIADAS CON INFECCIONES FOCALES O INVASIVAS Y BACTERIEMIA. EN NUMEROSAS OCASIONES, LOS ANAEROBIOS SON LOS MICROORGANISMOS QUE... ver más

01/01/2021

ISCIII

109K€

Presupuesto del proyecto: 109K€

Líder del proyecto

INSTITUTO DE SALUD CARLOS III (ISCIII) No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 23M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01

0% 100%

Participantes

ISCIII

Lider

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Líder del proyecto

INSTITUTO DE SALUD CARLOS III (ISCIII)

TRL 4-5 | 23M€

Presupuesto del proyecto 109K€

Descripción del proyecto LAS BACTERIAS ANAEROBIAS SON RESIDENTES PREDOMINANTES DE LA MICROBIOTA HUMANA, PERO TAMBIEN SE HALLAN ASOCIADAS CON INFECCIONES FOCALES O INVASIVAS Y BACTERIEMIA. EN NUMEROSAS OCASIONES, LOS ANAEROBIOS SON LOS MICROORGANISMOS QUE MAS PASAN DESAPERCIBIDOS EN MUESTRAS CLINICAS. LAS INFECCIONES POR ANAEROBIOS DEL TORRENTE SANGUINEO (BSIS, BLOODSTREAM INFECTIONS) PROVOCAN UNA ALTA MORBILIDAD Y MORTALIDAD (QUE OSCILAN ENTRE EL 15% Y EL 50%). EL RETRASO EN LA IDENTIFICACION DE ANAEROBIOS, DEBIDO A TIEMPOS DE RESPUESTA MAS LARGOS, A MENUDO CONDUCE A UN TRATAMIENTO EMPIRICO CON ANTIMICROBIANOS DE AMPLIO ESPECTRO (METRONIDAZOL, COMBINACIONES DE BETA-LACTAMICOS / INHIBIDORES DE BETA-LACTAMASAS Y CARBAPENEMICOS). LA RESISTENCIA A LOS ANTIMICROBIANOS (RAM) EMERGENTE JUNTO CON EL AUMENTO DE POBLACIONES VULNERABLES CONDUCE A UNA COBERTURA ANTIMICROBIANA INAPROPIADA QUE PUEDE RESULTAR EN UN FRACASO CLINICO.SE HA INFORMADO EN TODO EL MUNDO DE UNA RESISTENCIA CADA VEZ MAYOR PARA LOS ANAEROBIOS A TODAS LAS CLASES DE AGENTES ANTIMICROBIANOS. POR TANTO, NO SE PUEDE SUPONER UNA EFICACIA PREDECIBLE DE LA TERAPIA EMPIRICA. SE HA DEMOSTRADO QUE UNA GRAN VARIEDAD DE ESPECIES PERTENECIENTES A GENEROS ANAEROBICOS ESTRICTOS CAUSAN BSIS, SIENDO EL GRUPO BACTEROIDES FRAGILIS Y CLOSTRIDIUM SPP. LOS MAS FRECUENTES. EN EUROPA, SE HA INFORMADO DE TASAS CRECIENTES DE RAM: PARA BACTEROIDES / PARABACTEROIDES SPP. (A COMBINACIONES DE BETA-LACTAMICO/ INHIBIDOR DE BETA-LACTAMASAS, CLINDAMICINA, CARBAPENEMS Y METRONIDAZOL); PARA PREVOTELLA SPP. (A BETA-LACTAMICOS); PARA COCOS ANAEROBIOS GRAMPOSITIVOS (A CLINDAMICINA); Y PARA LAS ESPECIES DE CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE Y CLOSTRIDIUM SPP. (AL METRONIDAZOL).EN LA ACTUALIDAD, LA SECUENCIACION DEL GENOMA COMPLETO (WGS) ES LA TECNOLOGIA PREFERIDA PARA EL ESTUDIO DEL RESISTOMA Y VIRULOMA DE DIFERENTES PATOGENOS Y SU IDENTIFICACION. SIN EMBARGO, A DIFERENCIA DE QUE OCURRE CON LOS ORGANISMOS ESKAPE (ENTEROCOCCUS FAECIUM, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, ACINETOBACTER BAUMANNII, PSEUDOMONAS AERUGINOSA Y ENTEROBACTER SPP.), LA WGS SE HA APLICADO ESCASAMENTE AL ESTUDIO DE LOS ANAEROBIOS.EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO DESVELANDO LA GENOMICA DE LOS ANAEROBIOS PROCEDENTES DE BACTERIEMIAS ES ARROJAR ALGO DE LUZ SOBRE LA COMPLEJIDAD DE LAS BSIS PRODUCIDAS POR ANAEROBIOS. EXPLICAR LOS MECANISMOS DE RAM Y LOS ELEMENTOS GENETICOS MOVILES (SECUENCIAS DE INSERCION, TRANSPOSONES Y PLASMIDOS) Y CARACTERISTICAS DE VIRULENCIA, UTILIZANDO TECNOLOGIAS WGS Y MEDIANTE EL DISEÑO DE UNA PLATAFORMA ABIERTA ESPECIFICA PARA ANAEROBIOS (REVIANAEROBE, RESISTOMA Y VIRULOMA ANAEROBIO). REVIANAEROBE PERMITIRA A LOS USUARIOS CARGAR EL GENOMA ANAEROBIO Y DETECTAR LA RAM Y LOS RASGOS DE VIRULENCIA SUPERANDO LA LIMITADA INFORMACION PROPORCIONADA POR LAS PLATAFORMAS GENOMICAS HABITUALES, ENFOCADAS PRINCIPALMENTE A ORGANISMOS AEROBICOS MULTIRRESISTENTES TIPO ESKAPE Y A PATOGENOS HUMANOS CLASICOS, RESPECTIVAMENTE.OTROS OBJETIVOS SON: I) EL DISEÑO DE UN PANEL GENETICO RAPIDO BASADO EN PCR PARA DETECTAR GENES DE RAM QUE PUEDEN PROVOCAR FALLOS CLINICOS DEL TRATAMIENTO ANTIMICROBIANO DE LAS BSIS; II) LA DESCRIPCION DE NUEVAS ESPECIES / GENEROS DE ANAEROBIOS Y NUEVAS INFECCIONES MEDIANTE EL ANALISIS WGS; III) EL DESARROLLO DE UN ESQUEMA DE MULTILOCUS SEQUENCE TYPE BASADO EN EL GENOMA CORE (CGMLST) PARA BACTEROIDES, EL GENERO ANAEROBIO QUE MUESTRA EL NIVEL MAS ALTO DE RAM Y AFECTA AL MAYOR NUMERO DE MECANISMOS DE RESISTENCIA. ACTERIEMIA\NUEVAS INFECCIONES\NUEVAS ESPECIES\VIRULOMA\RESISTOMA\GENOMA\RESISTENCIA ANTIMICROBIANA\ANAEROBIOS

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