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PID2019-105805RB-I00

Financiado

UTILIZACION DE HERRAMIENTAS MASIVAS DE SECUENCIACION Y GENOTIPADO PARA EVALUAR E...

UTILIZACION DE HERRAMIENTAS MASIVAS DE SECUENCIACION Y GENOTIPADO PARA EVALUAR EL IMPACTO DE LA VARIACION GENETICA SOBRE FENOTIPOS LECHEROS Y DE VIABILIDAD EN GANADO CAPRINO EL PROYECTO CAPRASEQ ES, EN PARTE, CONTINUACION DEL PROYECTO CAPRAMUR (AGL2016-76108-R) Y ENGLOBA PERSONAL DE ORGANISMOS PUBLICOS DE INVESTIGACION (CENTRO DE INVESTIGACION AGRIGENOMICA, UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA Y UNIVERSI... ver más

01/01/2019

CENTRE RECERCA EN...

199K€

Presupuesto del proyecto: 199K€

Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01

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Participantes

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMI...

Lider

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Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB...

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 199K€

Descripción del proyecto EL PROYECTO CAPRASEQ ES, EN PARTE, CONTINUACION DEL PROYECTO CAPRAMUR (AGL2016-76108-R) Y ENGLOBA PERSONAL DE ORGANISMOS PUBLICOS DE INVESTIGACION (CENTRO DE INVESTIGACION AGRIGENOMICA, UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA Y UNIVERSIDAD DE CORDOBA) Y DE UNA EMPRESA DE BASE TECNOLOGICA DE LA UNIVERSIDAD DE CORDOBA (ANIMAL BREEDING CONSULTING), ADEMAS, CUENTA CON LA INESTIMABLE COLABORACION DE LA ASOCIACION NACIONAL DE CRIADORES DE CAPRINO DE RAZA MURCIANO-GRANADINA (CAPRIGRAN), EL PROYECTO CAPRASEQ SE DIVIDE EN CUATRO APARTADOS O GRUPOS DE TAREAS DISTINTOS, EN EL PROYECTO CAPRAMUR SE OBSERVO QUE MAS DE MIL GENES PRESENTABAN EXPRESION DIFERENCIAL EN LA GLANDULA MAMARIA CAPRINA LACTANTE Y SECA, EN EL APARTADO 1 DE CAPRASEQ, SE PRETENDE INVESTIGAR LOS ELEMENTOS FUNCIONALES QUE, MEDIANTE LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA, CONTRIBUYAN A EXPLICAR LA EXISTENCIA DE ESTA EXPRESION DIFERENCIAL, MEDIANTE DISTINTAS TECNICAS MOLECULARES SE ANALIZARA LA ACCESIBILIDAD DE LA CROMATINA (ATAC-SEQ) Y LA METILACION DEL ADN EXTRAIDOS DE MUESTRAS DE GLANDULA MAMARIA CAPRINA SECA Y LACTANTE, CON LAS MISMAS MUESTRAS, SE CARACTERIZARA TAMBIEN LOS PATRONES DE SPLICING DEL ARN MENSAJERO Y DE EXPRESION DE ARNS NO-CODIFICANTES ASOCIADOS A LA LACTACION, LA COMBINACION DE ESTOS DATOS OFRECERA UNA PERSPECTIVA MUY NOVEDOSA Y PROFUNDA SOBRE LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE REGULAN LA LACTACION, EN EL APARTADO 2 DE CAPRASEQ, SE REFINARA LA POSICION DE UN QTL IDENTIFICADO EN CAPRAMUR CON EFECTOS PLEIOTROPICOS SOBRE EL CONTENIDO DE PROTEINA, GRASA Y EXTRACTO SECO DE LA LECHE, PARA ELLO, SE GENERARA INFORMACION MASIVA SOBRE LA VARIACION GENETICA EXISTENTE DENTRO DE DICHO QTL Y SE CONSTRUIRA UN PANEL DE POLIMORFISMOS SELECCIONADOS DE ACUERDO A SU EFECTO FUNCIONAL ESPERADO Y SU COINCIDENCIA POSICIONAL CON LOS ELEMENTOS FUNCIONALES CARACTERIZADOS EN EL APARTADO 1, ESTE PANEL DE POLIMORFISMOS SE PODRIA USAR COMO UNA HERRAMIENTA PREDICTIVA DEL CONTENIDO DE PROTEINA, GRASA Y EXTRACTO SECO DE LA LECHE EN EL ESQUEMA DE MEJORA GENETICA DE LA RAZA MURCIANO-GRANADINA, EN EL APARTADO 3 DE CAPRASEQ, ESTA PREVISTO CARACTERIZAR, MEDIANTE SECUENCIACION GENOMICA, LA VARIACION GENETICA DELETEREA PRESENTE EN UN PANEL DE MACHOS REPRODUCTORES ASI COMO DE LAS HEMBRAS CON QUE SE HAN CRUZADO, POSTERIORMENTE, SE ANALIZARA UN PANEL DE MUTACIONES CON POSIBLES EFECTOS DELETEREOS EN LA DESCENDENCIA DE DICHOS INDIVIDUOS PARA OBSERVAR SI ALGUNA DE LAS MUTACIONES PRESENTA UN PATRON DE TRANSMISION ALTERADO, ESTA TAREA COMPLEMENTARIA LOS DATOS QUE YA SE ESTAN GENERANDO EN EL PROYECTO INTERNACIONAL VARGOATS CUYO OBJETIVO CONSISTE EN ESTUDIAR LA VARIACION GENETICA DE MAS DE UN MILLAR DE CABRAS CON UNA DISTRIBUCION MUNDIAL MEDIANTE EL ESTUDIO DE DATOS DE SECUENCIACION DEL GENOMA COMPLETO, FINALMENTE, EN EL APARTADO 4 DEL PROYECTO CAPRASEQ NOS PROPONEMOS ANALIZAR LA POSIBLE DETERMINACION GENETICA DE LA RESISTENCIA A DOS ENFERMEDADES DE GRAN IMPORTANCIA PARA LOS PRODUCTORES CAPRINOS: LA AGALAXIA CONTAGIOSA Y LA ARTRITIS-ENCEFALITIS CAPRINA, POR UN LADO, SE ANALIZARA LA PREVALENCIA DE ESTAS ENFERMEDADES EN LAS GRANJAS ASOCIADAS A CAPRIGRAN, PROPORCIONANDO UNA INFORMACION MUY VALIOSA PARA TOMAR MEDIDAS PREVENTIVAS QUE CONTRIBUYAN A FRENAR SU DIFUSION, POR OTRA PARTE, SE USARA LA APROXIMACION DEL ESTUDIO DE ASOCIACION DE GENOMA COMPLETO PARA IDENTIFICAR REGIONES DEL GENOMA CAPRINO ASOCIADAS A LA RESISTENCIA GENETICA A DICHAS PATOLOGIAS, ESTA LINEA DE INVESTIGACION RESULTA DEL MAYOR INTERES PARA CAPRIGRAN, CAPRINO\SECUENCIACION\MUTACION DELETEREA\QUANTITATIVE TRAIT LOCUS\RESISTENCIA GENETICA A PATOGENOS\EXPRESION GENICA\ELEMENTO FUNCIONAL

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