USO COMBINADO DE MARCADORES POLIMORFICOS DE EVOLUCION RAPIDA Y LENTA EN LA FILOG...
USO COMBINADO DE MARCADORES POLIMORFICOS DE EVOLUCION RAPIDA Y LENTA EN LA FILOGENIA DEL CROMOSOMA Y DE PEQUEÑOS RUMIANTES
EL ANALISIS DE LA DIVERSIDAD DEL CROMOSOMA Y HA DEMOSTRADO SU UTILIDAD PARA EL ESTABLECIMIENTO DE LAS RELACIONES FILOGENETICAS Y EVOLUTIVAS EN LA ESPECIE HUMANA, SIN EMBARGO, EN POBLACIONES ANIMALES, Y ESPECIALMENTE EN PEQUEÑOS RU...
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Descripción del proyecto
EL ANALISIS DE LA DIVERSIDAD DEL CROMOSOMA Y HA DEMOSTRADO SU UTILIDAD PARA EL ESTABLECIMIENTO DE LAS RELACIONES FILOGENETICAS Y EVOLUTIVAS EN LA ESPECIE HUMANA, SIN EMBARGO, EN POBLACIONES ANIMALES, Y ESPECIALMENTE EN PEQUEÑOS RUMIANTES, APENAS EXISTEN ESTUDIOS FILOGENETICOS BASADOS EN LA DIVERSIDAD GENETICA DEL CROMOSOMA Y, EL PRESENTE PROYECTO PRETENDE APROVECHAR LA EXPERIENCIA DEL GRUPO PROPONENTE, ACUMULADA EN LA EJECUCION DEL PROYECTO CGL2005-03761/BOS ¿IDENTIFICACION DE POLIMORFISMOS EN EL CROMOSOMA Y DE PEQUEÑOS RUMIANTES PARA SU UTILIZACION EN FILOGENIA¿ MEDIANTE UTILIZACION DE MARCADORES MICROSATELITES ESPECIFICOS DEL CROMOSOMA Y EN DIVERSAS ESPECIES DE GRANDES Y PEQUEÑOS RUMIANTES (GANADO OVINO Y CAPRINO), SE PRETENDE RESOLVER EL MAYOR PROBLEMA DE LOS MICROSATELITES ESPECIFICOS DEL CROMOSOMA Y QUE ES SU GRAN TASA DE MUTACION (APROXIMADAMENTE 1/500 AÑOS) LO QUE DA LUGAR A HOMOPLASIAS QUE DIFICULTAN EL ESTABLECIMIENTO DE RELACIONES FILOGENETICAS CLARAS Y EL CALCULO DE TIEMPOS DE DIVERGENCIA DENTRO Y ENTRE ESPECIES, PARA ELLO SE PRETENDE DETECTAR MUTACIONES PUNTUALES (SNPS) EN FRAGMENTOS DE ADN DE LA ZONA ESPECIFICA MASCULINA DE PEQUEÑOS RUMIANTES (MSY) QUE PUEDAN TENER UN ALTO SIGNIFICADO EVOLUTIVO UTILIZABLE EN FILOGENIA, TANTO EN SECUENCIAS CODIFICANTES COMO NO CODIFICANTES, ESTE OBJETIVO GENERAL SE COMPLEMENTARA CON LOS SIGUIENTES OBJETIVOS CONCRETOS: A) IDENTIFICACION DE SNPS EN SECUENCIAS CODIFICANTES DE FRAGMENTOS LOCALIZADOS EN LA ZONA MSY DE OVINOS, CAPRINOS Y BOVINOS (COMO CONTROL POSITIVO); B) IDENTIFICACION DE SNPS EN SECUENCIAS CODIFICANTES DE GENES LOCALIZADOS EN LA ZONA MSY,A PARTIR DE LAS SECUENCIAS HOMOLOGAS CONOCIDAS FUNDAMENTALMENTE EN LA ESPECIE HUMANA); C) DESARROLLO DE PROTOCOLOS DIAGNOSTICOS BASADOS EN RT-PCR ACOPLADA A SONDAS FLUORESCENTES PARA EL GENOTIPADO DE LOS SNPS IDENTIFICADOS EN LAS DIFERENTES ESPECIES DE PEQUEÑOS Y GRANDES RUMIANTES; D) EVALUAR LA POSIBILIDAD DE COMBINAR LA INFORMACION OBTENIDA MEDIANTE SNPS CON LA PROPORCIONADA POR LOS MICROSATELITES ESPECIFICOS MSY SELECCIONADOS PARA LAS ESPECIES ESTUDIADAS POR EL GRUPO INVESTIGADOR EN EL MARCO DEL PROYECTO CGL2005-03761/BOS; E) ESTABLECER RELACIONES FILOGENETICAS INTRA E INTER ESPECIFICAS EN LAS ESPECIES DE RUMIANTES ESTUDIADAS PARA LA CARACTERIZACION DEL FLUJO GENETICO PATERNO; Y F) ESTIMAR TIEMPOS DE DIVERGENCIA DE LAS LINEAS PATERNAS IDENTIFICADAS EN EL CROMOSOMA Y DE LAS DIFERENTES ESPECIES, Y ENTRE LOS CROMOSOMAS Y DE LAS DIFERENTES ESPECIES, ovino\caprino\cromosoma Y\filogenia\diversidad
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