Descripción del proyecto
LAS FILOGENIAS DE ESPECIES CERCANAS DE MAMIFEROS PUEDEN USARSE PARA COMPRENDER LA VARIABILIDAD GENETICA ASOCIADA A LOS PROCESOS DE ESPECIACION, ADEMAS, LOS ARBOLES DE GENES PUEDEN AYUDAR EN LA DELIMITACION DE ESPECIES, SIN EMBARGO, LOS PROCESOS ESTOCASTICOS DE SEPARACION INCOMPLETA DE LINAJES, QUE IMPLICAN LA FALTA DE MONOFILIA DE LAS ESPECIES PARA ALGUNOS GENES, HACE QUE SEA RECOMENDABLE EL USO DE VARIOS GENES PARA OBTENER EL ARBOL CORRECTO DE LAS ESPECIES, LOS GENES MITOCONDRIALES TIENEN UN GRAN PODER RESOLUTIVO, PERO SE COMPORTAN COMO UN SOLO GRUPO DE LIGAMIENTO, LO QUE HACE NECESARIO RECURRIR A GENES NUCLEARES SI SE QUIEREN MARCADORES MULTIPLES, A PESAR DEL CONOCIMIENTO DE LA SECUENCIA GENOMICA DE VARIOS MAMIFEROS, ACTUALMENTE TAN SOLO SE USAN EN FILOGENIAS DE MAMIFEROS UNOS POCOS MARCADORES NUCLEARES QUE, ADEMAS, NO SUELEN SER SUFICIENTEMENTE VARIABLES ENTRE ESPECIES CERCANAS, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS, EN PRIMER LUGAR, EXPLOTAR LA INFORMACION GENOMICA DE LOS MAMIFEROS CON EL FIN DE BUSCAR MARCADORES NUCLEARES RAPIDOS QUE SEAN UTILES EN FILOGENIA, PARA ELLO SELECCIONAREMOS, MEDIANTE EL ANALISIS COMPUTACIONAL DE LOS GENOMAS DISPONIBLES DE MAMIFEROS, UNOS 100 INTRONES DE EVOLUCION RAPIDA Y QUE, ADEMAS, SEAN DE COPIA UNICA, TENGAN UNA LONGITUD ADECUADA Y ESTEN RODEADOS DE EXONES QUE PERMITAN EL DISEÑO DE CEBADORES, ESTO PROPORCIONARA UNA VARIEDAD DE MARCADORES NUCLEARES PARA DIVERSOS TIPOS DE ESTUDIOS FILOGENETICOS, ADEMAS, AMPLIFICAREMOS CIERTO NUMERO DE ESTOS INTRONES EN UN PANEL DE MAMIFEROS DE MODO QUE PODAMOS COMPROBAR LA UNIVERSALIDAD DE LOS CEBADORES Y LA VARIABILIDAD DE LOS INTRONES, EN SEGUNDO LUGAR, SE ESTUDIARA LA UTILIDAD DE ESTOS INTRONES PARA ESTUDIOS FILOGENETICOS Y DE ESPECIACION EN UN GRUPO DE ESPECIES BIEN CONOCIDO, DONDE SE SECUENCIARAN VARIOS INTRONES, EN ESTA PARTE DEL PROYECTO SE ESTUDIARA COMO DIFIEREN LOS ARBOLES DE INTRONES CON RESPECTO AL ARBOL CONOCIDO DE LAS ESPECIES, AUNQUE LOS ARBOLES DE GENES SEAN DISTINTOS ENTRE SI POR EFECTOS ESTOCASTICOS POBLACIONALES, E INCLUSO NO SEAN MONOFILETICOS PARA CADA ESPECIE, APLICAREMOS TECNICAS FILOGENETICAS BASADAS EN LA TEORIA DE LA COALESCENCIA PARA EL CALCULO DEL ARBOL MAS VEROSIMIL DE ESPECIES, EN TERCER LUGAR, ANALIZAREMOS LAS DATACIONES MOLECULARES OBTENIDAS CON TECNICAS BASADAS EN LA COALESCENCIA A PARTIR DE LOS INTRONES MULTIPLES, filogenia\intrones\genómica\mamíferos\especiación\coalescencia